Protein–RNA interactions for Protein: J3QQ02

Gm2056, Predicted gene 2056, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm2056J3QQ02 Cecr2-202ENSMUST00000112686 9212 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Gm2056J3QQ02 F3-201ENSMUST00000029771 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Gm2056J3QQ02 2900097C17Rik-202ENSMUST00000192863 4915 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Gm2056J3QQ02 4731419I09Rik-201ENSMUST00000180791 2820 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Gm2056J3QQ02 Dcaf6-201ENSMUST00000027856 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Gm2056J3QQ02 Elmo3-202ENSMUST00000212033 2351 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Gm2056J3QQ02 Umad1-204ENSMUST00000159433 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Gm2056J3QQ02 Scarb2-201ENSMUST00000031377 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Gm2056J3QQ02 Tal1-203ENSMUST00000161601 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Gm2056J3QQ02 Ccdc94-201ENSMUST00000086869 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Gm2056J3QQ02 Ptpn6-201ENSMUST00000004377 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gm2056J3QQ02 Rai1-202ENSMUST00000090806 7217 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gm2056J3QQ02 Igbp1b-201ENSMUST00000054786 1456 ntAPPRIS P1 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gm2056J3QQ02 Serpinb6d-201ENSMUST00000059637 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gm2056J3QQ02 Ano6-201ENSMUST00000071874 4927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gm2056J3QQ02 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gm2056J3QQ02 Psph-201ENSMUST00000031399 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gm2056J3QQ02 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gm2056J3QQ02 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gm2056J3QQ02 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gm2056J3QQ02 Scarf1-201ENSMUST00000042808 2887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gm2056J3QQ02 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gm2056J3QQ02 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gm2056J3QQ02 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gm2056J3QQ02 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gm2056J3QQ02 Fbln1-201ENSMUST00000057410 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gm2056J3QQ02 Pdgfra-205ENSMUST00000201711 4088 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gm2056J3QQ02 Defa-ps4-201ENSMUST00000118021 183 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Gm2056J3QQ02 Gm36937-201ENSMUST00000192957 429 ntTSL 3 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gm2056J3QQ02 Gm7783-201ENSMUST00000204795 781 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Gm2056J3QQ02 Gm45720-201ENSMUST00000211881 484 ntTSL 3 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gm2056J3QQ02 Rfxank-203ENSMUST00000212320 1121 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gm2056J3QQ02 Dph3-201ENSMUST00000022461 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gm2056J3QQ02 Samd11-202ENSMUST00000217934 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gm2056J3QQ02 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gm2056J3QQ02 Inpp5a-202ENSMUST00000097975 2301 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gm2056J3QQ02 Gm16278-201ENSMUST00000148064 2071 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gm2056J3QQ02 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gm2056J3QQ02 Erich1-201ENSMUST00000110813 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gm2056J3QQ02 Taz-204ENSMUST00000124200 1742 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gm2056J3QQ02 Mpv17-201ENSMUST00000154241 1724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gm2056J3QQ02 Maged2-204ENSMUST00000112700 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gm2056J3QQ02 Gm5639-201ENSMUST00000122305 2403 ntBASIC12.33□□□□□ -0.43
Gm2056J3QQ02 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
Gm2056J3QQ02 Zfp276-201ENSMUST00000001092 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
Gm2056J3QQ02 Ppp3cb-205ENSMUST00000161445 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gm2056J3QQ02 Npepps-215ENSMUST00000167806 2307 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gm2056J3QQ02 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gm2056J3QQ02 Gulp1-203ENSMUST00000160854 1399 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gm2056J3QQ02 Nfkb1-206ENSMUST00000164430 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gm2056J3QQ02 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gm2056J3QQ02 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gm2056J3QQ02 Usp19-204ENSMUST00000178075 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gm2056J3QQ02 Usp19-202ENSMUST00000085044 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gm2056J3QQ02 Cops7b-202ENSMUST00000121534 5383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gm2056J3QQ02 Gm15370-201ENSMUST00000117158 253 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Gm2056J3QQ02 Gm16140-201ENSMUST00000117191 1060 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gm2056J3QQ02 Gm11637-201ENSMUST00000120601 592 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Gm2056J3QQ02 Gm15046-201ENSMUST00000130153 408 ntTSL 3 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gm2056J3QQ02 2410003L11Rik-202ENSMUST00000145262 642 ntTSL 3 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gm2056J3QQ02 Mmgt2-207ENSMUST00000155759 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gm2056J3QQ02 Gm23958-201ENSMUST00000157207 105 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Gm2056J3QQ02 Gm43758-201ENSMUST00000199500 367 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Gm2056J3QQ02 Gm44632-201ENSMUST00000207245 474 ntTSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gm2056J3QQ02 Galns-203ENSMUST00000212319 2111 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gm2056J3QQ02 Gm31992-201ENSMUST00000213387 862 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gm2056J3QQ02 Majin-201ENSMUST00000025699 1239 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gm2056J3QQ02 Rpl18a-201ENSMUST00000054220 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gm2056J3QQ02 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gm2056J3QQ02 Nfatc4-201ENSMUST00000024179 3267 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gm2056J3QQ02 Abat-203ENSMUST00000115839 2414 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gm2056J3QQ02 Alox12e-201ENSMUST00000019051 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gm2056J3QQ02 Ntng1-208ENSMUST00000133268 5587 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gm2056J3QQ02 Rab3a-203ENSMUST00000110092 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gm2056J3QQ02 Gemin2-201ENSMUST00000021379 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gm2056J3QQ02 Nup98-206ENSMUST00000211235 3748 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gm2056J3QQ02 Ccdc92b-201ENSMUST00000100866 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gm2056J3QQ02 Ptpru-203ENSMUST00000105987 5484 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gm2056J3QQ02 Rassf5-201ENSMUST00000027688 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gm2056J3QQ02 Camk4-201ENSMUST00000042868 12331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gm2056J3QQ02 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gm2056J3QQ02 Gm36995-201ENSMUST00000126170 5727 ntTSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gm2056J3QQ02 Gm8793-201ENSMUST00000183069 1303 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Gm2056J3QQ02 Arhgap11a-203ENSMUST00000110948 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gm2056J3QQ02 Wwox-203ENSMUST00000109108 1771 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gm2056J3QQ02 Foxred2-202ENSMUST00000117725 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gm2056J3QQ02 Nrd1-201ENSMUST00000065977 4311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gm2056J3QQ02 Pbrm1-203ENSMUST00000052239 5065 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gm2056J3QQ02 Psd2-206ENSMUST00000177432 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gm2056J3QQ02 Tgm6-201ENSMUST00000028888 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gm2056J3QQ02 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gm2056J3QQ02 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gm2056J3QQ02 Gm5124-201ENSMUST00000127554 1970 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gm2056J3QQ02 Ythdf2-203ENSMUST00000152796 4129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gm2056J3QQ02 Bhmt2-201ENSMUST00000015941 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gm2056J3QQ02 Lrrc29-203ENSMUST00000210412 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gm2056J3QQ02 Pfkfb3-203ENSMUST00000100411 2008 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gm2056J3QQ02 Rasd2-202ENSMUST00000139848 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gm2056J3QQ02 Dnaaf1-201ENSMUST00000093100 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gm2056J3QQ02 Il7-205ENSMUST00000194279 4858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms