Protein–RNA interactions for Protein: G3X9C2

Nccrp1, F-box only protein 50, mousemouse

Predictions only

Length 266 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nccrp1G3X9C2 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Nccrp1G3X9C2 Arfgap1-205ENSMUST00000108862 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Nccrp1G3X9C2 Vax2os-201ENSMUST00000123402 1435 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Nccrp1G3X9C2 Acin1-219ENSMUST00000148754 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Nccrp1G3X9C2 Tjap1-203ENSMUST00000180283 2368 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Nccrp1G3X9C2 Rtp3-201ENSMUST00000084922 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Nccrp1G3X9C2 9930014A18Rik-201ENSMUST00000180730 3074 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Nccrp1G3X9C2 Llgl2-212ENSMUST00000177736 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Nccrp1G3X9C2 Gatad2a-206ENSMUST00000212478 3622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Nccrp1G3X9C2 Ptpn6-201ENSMUST00000004377 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Nccrp1G3X9C2 1810032O08Rik-201ENSMUST00000106378 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Nccrp1G3X9C2 Rnps1-202ENSMUST00000115371 1617 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Nccrp1G3X9C2 Spatc1l-202ENSMUST00000105414 1060 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Nccrp1G3X9C2 3110009E18Rik-203ENSMUST00000112644 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Nccrp1G3X9C2 Mrpl2-203ENSMUST00000113430 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Nccrp1G3X9C2 Gm13123-201ENSMUST00000122173 492 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Nccrp1G3X9C2 Myl3-203ENSMUST00000136695 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Nccrp1G3X9C2 Snora78-201ENSMUST00000158630 128 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Nccrp1G3X9C2 Gm15851-201ENSMUST00000160564 662 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Nccrp1G3X9C2 Gm12057-202ENSMUST00000189990 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Nccrp1G3X9C2 2610300A13Rik-201ENSMUST00000192930 503 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Nccrp1G3X9C2 Gm43818-201ENSMUST00000200605 466 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Nccrp1G3X9C2 Gm34549-203ENSMUST00000208300 896 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Nccrp1G3X9C2 AC126253.1-201ENSMUST00000227974 824 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Nccrp1G3X9C2 Ifitm10-202ENSMUST00000084412 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Nccrp1G3X9C2 Pin1rt1-201ENSMUST00000099659 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Nccrp1G3X9C2 Mast3-203ENSMUST00000211948 4251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Nccrp1G3X9C2 Spg7-202ENSMUST00000125975 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Nccrp1G3X9C2 Reep3-201ENSMUST00000020023 5430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Nccrp1G3X9C2 Dlgap1-208ENSMUST00000135938 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Nccrp1G3X9C2 Gm38094-201ENSMUST00000195864 2978 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Nccrp1G3X9C2 Hdgfl2-201ENSMUST00000002911 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Nccrp1G3X9C2 Ubap2l-204ENSMUST00000195995 3516 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Nccrp1G3X9C2 Mamdc4-202ENSMUST00000114223 3998 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Nccrp1G3X9C2 Ddx23-201ENSMUST00000003450 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Nccrp1G3X9C2 Tfe3-202ENSMUST00000079542 3163 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Nccrp1G3X9C2 Ctgf-203ENSMUST00000176228 2490 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Nccrp1G3X9C2 Abi1-201ENSMUST00000078977 3027 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Nccrp1G3X9C2 Pla2g15-204ENSMUST00000212963 2578 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Nccrp1G3X9C2 Pomgnt1-201ENSMUST00000106494 2226 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Nccrp1G3X9C2 Cmpk2-201ENSMUST00000020969 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Nccrp1G3X9C2 Fn1-216ENSMUST00000189821 7410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nccrp1G3X9C2 Nt5c3b-203ENSMUST00000107397 1348 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nccrp1G3X9C2 Asb10-202ENSMUST00000117900 1432 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nccrp1G3X9C2 Mageb10-ps-201ENSMUST00000119697 1407 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Nccrp1G3X9C2 Ddx46-202ENSMUST00000172272 5676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nccrp1G3X9C2 B3gat2-201ENSMUST00000063663 5655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nccrp1G3X9C2 Ddx46-201ENSMUST00000099479 5664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nccrp1G3X9C2 Mob1b-201ENSMUST00000006424 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nccrp1G3X9C2 Gm15544-201ENSMUST00000118776 1531 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Nccrp1G3X9C2 Espn-213ENSMUST00000105659 3595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nccrp1G3X9C2 Gm15684-201ENSMUST00000160605 1814 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nccrp1G3X9C2 4933434M16Rik-202ENSMUST00000153429 1940 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nccrp1G3X9C2 Samd5-201ENSMUST00000100070 6818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nccrp1G3X9C2 Birc7-201ENSMUST00000108875 1178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nccrp1G3X9C2 Htr2c-203ENSMUST00000112831 809 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nccrp1G3X9C2 Gm7029-201ENSMUST00000173226 450 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Nccrp1G3X9C2 Gm4271-201ENSMUST00000174444 973 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Nccrp1G3X9C2 Gm27572-201ENSMUST00000183702 255 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Nccrp1G3X9C2 1700065I16Rik-202ENSMUST00000185477 813 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nccrp1G3X9C2 Gm36198-201ENSMUST00000217490 416 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nccrp1G3X9C2 Gm34084-201ENSMUST00000222236 1298 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nccrp1G3X9C2 AC154595.3-201ENSMUST00000224579 384 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Nccrp1G3X9C2 Cyct-201ENSMUST00000028430 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nccrp1G3X9C2 Clec11a-201ENSMUST00000004587 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nccrp1G3X9C2 Ccl24-201ENSMUST00000004936 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nccrp1G3X9C2 Rab39-201ENSMUST00000068449 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nccrp1G3X9C2 Gm10146-201ENSMUST00000072739 309 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Nccrp1G3X9C2 Ddx24-202ENSMUST00000110001 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nccrp1G3X9C2 Cad-206ENSMUST00000201838 3153 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nccrp1G3X9C2 Gm9200-201ENSMUST00000118513 1354 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Nccrp1G3X9C2 Commd1-201ENSMUST00000057843 1459 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nccrp1G3X9C2 Gpr35-205ENSMUST00000186298 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nccrp1G3X9C2 Tigd2-201ENSMUST00000062626 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nccrp1G3X9C2 Gm14149-201ENSMUST00000123048 1853 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nccrp1G3X9C2 Mrps30-201ENSMUST00000022245 3319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nccrp1G3X9C2 Gm43423-201ENSMUST00000198390 2094 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Nccrp1G3X9C2 Glp2r-202ENSMUST00000051765 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nccrp1G3X9C2 Tmem215-202ENSMUST00000179526 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nccrp1G3X9C2 Dpp6-201ENSMUST00000071500 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nccrp1G3X9C2 Ptpn1-201ENSMUST00000029053 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nccrp1G3X9C2 Myh2-203ENSMUST00000170159 6083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nccrp1G3X9C2 Cngb1-202ENSMUST00000119870 6189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nccrp1G3X9C2 Arhgef40-202ENSMUST00000100639 4843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nccrp1G3X9C2 Chd7-201ENSMUST00000039267 9444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nccrp1G3X9C2 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nccrp1G3X9C2 Atxn7l3b-201ENSMUST00000099276 3566 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nccrp1G3X9C2 Galnt6-202ENSMUST00000159715 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nccrp1G3X9C2 Fsd1-201ENSMUST00000011733 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nccrp1G3X9C2 Gypa-201ENSMUST00000063359 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nccrp1G3X9C2 Slc22a2-201ENSMUST00000046959 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nccrp1G3X9C2 Inpp5a-202ENSMUST00000097975 2301 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nccrp1G3X9C2 Tmem132e-202ENSMUST00000092852 4105 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nccrp1G3X9C2 Rubcn-202ENSMUST00000089684 5311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nccrp1G3X9C2 Cul9-201ENSMUST00000066026 7818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nccrp1G3X9C2 Zfp148-202ENSMUST00000165418 9431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nccrp1G3X9C2 Senp5-201ENSMUST00000023457 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nccrp1G3X9C2 B230217C12Rik-202ENSMUST00000155954 2181 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nccrp1G3X9C2 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nccrp1G3X9C2 Stpg2-202ENSMUST00000106239 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
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