Protein–RNA interactions for Protein: J3QMY9

Top6bl, Type 2 DNA topoisomerase 6 subunit B-like, mousemouse

Predictions only

Length 579 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top6blJ3QMY9 Dnajb4-201ENSMUST00000029669 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Top6blJ3QMY9 Evi5l-203ENSMUST00000176149 3938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Top6blJ3QMY9 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Top6blJ3QMY9 Wsb2-202ENSMUST00000111959 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Top6blJ3QMY9 Zbtb2-202ENSMUST00000100078 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Top6blJ3QMY9 Gm14921-201ENSMUST00000118643 908 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Top6blJ3QMY9 Gm9431-201ENSMUST00000119765 1051 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Top6blJ3QMY9 Dlx1as-202ENSMUST00000137251 647 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Top6blJ3QMY9 A330102I10Rik-202ENSMUST00000140415 682 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Top6blJ3QMY9 Gm13850-201ENSMUST00000140465 623 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Top6blJ3QMY9 Ndufa2-201ENSMUST00000014438 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Top6blJ3QMY9 Gm17420-201ENSMUST00000164753 153 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Top6blJ3QMY9 Gm17180-201ENSMUST00000172211 435 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Top6blJ3QMY9 1600014C10Rik-203ENSMUST00000177983 403 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Top6blJ3QMY9 Hmgcll1-207ENSMUST00000183979 1136 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Top6blJ3QMY9 Gm38002-201ENSMUST00000193255 180 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Top6blJ3QMY9 Gm43630-201ENSMUST00000201550 776 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Top6blJ3QMY9 Gm18584-201ENSMUST00000203098 964 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Top6blJ3QMY9 Gm10478-201ENSMUST00000084451 396 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Top6blJ3QMY9 Gga3-202ENSMUST00000106508 3582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Top6blJ3QMY9 Dus2-201ENSMUST00000034375 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Top6blJ3QMY9 Cutal-201ENSMUST00000028228 2179 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Top6blJ3QMY9 2900069G24Rik-201ENSMUST00000192780 1311 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Top6blJ3QMY9 Adtrp-202ENSMUST00000121404 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Top6blJ3QMY9 Prnd-203ENSMUST00000110171 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Top6blJ3QMY9 Emc7-201ENSMUST00000069747 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Top6blJ3QMY9 Gm16853-201ENSMUST00000181812 1986 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Top6blJ3QMY9 Gm20149-201ENSMUST00000214691 1667 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Top6blJ3QMY9 Ythdf2-203ENSMUST00000152796 4129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Top6blJ3QMY9 Zbtb39-201ENSMUST00000054287 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Top6blJ3QMY9 Gm13003-201ENSMUST00000151040 2904 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Top6blJ3QMY9 Gm5422-202ENSMUST00000216161 2928 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Top6blJ3QMY9 Zbtb49-202ENSMUST00000114113 2645 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Top6blJ3QMY9 Clec11a-201ENSMUST00000004587 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Top6blJ3QMY9 Gnas-204ENSMUST00000087877 3947 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Top6blJ3QMY9 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Top6blJ3QMY9 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Top6blJ3QMY9 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Top6blJ3QMY9 1700128E19Rik-201ENSMUST00000134409 2439 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Top6blJ3QMY9 Gm15477-201ENSMUST00000140578 2130 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Top6blJ3QMY9 Polr2a-202ENSMUST00000071213 5799 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Top6blJ3QMY9 Ppox-201ENSMUST00000073120 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Top6blJ3QMY9 Lctl-201ENSMUST00000034969 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Top6blJ3QMY9 Rtn4rl1-201ENSMUST00000102514 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Top6blJ3QMY9 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Top6blJ3QMY9 Fchsd1-201ENSMUST00000043437 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Top6blJ3QMY9 Ccdc25-201ENSMUST00000022614 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Top6blJ3QMY9 Dnaaf2-201ENSMUST00000021356 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Top6blJ3QMY9 Polr3e-202ENSMUST00000106483 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Top6blJ3QMY9 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Top6blJ3QMY9 AC153366.2-201ENSMUST00000219461 1984 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Top6blJ3QMY9 Cadps2-209ENSMUST00000142913 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Top6blJ3QMY9 3110009E18Rik-203ENSMUST00000112644 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Top6blJ3QMY9 6330418K02Rik-201ENSMUST00000124298 743 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Top6blJ3QMY9 Gm12843-201ENSMUST00000137607 601 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Top6blJ3QMY9 2010310C07Rik-202ENSMUST00000190889 842 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Top6blJ3QMY9 Gm18054-201ENSMUST00000207539 555 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Top6blJ3QMY9 AC133598.1-201ENSMUST00000224327 660 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Top6blJ3QMY9 AC125350.2-201ENSMUST00000224737 727 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Top6blJ3QMY9 AC154462.2-201ENSMUST00000227519 370 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Top6blJ3QMY9 Nudt22-201ENSMUST00000041686 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Top6blJ3QMY9 Krtap19-2-201ENSMUST00000076186 605 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Top6blJ3QMY9 Ndufa3-201ENSMUST00000076657 515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Top6blJ3QMY9 Plekha2-204ENSMUST00000128715 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Top6blJ3QMY9 Gtf2ird1-209ENSMUST00000171794 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Top6blJ3QMY9 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Top6blJ3QMY9 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Top6blJ3QMY9 Gm42863-201ENSMUST00000197875 2958 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Top6blJ3QMY9 Kcnt1-211ENSMUST00000171268 3771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Top6blJ3QMY9 Dct-201ENSMUST00000022725 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Top6blJ3QMY9 Olfr56-204ENSMUST00000203149 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Top6blJ3QMY9 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Top6blJ3QMY9 Gm37644-201ENSMUST00000192190 2270 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Top6blJ3QMY9 Ficd-201ENSMUST00000065698 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Top6blJ3QMY9 Pnck-203ENSMUST00000114473 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Top6blJ3QMY9 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Top6blJ3QMY9 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Top6blJ3QMY9 Mcm8-201ENSMUST00000028831 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Top6blJ3QMY9 Cacna1g-209ENSMUST00000107791 8002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Top6blJ3QMY9 Tle6-201ENSMUST00000072020 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Top6blJ3QMY9 Akp-ps1-201ENSMUST00000188050 1600 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Top6blJ3QMY9 Gcom1-201ENSMUST00000163998 1726 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Top6blJ3QMY9 Gm26519-201ENSMUST00000181193 2249 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Top6blJ3QMY9 D6Ertd527e-203ENSMUST00000203747 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Top6blJ3QMY9 Ckm-203ENSMUST00000208710 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Top6blJ3QMY9 Hid1-201ENSMUST00000044152 3236 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Top6blJ3QMY9 Atp5d-202ENSMUST00000105366 781 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Top6blJ3QMY9 Mrps17-205ENSMUST00000119985 859 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Top6blJ3QMY9 Gm12329-201ENSMUST00000120829 1007 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Top6blJ3QMY9 Hmga2-203ENSMUST00000159699 3810 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Top6blJ3QMY9 Gm27572-201ENSMUST00000183702 255 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Top6blJ3QMY9 Mt3-203ENSMUST00000211930 477 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Top6blJ3QMY9 Gm45880-201ENSMUST00000213041 853 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Top6blJ3QMY9 Rpl29-201ENSMUST00000059802 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Top6blJ3QMY9 Thap2-202ENSMUST00000218842 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Top6blJ3QMY9 Cab39-201ENSMUST00000097666 2369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Top6blJ3QMY9 2310026I22Rik-201ENSMUST00000180941 1300 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Top6blJ3QMY9 Osgepl1-201ENSMUST00000027265 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Top6blJ3QMY9 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Top6blJ3QMY9 Gart-201ENSMUST00000023684 3518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30 ms