Protein–RNA interactions for Protein: J3KML6

Gm20830, Predicted gene, 20830, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20830J3KML6 Arhgap22-202ENSMUST00000111956 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm20830J3KML6 B4galnt3-203ENSMUST00000212457 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm20830J3KML6 2810403A07Rik-201ENSMUST00000029696 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm20830J3KML6 Acer1-201ENSMUST00000056113 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm20830J3KML6 Thtpa-201ENSMUST00000050575 2830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm20830J3KML6 AC122371.1-201ENSMUST00000220876 1477 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm20830J3KML6 Rpl9-204ENSMUST00000127874 2690 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm20830J3KML6 Pdik1l-201ENSMUST00000061234 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm20830J3KML6 Cidec-201ENSMUST00000032416 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm20830J3KML6 Cyth1-204ENSMUST00000106305 3179 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm20830J3KML6 Phrf1-202ENSMUST00000122143 4864 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm20830J3KML6 Pex5-205ENSMUST00000112532 3148 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm20830J3KML6 Kdm2a-201ENSMUST00000047898 8578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm20830J3KML6 Wnt7b-201ENSMUST00000023015 3371 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm20830J3KML6 AC096628.2-201ENSMUST00000225443 1413 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm20830J3KML6 Armcx1-201ENSMUST00000035748 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm20830J3KML6 Creb3l2-201ENSMUST00000041093 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm20830J3KML6 Arid5a-204ENSMUST00000115032 4640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm20830J3KML6 Cyb561d1-202ENSMUST00000106654 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm20830J3KML6 Slc29a1-203ENSMUST00000097317 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm20830J3KML6 Fam214b-201ENSMUST00000036462 3074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm20830J3KML6 Scyl2-201ENSMUST00000092227 3566 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm20830J3KML6 Nrf1-209ENSMUST00000115209 2406 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm20830J3KML6 Selenoh-203ENSMUST00000117299 747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm20830J3KML6 Gm11400-201ENSMUST00000120853 1214 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm20830J3KML6 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm20830J3KML6 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm20830J3KML6 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm20830J3KML6 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm20830J3KML6 Gm42550-201ENSMUST00000201553 960 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm20830J3KML6 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm20830J3KML6 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm20830J3KML6 Gorasp1-201ENSMUST00000035099 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm20830J3KML6 Ank3-201ENSMUST00000047061 2517 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm20830J3KML6 Bcl6-201ENSMUST00000023151 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm20830J3KML6 Rhbdd3-203ENSMUST00000109878 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm20830J3KML6 Lmntd1-201ENSMUST00000111706 2350 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm20830J3KML6 Pdxdc1-204ENSMUST00000115804 2880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm20830J3KML6 Cacna1g-205ENSMUST00000107786 7984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm20830J3KML6 Sun2-202ENSMUST00000089311 3709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm20830J3KML6 Abcb6-201ENSMUST00000027396 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm20830J3KML6 Mest-211ENSMUST00000163949 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm20830J3KML6 Pdlim5-201ENSMUST00000029941 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm20830J3KML6 Gm43045-201ENSMUST00000198725 2095 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm20830J3KML6 Eps15l1-203ENSMUST00000212121 2686 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm20830J3KML6 Arid5a-203ENSMUST00000115031 3002 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm20830J3KML6 Nt5c3b-203ENSMUST00000107397 1348 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm20830J3KML6 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm20830J3KML6 Tspan13-201ENSMUST00000020896 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm20830J3KML6 Tgm1-202ENSMUST00000168729 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm20830J3KML6 Armc7-201ENSMUST00000035240 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm20830J3KML6 Cxadr-202ENSMUST00000114229 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm20830J3KML6 March7-203ENSMUST00000102748 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm20830J3KML6 Zfp954-201ENSMUST00000056246 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm20830J3KML6 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm20830J3KML6 4933406P04Rik-201ENSMUST00000092680 1789 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm20830J3KML6 Pcdhb22-202ENSMUST00000192409 6609 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm20830J3KML6 Psd2-205ENSMUST00000176873 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm20830J3KML6 Dnm1-202ENSMUST00000091089 3764 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm20830J3KML6 Kif1a-210ENSMUST00000190723 6141 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm20830J3KML6 Irf8-201ENSMUST00000047737 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm20830J3KML6 Gm3052-202ENSMUST00000188254 2224 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm20830J3KML6 Kcnc2-204ENSMUST00000219301 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm20830J3KML6 Fgd3-203ENSMUST00000110087 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm20830J3KML6 Zfp41-201ENSMUST00000054555 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm20830J3KML6 Rapgef3-217ENSMUST00000177352 3395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm20830J3KML6 Hpcal4-202ENSMUST00000106246 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm20830J3KML6 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm20830J3KML6 Kmt5b-207ENSMUST00000113974 4150 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm20830J3KML6 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm20830J3KML6 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm20830J3KML6 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm20830J3KML6 Dip2a-202ENSMUST00000105417 6383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm20830J3KML6 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm20830J3KML6 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm20830J3KML6 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm20830J3KML6 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm20830J3KML6 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm20830J3KML6 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm20830J3KML6 Fcrl1-204ENSMUST00000191666 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm20830J3KML6 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm20830J3KML6 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm20830J3KML6 AC154276.1-201ENSMUST00000228874 1299 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm20830J3KML6 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm20830J3KML6 Sec23b-201ENSMUST00000028916 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm20830J3KML6 Camta1-201ENSMUST00000049790 8423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm20830J3KML6 Rapgef2-201ENSMUST00000118100 6573 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm20830J3KML6 AL732309.2-201ENSMUST00000228052 3210 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm20830J3KML6 Map3k2-201ENSMUST00000096575 10791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm20830J3KML6 Prickle1-202ENSMUST00000109255 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm20830J3KML6 Zfp82-201ENSMUST00000080834 2181 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm20830J3KML6 Fibin-201ENSMUST00000099626 2267 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm20830J3KML6 Acoxl-202ENSMUST00000110344 1573 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm20830J3KML6 Nde1-203ENSMUST00000117958 1551 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm20830J3KML6 Kif3b-201ENSMUST00000028977 5635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm20830J3KML6 Bicra-201ENSMUST00000094821 5360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm20830J3KML6 Pbxip1-201ENSMUST00000038942 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm20830J3KML6 Tspan5-202ENSMUST00000119993 2107 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm20830J3KML6 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm20830J3KML6 Git1-201ENSMUST00000037285 3512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.1 ms