Protein–RNA interactions for Protein: J3QM54

Gm3727, Predicted gene 3727, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Gm3727J3QM54 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
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Gm3727J3QM54 Wwox-203ENSMUST00000109108 1771 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
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Gm3727J3QM54 Pparg-204ENSMUST00000203732 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm3727J3QM54 Pdp1-205ENSMUST00000108301 2635 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm3727J3QM54 Tspan32-202ENSMUST00000075172 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm3727J3QM54 Ncoa3-202ENSMUST00000109252 5757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm3727J3QM54 Abca7-201ENSMUST00000043866 6590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm3727J3QM54 1110046J04Rik-202ENSMUST00000180906 2776 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
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Gm3727J3QM54 Acoxl-201ENSMUST00000028859 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm3727J3QM54 Atp1b2-201ENSMUST00000047889 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm3727J3QM54 Lta4h-201ENSMUST00000016033 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm3727J3QM54 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm3727J3QM54 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.5 ms