Protein–RNA interactions for Protein: F7BCN0

Gm28048, Predicted gene, 28048 (Fragment), mousemouse

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Length 99 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28048F7BCN0 Gm42890-202ENSMUST00000167642 2566 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm28048F7BCN0 Gm11732-201ENSMUST00000151381 1742 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm28048F7BCN0 Oprm1-205ENSMUST00000078634 1695 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm28048F7BCN0 Pygo1-201ENSMUST00000038489 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm28048F7BCN0 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm28048F7BCN0 Stx17-201ENSMUST00000064765 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm28048F7BCN0 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm28048F7BCN0 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm28048F7BCN0 AC154262.2-202ENSMUST00000225158 1331 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm28048F7BCN0 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm28048F7BCN0 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm28048F7BCN0 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm28048F7BCN0 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm28048F7BCN0 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm28048F7BCN0 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm28048F7BCN0 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm28048F7BCN0 Gm45484-201ENSMUST00000210310 1141 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm28048F7BCN0 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm28048F7BCN0 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm28048F7BCN0 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm28048F7BCN0 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm28048F7BCN0 Nfya-212ENSMUST00000162460 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm28048F7BCN0 Rnf14-201ENSMUST00000072376 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm28048F7BCN0 Tmem230-203ENSMUST00000110164 2957 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm28048F7BCN0 Dmtn-208ENSMUST00000228009 2643 ntAPPRIS P2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm28048F7BCN0 Cacnb2-203ENSMUST00000114723 3945 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm28048F7BCN0 Ndufaf7-201ENSMUST00000024887 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm28048F7BCN0 Gm26905-201ENSMUST00000180798 6621 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm28048F7BCN0 Trmt1-203ENSMUST00000109767 2138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm28048F7BCN0 Gm19817-201ENSMUST00000199764 2132 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm28048F7BCN0 Tgfbr2-201ENSMUST00000035014 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm28048F7BCN0 Bcl2l15-202ENSMUST00000106822 1902 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm28048F7BCN0 Gm16070-203ENSMUST00000155588 1902 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm28048F7BCN0 Gm9866-202ENSMUST00000182473 1882 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm28048F7BCN0 Gm13722-201ENSMUST00000117964 3066 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm28048F7BCN0 Mlx-202ENSMUST00000107302 1826 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm28048F7BCN0 Abra-201ENSMUST00000054742 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm28048F7BCN0 Acoxl-202ENSMUST00000110344 1573 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm28048F7BCN0 Gm15336-201ENSMUST00000128894 1571 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm28048F7BCN0 Sncaip-209ENSMUST00000179625 2568 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm28048F7BCN0 Mettl13-201ENSMUST00000028017 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm28048F7BCN0 Cog7-203ENSMUST00000205438 3355 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm28048F7BCN0 Opcml-201ENSMUST00000073822 2378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm28048F7BCN0 Mixl1-201ENSMUST00000027778 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm28048F7BCN0 Apol7e-201ENSMUST00000096358 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm28048F7BCN0 Kif3b-201ENSMUST00000028977 5635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
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Gm28048F7BCN0 AC156504.2-201ENSMUST00000213800 711 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
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Gm28048F7BCN0 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
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Gm28048F7BCN0 March7-203ENSMUST00000102748 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
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Gm28048F7BCN0 Abcg8-203ENSMUST00000171915 2284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
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Gm28048F7BCN0 Dgkg-201ENSMUST00000023578 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
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Gm28048F7BCN0 Arhgap25-202ENSMUST00000101197 2493 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm28048F7BCN0 Usp53-202ENSMUST00000197314 3586 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm28048F7BCN0 Gm6210-201ENSMUST00000204734 1942 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm28048F7BCN0 Reep2-201ENSMUST00000043484 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm28048F7BCN0 Acvrl1-205ENSMUST00000120754 3506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm28048F7BCN0 Paupar-201ENSMUST00000194826 3482 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm28048F7BCN0 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm28048F7BCN0 Trim23-201ENSMUST00000022225 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm28048F7BCN0 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm28048F7BCN0 Cntf-201ENSMUST00000112933 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm28048F7BCN0 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm28048F7BCN0 Gm12485-201ENSMUST00000119641 291 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm28048F7BCN0 Apoc3-203ENSMUST00000121916 709 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm28048F7BCN0 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm28048F7BCN0 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm28048F7BCN0 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm28048F7BCN0 Dkkl1-204ENSMUST00000210741 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm28048F7BCN0 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm28048F7BCN0 Brk1-201ENSMUST00000035725 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm28048F7BCN0 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm28048F7BCN0 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
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