Protein–RNA interactions for Protein: J3QP49

Gm20795, Predicted gene, 20795, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20795J3QP49 Cd163l1-204ENSMUST00000209637 3210 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm20795J3QP49 Grin1-205ENSMUST00000114312 3838 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm20795J3QP49 Grin1-207ENSMUST00000114317 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm20795J3QP49 Cyb561d1-201ENSMUST00000065664 4058 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm20795J3QP49 Jarid2-201ENSMUST00000044608 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm20795J3QP49 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm20795J3QP49 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm20795J3QP49 Cox16-202ENSMUST00000110340 668 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm20795J3QP49 Capn3-205ENSMUST00000110719 2778 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm20795J3QP49 Pax6-203ENSMUST00000111082 3116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm20795J3QP49 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm20795J3QP49 Rgs12-207ENSMUST00000114285 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm20795J3QP49 Nrf1-209ENSMUST00000115209 2406 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm20795J3QP49 Kpna7-203ENSMUST00000116454 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm20795J3QP49 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm20795J3QP49 Gm12537-201ENSMUST00000119266 1002 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm20795J3QP49 Gm12070-201ENSMUST00000119551 1002 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm20795J3QP49 Gm12671-201ENSMUST00000119978 1002 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm20795J3QP49 Gm13292-201ENSMUST00000120014 1000 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm20795J3QP49 Gm12403-201ENSMUST00000121384 959 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm20795J3QP49 Gm13070-201ENSMUST00000146532 768 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm20795J3QP49 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm20795J3QP49 Tnk1-201ENSMUST00000001626 2778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm20795J3QP49 Gm10359-201ENSMUST00000180167 1002 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm20795J3QP49 Gm12033-201ENSMUST00000180654 1002 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm20795J3QP49 Gm5559-201ENSMUST00000180755 1002 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm20795J3QP49 Gm4335-201ENSMUST00000182581 1004 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm20795J3QP49 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm20795J3QP49 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm20795J3QP49 Ralgps2-209ENSMUST00000189316 2924 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm20795J3QP49 Zfp433-202ENSMUST00000200889 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm20795J3QP49 Gm32687-201ENSMUST00000220314 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm20795J3QP49 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm20795J3QP49 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm20795J3QP49 Tspan32-202ENSMUST00000075172 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm20795J3QP49 Zfp82-201ENSMUST00000080834 2181 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm20795J3QP49 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm20795J3QP49 Dmbt1-201ENSMUST00000084509 6243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm20795J3QP49 Kdm5c-201ENSMUST00000082177 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm20795J3QP49 Fam177a-201ENSMUST00000177768 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm20795J3QP49 Itgb4-204ENSMUST00000106460 5919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm20795J3QP49 Cux1-204ENSMUST00000175975 10945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm20795J3QP49 Zfp961-202ENSMUST00000131237 2689 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm20795J3QP49 Pdp1-205ENSMUST00000108301 2635 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm20795J3QP49 4930563D23Rik-201ENSMUST00000062638 2646 ntAPPRIS P1 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm20795J3QP49 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm20795J3QP49 Reps2-201ENSMUST00000101102 7630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm20795J3QP49 Atxn10-201ENSMUST00000163242 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm20795J3QP49 Apol6-206ENSMUST00000149569 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm20795J3QP49 Gm43721-201ENSMUST00000199677 2313 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm20795J3QP49 Dnajc14-207ENSMUST00000219508 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm20795J3QP49 Slc23a4-201ENSMUST00000044387 2175 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm20795J3QP49 Sun2-201ENSMUST00000046259 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm20795J3QP49 Adcyap1r1-201ENSMUST00000070736 3695 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm20795J3QP49 Entpd4-206ENSMUST00000184973 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm20795J3QP49 Entpd4b-204ENSMUST00000185072 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm20795J3QP49 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm20795J3QP49 Kcnv2-201ENSMUST00000056708 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm20795J3QP49 Car3-201ENSMUST00000029076 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm20795J3QP49 Lipe-208ENSMUST00000206861 3171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm20795J3QP49 Rgs6-222ENSMUST00000202210 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm20795J3QP49 Bcl11a-201ENSMUST00000000881 3061 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
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Gm20795J3QP49 Cd72-201ENSMUST00000030179 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm20795J3QP49 Stx17-201ENSMUST00000064765 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
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Gm20795J3QP49 Dab2ip-209ENSMUST00000135741 4128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm20795J3QP49 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm20795J3QP49 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm20795J3QP49 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm20795J3QP49 Haus7-201ENSMUST00000033737 1380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm20795J3QP49 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm20795J3QP49 Bdnf-205ENSMUST00000111045 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm20795J3QP49 Aknad1-202ENSMUST00000133931 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm20795J3QP49 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm20795J3QP49 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm20795J3QP49 1700061E18Rik-201ENSMUST00000154159 588 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm20795J3QP49 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm20795J3QP49 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm20795J3QP49 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm20795J3QP49 Gm19184-201ENSMUST00000196798 928 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm20795J3QP49 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm20795J3QP49 AC154276.1-201ENSMUST00000228874 1299 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm20795J3QP49 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm20795J3QP49 Gemin4-201ENSMUST00000102500 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm20795J3QP49 Ppp2r2b-202ENSMUST00000117687 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm20795J3QP49 F830212C03Rik-201ENSMUST00000191701 2285 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm20795J3QP49 Smad4-202ENSMUST00000114939 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm20795J3QP49 Ppp2r2b-203ENSMUST00000120632 2081 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm20795J3QP49 Sec23b-201ENSMUST00000028916 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm20795J3QP49 Polm-202ENSMUST00000109837 2697 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm20795J3QP49 2010315B03Rik-202ENSMUST00000177714 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm20795J3QP49 Smc4-201ENSMUST00000042901 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm20795J3QP49 Acacb-201ENSMUST00000031583 8482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm20795J3QP49 Gga3-201ENSMUST00000019135 3816 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm20795J3QP49 Pcdhb16-201ENSMUST00000051442 5225 ntAPPRIS P1 BASIC10.18□□□□□ -0.78
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