Protein–RNA interactions for Protein: F8VPU6

Usp9y, Ubiquitin-specific peptidase 9, Y chromosome, mousemouse

Predictions only

Length 2,556 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp9yF8VPU6 Pcca-201ENSMUST00000038374 2592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Usp9yF8VPU6 Adsl-206ENSMUST00000168756 1439 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Usp9yF8VPU6 Nrf1-209ENSMUST00000115209 2406 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Usp9yF8VPU6 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Usp9yF8VPU6 Ap2m1-201ENSMUST00000007216 2937 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Usp9yF8VPU6 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Usp9yF8VPU6 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Usp9yF8VPU6 Gabpb1-206ENSMUST00000110425 4153 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Usp9yF8VPU6 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Usp9yF8VPU6 Ypel4-201ENSMUST00000090729 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Usp9yF8VPU6 AC101945.2-201ENSMUST00000227886 1377 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Usp9yF8VPU6 Gcg-201ENSMUST00000102733 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Usp9yF8VPU6 A230006K03Rik-201ENSMUST00000107533 977 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Usp9yF8VPU6 Gm14058-201ENSMUST00000116082 735 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Usp9yF8VPU6 Tsc22d1-206ENSMUST00000134109 801 ntTSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Usp9yF8VPU6 Gm18159-201ENSMUST00000174516 1070 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Usp9yF8VPU6 4930430O22Rik-202ENSMUST00000202548 579 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Usp9yF8VPU6 AC164087.2-201ENSMUST00000216206 1072 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Usp9yF8VPU6 Rpl17-201ENSMUST00000079716 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Usp9yF8VPU6 4930581F22Rik-201ENSMUST00000093873 2402 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Usp9yF8VPU6 Cacna1g-209ENSMUST00000107791 8002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Usp9yF8VPU6 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Usp9yF8VPU6 Mcfd2-204ENSMUST00000144236 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Usp9yF8VPU6 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Usp9yF8VPU6 Daam2-202ENSMUST00000224595 1926 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Usp9yF8VPU6 Rxrg-204ENSMUST00000111386 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Usp9yF8VPU6 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Usp9yF8VPU6 Camk2d-206ENSMUST00000106402 4180 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Usp9yF8VPU6 Tubb2a-ps2-201ENSMUST00000221547 1339 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Usp9yF8VPU6 4932431P20Rik-201ENSMUST00000098602 1340 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Usp9yF8VPU6 Aurka-203ENSMUST00000109140 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Usp9yF8VPU6 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Usp9yF8VPU6 Crx-203ENSMUST00000172758 1469 ntTSL 3 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Usp9yF8VPU6 Alkbh3-202ENSMUST00000111240 1395 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Usp9yF8VPU6 Hsd3b7-201ENSMUST00000046863 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Usp9yF8VPU6 Cenpx-203ENSMUST00000106154 873 ntTSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Usp9yF8VPU6 Gm13736-201ENSMUST00000119272 253 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Usp9yF8VPU6 Gm14034-201ENSMUST00000120147 551 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Usp9yF8VPU6 Gm17116-201ENSMUST00000169175 1013 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Usp9yF8VPU6 Zfp655-203ENSMUST00000196069 1150 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Usp9yF8VPU6 2310016G11Rik-201ENSMUST00000094460 992 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Usp9yF8VPU6 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Usp9yF8VPU6 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Usp9yF8VPU6 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Usp9yF8VPU6 Dppa4-202ENSMUST00000096045 1534 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Usp9yF8VPU6 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Usp9yF8VPU6 Cluh-201ENSMUST00000092915 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Usp9yF8VPU6 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Usp9yF8VPU6 Serpina16-202ENSMUST00000164148 1582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Usp9yF8VPU6 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Usp9yF8VPU6 Tcf4-226ENSMUST00000201094 2172 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Usp9yF8VPU6 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Usp9yF8VPU6 Rbm11-203ENSMUST00000114253 2699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Usp9yF8VPU6 Ppm1g-201ENSMUST00000031032 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Usp9yF8VPU6 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Usp9yF8VPU6 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Usp9yF8VPU6 Gm37737-201ENSMUST00000195013 1638 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Usp9yF8VPU6 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Usp9yF8VPU6 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Usp9yF8VPU6 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Usp9yF8VPU6 Gm23771-201ENSMUST00000178702 110 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Usp9yF8VPU6 1190007I07Rik-205ENSMUST00000185168 469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Usp9yF8VPU6 2310047D07Rik-201ENSMUST00000189493 735 ntTSL 3 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Usp9yF8VPU6 Gm19187-201ENSMUST00000206781 892 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Usp9yF8VPU6 Gm40578-201ENSMUST00000220837 390 ntTSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Usp9yF8VPU6 AC113031.8-201ENSMUST00000227856 631 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Usp9yF8VPU6 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Usp9yF8VPU6 Gm8994-202ENSMUST00000204530 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Usp9yF8VPU6 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Usp9yF8VPU6 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Usp9yF8VPU6 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Usp9yF8VPU6 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Usp9yF8VPU6 Atxn2l-201ENSMUST00000040202 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Usp9yF8VPU6 Txn2-203ENSMUST00000109747 1778 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Usp9yF8VPU6 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Usp9yF8VPU6 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Usp9yF8VPU6 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Usp9yF8VPU6 Taf6-203ENSMUST00000110937 2093 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.76
Usp9yF8VPU6 Olfr288-202ENSMUST00000165379 2083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.76
Usp9yF8VPU6 Gm15036-201ENSMUST00000118880 400 ntBASIC10.27□□□□□ -0.76
Usp9yF8VPU6 Rbmx2-ps-201ENSMUST00000119377 930 ntBASIC10.27□□□□□ -0.76
Usp9yF8VPU6 Prr13-204ENSMUST00000164957 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Usp9yF8VPU6 Gm10774-201ENSMUST00000188689 204 ntBASIC10.27□□□□□ -0.76
Usp9yF8VPU6 Gm45398-201ENSMUST00000210561 165 ntBASIC10.27□□□□□ -0.76
Usp9yF8VPU6 Tepp-207ENSMUST00000212056 613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.76
Usp9yF8VPU6 Colec11-203ENSMUST00000220836 887 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Usp9yF8VPU6 Higd2a-201ENSMUST00000026986 648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Usp9yF8VPU6 Med27-201ENSMUST00000028139 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Usp9yF8VPU6 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Usp9yF8VPU6 Gm21811-201ENSMUST00000096485 930 ntBASIC10.27□□□□□ -0.76
Usp9yF8VPU6 Epb41l2-201ENSMUST00000053748 4385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Usp9yF8VPU6 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC10.27□□□□□ -0.76
Usp9yF8VPU6 Tmem268-201ENSMUST00000077709 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Usp9yF8VPU6 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Usp9yF8VPU6 Ivns1abp-201ENSMUST00000023918 3511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Usp9yF8VPU6 Dnd1-201ENSMUST00000061522 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Usp9yF8VPU6 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Usp9yF8VPU6 Armcx1-206ENSMUST00000113201 2228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Usp9yF8VPU6 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Usp9yF8VPU6 Slc3a2-207ENSMUST00000206598 1393 ntTSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
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