Protein–RNA interactions for Protein: F6VKC7

Zfp988, Zinc finger protein 988, mousemouse

Predictions only

Length 633 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp988F6VKC7 Myc-205ENSMUST00000161976 2338 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Zfp988F6VKC7 Myc-201ENSMUST00000022971 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Zfp988F6VKC7 Anapc11-201ENSMUST00000026128 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Zfp988F6VKC7 Trmt1l-201ENSMUST00000065625 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Zfp988F6VKC7 Evc2-201ENSMUST00000056365 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Zfp988F6VKC7 Gtf2ird1-212ENSMUST00000200944 3133 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Zfp988F6VKC7 Mafk-202ENSMUST00000110836 3097 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Zfp988F6VKC7 Agrn-201ENSMUST00000071248 4831 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Zfp988F6VKC7 Itgb4-202ENSMUST00000068981 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Zfp988F6VKC7 Mpp3-202ENSMUST00000100400 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Zfp988F6VKC7 Gm11555-202ENSMUST00000104929 638 ntAPPRIS P1 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Zfp988F6VKC7 Tssc4-202ENSMUST00000105920 895 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Zfp988F6VKC7 Fgf18-202ENSMUST00000109363 991 ntTSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Zfp988F6VKC7 Rhox2f-201ENSMUST00000115173 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Zfp988F6VKC7 Gm12960-201ENSMUST00000120017 1066 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Zfp988F6VKC7 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Zfp988F6VKC7 Gm9002-201ENSMUST00000178437 499 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Zfp988F6VKC7 Gm17794-201ENSMUST00000220252 955 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Zfp988F6VKC7 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Zfp988F6VKC7 Rps15-201ENSMUST00000062674 572 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Zfp988F6VKC7 Galnt6-202ENSMUST00000159715 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Zfp988F6VKC7 Pou2f2-203ENSMUST00000108415 7095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Zfp988F6VKC7 Pdcd6ip-202ENSMUST00000111861 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Zfp988F6VKC7 Ptprk-202ENSMUST00000218276 4754 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Zfp988F6VKC7 Lnx1-201ENSMUST00000039744 2727 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Zfp988F6VKC7 Myh7-204ENSMUST00000168485 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Zfp988F6VKC7 Chst15-201ENSMUST00000077472 5041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Zfp988F6VKC7 Gm18263-201ENSMUST00000220846 1928 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Zfp988F6VKC7 Tspyl3-201ENSMUST00000099194 3072 ntAPPRIS P1 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Zfp988F6VKC7 Hectd2-208ENSMUST00000169036 3842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Zfp988F6VKC7 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Zfp988F6VKC7 Zbtb7b-203ENSMUST00000107433 3650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Zfp988F6VKC7 Pcbp3-203ENSMUST00000105411 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Zfp988F6VKC7 Gm39377-201ENSMUST00000214587 2533 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Zfp988F6VKC7 Gm9816-201ENSMUST00000122292 1414 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Zfp988F6VKC7 Ppl-201ENSMUST00000035672 6277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Zfp988F6VKC7 Klk6-203ENSMUST00000107968 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Zfp988F6VKC7 Fip1l1-201ENSMUST00000080164 4673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Zfp988F6VKC7 Ano1-201ENSMUST00000033393 4585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Zfp988F6VKC7 Fbxl12-203ENSMUST00000131128 4182 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Zfp988F6VKC7 Ildr1-202ENSMUST00000089618 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Zfp988F6VKC7 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Zfp988F6VKC7 Prss45-201ENSMUST00000011391 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Zfp988F6VKC7 Gm15806-201ENSMUST00000120696 955 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Zfp988F6VKC7 Apoc3-203ENSMUST00000121916 709 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Zfp988F6VKC7 Mir1894-201ENSMUST00000122802 81 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Zfp988F6VKC7 Mb-202ENSMUST00000166179 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Zfp988F6VKC7 Mb-203ENSMUST00000169226 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Zfp988F6VKC7 Gm29152-201ENSMUST00000189284 325 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Zfp988F6VKC7 