Protein–RNA interactions for Protein: F7CQW8

Gm3371, Predicted gene 3371 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 167 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3371F7CQW8 Gm28043-201ENSMUST00000130871 6521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm3371F7CQW8 Kcna6-202ENSMUST00000112242 3464 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm3371F7CQW8 Vps4b-202ENSMUST00000112736 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm3371F7CQW8 Vmn1r198-202ENSMUST00000226786 6195 ntAPPRIS P2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm3371F7CQW8 Ngf-202ENSMUST00000106925 1187 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm3371F7CQW8 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm3371F7CQW8 Med28-203ENSMUST00000119579 636 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm3371F7CQW8 Gm14608-201ENSMUST00000120030 1553 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm3371F7CQW8 Mthfsd-206ENSMUST00000133037 1060 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm3371F7CQW8 Gm22331-201ENSMUST00000158066 136 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm3371F7CQW8 Crb3-204ENSMUST00000163763 868 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm3371F7CQW8 Prr13-204ENSMUST00000164957 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm3371F7CQW8 Gm27847-201ENSMUST00000183711 107 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm3371F7CQW8 Gm27375-201ENSMUST00000183799 107 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm3371F7CQW8 Gm38411-201ENSMUST00000197971 941 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm3371F7CQW8 Gm45233-201ENSMUST00000203633 898 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm3371F7CQW8 Fosb-207ENSMUST00000208505 3523 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm3371F7CQW8 AC165254.1-201ENSMUST00000220736 599 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm3371F7CQW8 Lats2-202ENSMUST00000038381 933 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm3371F7CQW8 Haus7-202ENSMUST00000077243 1032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm3371F7CQW8 1110002L01Rik-202ENSMUST00000168012 3569 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm3371F7CQW8 Zmynd15-201ENSMUST00000039093 2804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm3371F7CQW8 Ncoa7-201ENSMUST00000068567 5105 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm3371F7CQW8 Lrp1-202ENSMUST00000118455 2097 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm3371F7CQW8 Dennd2d-201ENSMUST00000029508 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm3371F7CQW8 Aire-216ENSMUST00000156417 1627 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm3371F7CQW8 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm3371F7CQW8 Fam155a-201ENSMUST00000110969 3388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm3371F7CQW8 E130308A19Rik-201ENSMUST00000052420 3205 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm3371F7CQW8 Tbc1d22a-201ENSMUST00000063414 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm3371F7CQW8 Pcdhgb8-202ENSMUST00000208907 2796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm3371F7CQW8 Arhgap11a-201ENSMUST00000102545 4958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm3371F7CQW8 Sema4a-214ENSMUST00000166237 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm3371F7CQW8 Kif9-204ENSMUST00000198043 2233 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm3371F7CQW8 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm3371F7CQW8 Max-201ENSMUST00000082136 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm3371F7CQW8 Shisa3-201ENSMUST00000087241 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm3371F7CQW8 Apc2-202ENSMUST00000105359 9173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm3371F7CQW8 Dctn2-201ENSMUST00000026479 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm3371F7CQW8 Defb30-203ENSMUST00000111208 503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm3371F7CQW8 Defb30-204ENSMUST00000111209 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm3371F7CQW8 Qdpr-202ENSMUST00000117425 1231 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm3371F7CQW8 Car15-201ENSMUST00000118960 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm3371F7CQW8 H2afb1-201ENSMUST00000122446 348 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm3371F7CQW8 Ankzf1-201ENSMUST00000127625 1167 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm3371F7CQW8 Gm11754-201ENSMUST00000156576 661 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm3371F7CQW8 Gm9061-201ENSMUST00000182707 1006 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm3371F7CQW8 Gm37753-201ENSMUST00000192178 439 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm3371F7CQW8 Gm37497-201ENSMUST00000195830 798 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm3371F7CQW8 Dnd1-ps-201ENSMUST00000196992 964 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm3371F7CQW8 Ube2a-205ENSMUST00000201068 1298 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm3371F7CQW8 AC138604.1-201ENSMUST00000226969 739 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm3371F7CQW8 Mrpl50-201ENSMUST00000057829 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm3371F7CQW8 Dmrtc1c2-201ENSMUST00000087896 1255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm3371F7CQW8 Runx1t1-204ENSMUST00000105566 6090 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm3371F7CQW8 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm3371F7CQW8 Ccdc94-201ENSMUST00000086869 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm3371F7CQW8 Sphk2-203ENSMUST00000210060 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm3371F7CQW8 F3-201ENSMUST00000029771 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm3371F7CQW8 Kpna7-203ENSMUST00000116454 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm3371F7CQW8 Bhlhb9-204ENSMUST00000180025 2812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm3371F7CQW8 Cdc42se1-201ENSMUST00000053872 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm3371F7CQW8 Ube2j2-204ENSMUST00000105582 1394 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Gm3371F7CQW8 Ccdc116-203ENSMUST00000115711 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Gm3371F7CQW8 Rbpjl-201ENSMUST00000017151 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Gm3371F7CQW8 Pir-201ENSMUST00000033749 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Gm3371F7CQW8 Ddo-203ENSMUST00000213503 1759 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Gm3371F7CQW8 Hnrnpk-232ENSMUST00000225674 2704 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm3371F7CQW8 Ankrd17-201ENSMUST00000014421 10458 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm3371F7CQW8 Mapk8ip3-206ENSMUST00000120035 4125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm3371F7CQW8 Dag1-204ENSMUST00000191899 5662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm3371F7CQW8 Cox4i2-201ENSMUST00000010020 727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm3371F7CQW8 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm3371F7CQW8 Wisp1-202ENSMUST00000118823 708 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm3371F7CQW8 Gm24644-201ENSMUST00000157114 139 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm3371F7CQW8 Ucma-204ENSMUST00000167607 785 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm3371F7CQW8 Rwdd3-209ENSMUST00000170781 1111 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm3371F7CQW8 Gm26721-201ENSMUST00000181723 992 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm3371F7CQW8 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm3371F7CQW8 Ighv8-10-201ENSMUST00000199579 358 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm3371F7CQW8 Gm2824-203ENSMUST00000226189 1228 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm3371F7CQW8 Dmac1-201ENSMUST00000030103 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm3371F7CQW8 Upk2-201ENSMUST00000047740 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm3371F7CQW8 Arvcf-201ENSMUST00000090103 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm3371F7CQW8 Nav1-207ENSMUST00000190298 8557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm3371F7CQW8 Ankrd13c-201ENSMUST00000040787 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm3371F7CQW8 Ckm-203ENSMUST00000208710 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm3371F7CQW8 Myc-205ENSMUST00000161976 2338 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm3371F7CQW8 Myc-201ENSMUST00000022971 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm3371F7CQW8 Zyx-201ENSMUST00000070635 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm3371F7CQW8 Gcom1-201ENSMUST00000163998 1726 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm3371F7CQW8 Polg-201ENSMUST00000073889 7837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm3371F7CQW8 Hipk3-201ENSMUST00000028600 7454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm3371F7CQW8 Hk2-204ENSMUST00000170833 2792 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm3371F7CQW8 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm3371F7CQW8 Tbc1d16-201ENSMUST00000036113 6986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm3371F7CQW8 Gm26519-201ENSMUST00000181193 2249 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm3371F7CQW8 Ccdc25-201ENSMUST00000022614 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm3371F7CQW8 Klhl38-201ENSMUST00000022985 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm3371F7CQW8 Igsf23-204ENSMUST00000208974 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms