Protein–RNA interactions for Protein: J3QK38

Gm21244, MCG116195, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21244J3QK38 Rin2-202ENSMUST00000110005 4641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm21244J3QK38 Aifm3-201ENSMUST00000023448 2688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm21244J3QK38 Mif4gd-202ENSMUST00000106506 993 ntTSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm21244J3QK38 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm21244J3QK38 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm21244J3QK38 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm21244J3QK38 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm21244J3QK38 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm21244J3QK38 Gm42863-201ENSMUST00000197875 2958 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm21244J3QK38 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm21244J3QK38 Mpv17-209ENSMUST00000202241 903 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm21244J3QK38 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm21244J3QK38 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm21244J3QK38 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm21244J3QK38 S100a8-201ENSMUST00000069927 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm21244J3QK38 Ubqln1-202ENSMUST00000076454 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm21244J3QK38 Cpa1-201ENSMUST00000031806 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm21244J3QK38 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm21244J3QK38 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm21244J3QK38 Slc29a1-203ENSMUST00000097317 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm21244J3QK38 Cacna1c-201ENSMUST00000075591 7584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm21244J3QK38 Rbm39-203ENSMUST00000109587 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm21244J3QK38 Usp24-201ENSMUST00000094933 10575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm21244J3QK38 Cyth2-208ENSMUST00000211783 1983 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm21244J3QK38 Gm8798-201ENSMUST00000211877 1661 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm21244J3QK38 Prpf19-203ENSMUST00000179297 6035 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm21244J3QK38 Hars2-201ENSMUST00000019287 2002 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm21244J3QK38 Fancc-218ENSMUST00000220684 2006 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm21244J3QK38 Sptbn2-201ENSMUST00000008991 8251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm21244J3QK38 Xkr8-201ENSMUST00000045550 4245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm21244J3QK38 Tfe3-203ENSMUST00000101695 2989 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm21244J3QK38 CT025678.1-201ENSMUST00000214795 2972 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm21244J3QK38 Psen1-201ENSMUST00000041806 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm21244J3QK38 Zbtb7b-202ENSMUST00000107432 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm21244J3QK38 Col14a1-201ENSMUST00000023053 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm21244J3QK38 Rap1gds1-202ENSMUST00000098574 3669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm21244J3QK38 Poc1b-203ENSMUST00000159228 1799 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm21244J3QK38 Rubcn-202ENSMUST00000089684 5311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm21244J3QK38 Fam214b-201ENSMUST00000036462 3074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm21244J3QK38 Kpna1-201ENSMUST00000004054 5039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm21244J3QK38 Lrrc74b-201ENSMUST00000023442 2135 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm21244J3QK38 Tekt2-201ENSMUST00000030658 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm21244J3QK38 Sorbs3-202ENSMUST00000227259 2481 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm21244J3QK38 Etv3-205ENSMUST00000170036 5127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm21244J3QK38 Hoxd10-201ENSMUST00000061745 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm21244J3QK38 Tcf4-226ENSMUST00000201094 2172 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm21244J3QK38 Rtn4rl1-201ENSMUST00000102514 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm21244J3QK38 Dmbt1-201ENSMUST00000084509 6243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm21244J3QK38 Pprc1-201ENSMUST00000062322 5205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm21244J3QK38 Sema4a-202ENSMUST00000107531 2897 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm21244J3QK38 Ate1-204ENSMUST00000178534 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm21244J3QK38 Epb41l2-204ENSMUST00000217929 3621 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm21244J3QK38 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm21244J3QK38 Ambra1-204ENSMUST00000111316 5063 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm21244J3QK38 Gm9025-201ENSMUST00000122415 1575 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm21244J3QK38 Jmjd8-205ENSMUST00000133595 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm21244J3QK38 A630014C17Rik-201ENSMUST00000150973 2984 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm21244J3QK38 Gm4780-202ENSMUST00000215200 2644 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm21244J3QK38 AC113060.1-201ENSMUST00000225689 1573 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm21244J3QK38 Kif26b-201ENSMUST00000160789 6216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm21244J3QK38 Jrk-201ENSMUST00000050234 5853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm21244J3QK38 Gpr26-201ENSMUST00000045840 11571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm21244J3QK38 Senp3-201ENSMUST00000005336 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm21244J3QK38 Abca7-202ENSMUST00000132517 6696 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm21244J3QK38 Kif3b-201ENSMUST00000028977 5635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm21244J3QK38 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm21244J3QK38 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm21244J3QK38 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm21244J3QK38 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm21244J3QK38 Dkkl1-204ENSMUST00000210741 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm21244J3QK38 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm21244J3QK38 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm21244J3QK38 4921507P07Rik-201ENSMUST00000031852 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm21244J3QK38 BC027072-201ENSMUST00000057405 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm21244J3QK38 Oprm1-205ENSMUST00000078634 1695 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm21244J3QK38 Acer1-201ENSMUST00000056113 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm21244J3QK38 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm21244J3QK38 Gm28323-201ENSMUST00000186817 2499 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm21244J3QK38 Gpat3-201ENSMUST00000031255 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm21244J3QK38 Kdm2b-202ENSMUST00000046073 5180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm21244J3QK38 Cdc37l1-208ENSMUST00000225310 4079 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm21244J3QK38 Plk-ps1-201ENSMUST00000119494 1787 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm21244J3QK38 AC241621.2-201ENSMUST00000223991 2151 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm21244J3QK38 A730020E08Rik-201ENSMUST00000180421 3387 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm21244J3QK38 Vill-203ENSMUST00000126251 1411 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm21244J3QK38 Tmem132a-202ENSMUST00000120524 3895 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm21244J3QK38 Pxn-202ENSMUST00000086523 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm21244J3QK38 Cyth1-201ENSMUST00000017276 3135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm21244J3QK38 Dus2-201ENSMUST00000034375 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm21244J3QK38 Vps29-208ENSMUST00000155671 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm21244J3QK38 Gnb2-202ENSMUST00000111020 1470 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm21244J3QK38 Ptpru-201ENSMUST00000030741 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm21244J3QK38 Abcd1-202ENSMUST00000114461 2323 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm21244J3QK38 Gba-202ENSMUST00000167998 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm21244J3QK38 Acin1-202ENSMUST00000022794 2365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm21244J3QK38 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm21244J3QK38 Tenm3-201ENSMUST00000033965 8961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm21244J3QK38 Actn1-201ENSMUST00000021554 3734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm21244J3QK38 Ntng1-208ENSMUST00000133268 5587 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm21244J3QK38 Gm15336-201ENSMUST00000128894 1571 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.5 ms