Cryaa-201ENSMUST00000019192 1176 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Zfp988F6VKC7 C030018K13Rik-202ENSMUST00000196829 712 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Zfp988F6VKC7 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Zfp988F6VKC7 Gm44069-201ENSMUST00000204898 506 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Zfp988F6VKC7 Gm44064-201ENSMUST00000204964 1087 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Zfp988F6VKC7 1700067P10Rik-201ENSMUST00000022028 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Zfp988F6VKC7 Csrp3-201ENSMUST00000032658 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Zfp988F6VKC7 Gm13199-201ENSMUST00000071016 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Zfp988F6VKC7 Cracr2a-201ENSMUST00000071563 1094 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Zfp988F6VKC7 Pde4d-220ENSMUST00000177907 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Zfp988F6VKC7 AC154747.3-201ENSMUST00000224471 3470 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Zfp988F6VKC7 Efr3a-205ENSMUST00000173858 2848 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Zfp988F6VKC7 Fmo1-202ENSMUST00000111518 1506 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Zfp988F6VKC7 Syt1-202ENSMUST00000105276 4820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Zfp988F6VKC7 Actr8-204ENSMUST00000224797 2328 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Zfp988F6VKC7 Cap2-201ENSMUST00000021802 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Zfp988F6VKC7 Phyh-201ENSMUST00000027975 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Zfp988F6VKC7 Cldn9-201ENSMUST00000085989 1435 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Zfp988F6VKC7 Dnmt3a-201ENSMUST00000020991 9685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Zfp988F6VKC7 Abcg8-203ENSMUST00000171915 2284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Zfp988F6VKC7 Ano6-208ENSMUST00000227791 3149 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Zfp988F6VKC7 Psd-210ENSMUST00000225323 3398 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Zfp988F6VKC7 Otx2-201ENSMUST00000118578 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Zfp988F6VKC7 Renbp-209ENSMUST00000155597 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Zfp988F6VKC7 H1fnt-201ENSMUST00000060855 1326 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Zfp988F6VKC7 Klc2-204ENSMUST00000116563 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Zfp988F6VKC7 Runx1t1-204ENSMUST00000105566 6090 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Zfp988F6VKC7 Lpar1-205ENSMUST00000107575 3421 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Zfp988F6VKC7 Arhgef2-219ENSMUST00000176500 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Zfp988F6VKC7 AI464131-201ENSMUST00000054920 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Zfp988F6VKC7 Neu2-204ENSMUST00000165109 1824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Zfp988F6VKC7 AC137842.1-201ENSMUST00000227896 2064 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Zfp988F6VKC7 Glis2-201ENSMUST00000014447 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Zfp988F6VKC7 Nlrc3-203ENSMUST00000177551 5403 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Zfp988F6VKC7 Klhl30-201ENSMUST00000027533 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Zfp988F6VKC7 Cpsf4l-203ENSMUST00000106617 1123 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Zfp988F6VKC7 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Zfp988F6VKC7 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Zfp988F6VKC7 Slc2a9-207ENSMUST00000143758 1296 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Zfp988F6VKC7 1700092C10Rik-201ENSMUST00000172547 585 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Zfp988F6VKC7 Gm6244-201ENSMUST00000178732 841 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Zfp988F6VKC7 Gm27892-201ENSMUST00000185017 106 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Zfp988F6VKC7 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Zfp988F6VKC7 Gm42929-201ENSMUST00000198374 1286 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Zfp988F6VKC7 AC135669.1-202ENSMUST00000216742 540 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Zfp988F6VKC7 AC151971.1-201ENSMUST00000217329 993 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Zfp988F6VKC7 Gm867-202ENSMUST00000219979 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Zfp988F6VKC7 1700127F24Rik-201ENSMUST00000221685 604 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Zfp988F6VKC7 Wdr74-201ENSMUST00000049424 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Zfp988F6VKC7 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Zfp988F6VKC7 Plaur-201ENSMUST00000002284 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.3 ms