Protein–RNA interactions for Protein: J3KMI7

Gm20828, MCG116667, mousemouse

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Length 228 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20828J3KMI7 Gm26593-201ENSMUST00000181848 1970 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Gm20828J3KMI7 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Gm20828J3KMI7 Cpeb3-204ENSMUST00000126188 4224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Gm20828J3KMI7 Setdb2-201ENSMUST00000095775 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Gm20828J3KMI7 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Gm20828J3KMI7 Avpr2-201ENSMUST00000033765 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Gm20828J3KMI7 Zfp365-201ENSMUST00000064656 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Gm20828J3KMI7 Wnt9a-202ENSMUST00000108783 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Gm20828J3KMI7 Igf1-203ENSMUST00000105300 1673 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Gm20828J3KMI7 Cox4i2-201ENSMUST00000010020 727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Gm20828J3KMI7 Hist1h2ae-201ENSMUST00000102969 704 ntAPPRIS P1 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Gm20828J3KMI7 Defb30-203ENSMUST00000111208 503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Gm20828J3KMI7 Defb30-204ENSMUST00000111209 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Gm20828J3KMI7 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Gm20828J3KMI7 Gm24644-201ENSMUST00000157114 139 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Gm20828J3KMI7 Rwdd3-209ENSMUST00000170781 1111 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Gm20828J3KMI7 Rps19-ps13-201ENSMUST00000180504 441 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Gm20828J3KMI7 Mhrt-201ENSMUST00000181782 828 ntTSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Gm20828J3KMI7 Gm27847-201ENSMUST00000183711 107 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Gm20828J3KMI7 Gm27375-201ENSMUST00000183799 107 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Gm20828J3KMI7 Dnm3os-203ENSMUST00000185878 557 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Gm20828J3KMI7 5330425B07Rik-201ENSMUST00000196714 1027 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Gm20828J3KMI7 AC110091.3-202ENSMUST00000217104 791 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Gm20828J3KMI7 AC153506.3-201ENSMUST00000219287 1029 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Gm20828J3KMI7 Otud6a-201ENSMUST00000060241 873 ntAPPRIS P1 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Gm20828J3KMI7 Tmem107-201ENSMUST00000075980 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Gm20828J3KMI7 Olfr1423-201ENSMUST00000087831 933 ntAPPRIS P1 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Gm20828J3KMI7 Hist1h2ah-201ENSMUST00000091742 405 ntAPPRIS P1 BASIC12.81□□□□□ -0.36
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Gm20828J3KMI7 Tmem200a-201ENSMUST00000066049 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Gm20828J3KMI7 Pdxdc1-204ENSMUST00000115804 2880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Gm20828J3KMI7 Frzb-201ENSMUST00000028389 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Gm20828J3KMI7 Hlcs-202ENSMUST00000163193 5371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Gm20828J3KMI7 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Gm20828J3KMI7 Gm38355-201ENSMUST00000192514 1570 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Gm20828J3KMI7 Crhr2-208ENSMUST00000212633 2041 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Gm20828J3KMI7 Arcn1-201ENSMUST00000034607 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Gm20828J3KMI7 Pou5f2-201ENSMUST00000175955 1394 ntAPPRIS P1 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Gm20828J3KMI7 Bbs4-201ENSMUST00000026265 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Gm20828J3KMI7 Scube1-203ENSMUST00000076060 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Gm20828J3KMI7 Nxf1-201ENSMUST00000010241 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
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Gm20828J3KMI7 Fnbp4-201ENSMUST00000013759 4691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gm20828J3KMI7 Gm595-201ENSMUST00000114928 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
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Gm20828J3KMI7 Pdp1-205ENSMUST00000108301 2635 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
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Gm20828J3KMI7 Igf2-204ENSMUST00000105936 3970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gm20828J3KMI7 Gdf6-201ENSMUST00000057613 3532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gm20828J3KMI7 Tepsin-201ENSMUST00000026442 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
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Gm20828J3KMI7 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
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Gm20828J3KMI7 Nap1l1-203ENSMUST00000217908 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gm20828J3KMI7 Naga-201ENSMUST00000023088 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gm20828J3KMI7 Emc7-201ENSMUST00000069747 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
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Gm20828J3KMI7 4930423D22Rik-201ENSMUST00000221909 1674 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
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Gm20828J3KMI7 Hmox2-201ENSMUST00000004172 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gm20828J3KMI7 Pigq-201ENSMUST00000026823 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gm20828J3KMI7 Eya1-203ENSMUST00000168081 4366 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gm20828J3KMI7 Slc39a8-201ENSMUST00000029810 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gm20828J3KMI7 Chodl-202ENSMUST00000069148 2051 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gm20828J3KMI7 Vangl1-201ENSMUST00000029453 6531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gm20828J3KMI7 Abcg5-201ENSMUST00000066175 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gm20828J3KMI7 Pla2g6-201ENSMUST00000047816 2963 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gm20828J3KMI7 Cep68-201ENSMUST00000050611 4804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gm20828J3KMI7 Vps52-201ENSMUST00000025178 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gm20828J3KMI7 Sipa1l3-207ENSMUST00000182484 2420 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gm20828J3KMI7 Gm13814-201ENSMUST00000141341 3077 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gm20828J3KMI7 Coro6-205ENSMUST00000108391 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gm20828J3KMI7 Rfx7-205ENSMUST00000184015 1554 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gm20828J3KMI7 Notch1-201ENSMUST00000028288 9488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gm20828J3KMI7 Gm14704-201ENSMUST00000120300 874 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Gm20828J3KMI7 Gm13813-201ENSMUST00000120998 787 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Gm20828J3KMI7 Oaz2-ps-201ENSMUST00000121735 537 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Gm20828J3KMI7 H2afb1-201ENSMUST00000122446 348 ntAPPRIS P1 BASIC12.79□□□□□ -0.36
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