Protein–RNA interactions for Protein: F6V0H0

Pagr1b, PAXIP1-associated glutamate-rich protein 1B (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 108 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pagr1bF6V0H0 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pagr1bF6V0H0 Osbpl10-204ENSMUST00000182384 2158 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pagr1bF6V0H0 Sin3a-208ENSMUST00000168678 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pagr1bF6V0H0 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pagr1bF6V0H0 Psmd2-201ENSMUST00000007212 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pagr1bF6V0H0 Gm5639-201ENSMUST00000122305 2403 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Pagr1bF6V0H0 Galnt4-201ENSMUST00000161240 5089 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pagr1bF6V0H0 Prx-203ENSMUST00000108355 5433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pagr1bF6V0H0 Sirt4-201ENSMUST00000112066 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pagr1bF6V0H0 Abra-201ENSMUST00000054742 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pagr1bF6V0H0 Mettl1-201ENSMUST00000006915 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pagr1bF6V0H0 Diaph3-202ENSMUST00000168889 4582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pagr1bF6V0H0 Diaph3-201ENSMUST00000022599 4582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pagr1bF6V0H0 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pagr1bF6V0H0 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pagr1bF6V0H0 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pagr1bF6V0H0 Slc22a2-201ENSMUST00000046959 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pagr1bF6V0H0 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pagr1bF6V0H0 Glis3-202ENSMUST00000112612 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pagr1bF6V0H0 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pagr1bF6V0H0 Plcd1-203ENSMUST00000214470 2706 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pagr1bF6V0H0 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pagr1bF6V0H0 Asap1-218ENSMUST00000177374 4582 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pagr1bF6V0H0 Olfr1234-202ENSMUST00000111543 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pagr1bF6V0H0 Dcaf6-201ENSMUST00000027856 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pagr1bF6V0H0 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pagr1bF6V0H0 Eif4g1-205ENSMUST00000115461 5507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pagr1bF6V0H0 Nek3-202ENSMUST00000110730 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pagr1bF6V0H0 1700042G07Rik-201ENSMUST00000106492 385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pagr1bF6V0H0 Gm6370-201ENSMUST00000110611 1142 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pagr1bF6V0H0 Gm4909-201ENSMUST00000118749 794 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Pagr1bF6V0H0 Gm4760-201ENSMUST00000119663 1030 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Pagr1bF6V0H0 D630024D03Rik-201ENSMUST00000126265 720 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pagr1bF6V0H0 Gm11772-201ENSMUST00000136542 532 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pagr1bF6V0H0 Gm22902-201ENSMUST00000158488 302 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Pagr1bF6V0H0 Arf4os-201ENSMUST00000166902 566 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pagr1bF6V0H0 Gm6309-201ENSMUST00000174320 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pagr1bF6V0H0 Gm25700-201ENSMUST00000177693 110 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Pagr1bF6V0H0 Mir7221-201ENSMUST00000184009 72 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Pagr1bF6V0H0 Cdc34-208ENSMUST00000219791 799 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pagr1bF6V0H0 Pxt1-201ENSMUST00000051526 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pagr1bF6V0H0 Ccdc70-202ENSMUST00000070649 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pagr1bF6V0H0 Gm10131-201ENSMUST00000080152 736 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pagr1bF6V0H0 Zfp541-202ENSMUST00000209369 4879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pagr1bF6V0H0 Gm12626-201ENSMUST00000117339 1983 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Pagr1bF6V0H0 Gm12623-201ENSMUST00000119849 1983 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Pagr1bF6V0H0 Zyx-201ENSMUST00000070635 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pagr1bF6V0H0 Rcsd1-202ENSMUST00000097474 5001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pagr1bF6V0H0 Igsf23-204ENSMUST00000208974 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pagr1bF6V0H0 6430550D23Rik-201ENSMUST00000086145 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pagr1bF6V0H0 Enpp5-203ENSMUST00000154166 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pagr1bF6V0H0 Mrpl50-201ENSMUST00000057829 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pagr1bF6V0H0 Gm5846-201ENSMUST00000193146 1414 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Pagr1bF6V0H0 Sema4b-201ENSMUST00000032754 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pagr1bF6V0H0 Fnbp4-201ENSMUST00000013759 4691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pagr1bF6V0H0 Max-201ENSMUST00000082136 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pagr1bF6V0H0 2900069G24Rik-201ENSMUST00000192780 1311 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Pagr1bF6V0H0 Cd27-201ENSMUST00000032486 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pagr1bF6V0H0 Edem3-203ENSMUST00000188145 3262 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pagr1bF6V0H0 Jmjd8-201ENSMUST00000026832 2091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pagr1bF6V0H0 Yeats2-201ENSMUST00000090052 5997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pagr1bF6V0H0 Rabggtb-201ENSMUST00000089950 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pagr1bF6V0H0 Adamtsl4-202ENSMUST00000117782 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pagr1bF6V0H0 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pagr1bF6V0H0 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pagr1bF6V0H0 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pagr1bF6V0H0 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pagr1bF6V0H0 Tmsb10-201ENSMUST00000114048 623 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pagr1bF6V0H0 Gm26361-201ENSMUST00000158868 186 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Pagr1bF6V0H0 2010010A06Rik-201ENSMUST00000185628 258 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Pagr1bF6V0H0 Gm28287-201ENSMUST00000186612 546 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pagr1bF6V0H0 Gm44405-201ENSMUST00000198952 126 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Pagr1bF6V0H0 Gm35082-201ENSMUST00000207308 338 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pagr1bF6V0H0 Gm33175-201ENSMUST00000211562 461 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pagr1bF6V0H0 Gm8712-201ENSMUST00000221090 701 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Pagr1bF6V0H0 Abhd11os-203ENSMUST00000222613 363 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Pagr1bF6V0H0 4921530L21Rik-202ENSMUST00000228913 1115 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pagr1bF6V0H0 Tmem14a-202ENSMUST00000027065 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pagr1bF6V0H0 Med27-201ENSMUST00000028139 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pagr1bF6V0H0 Pfkfb3-212ENSMUST00000170196 2163 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pagr1bF6V0H0 Gdap1l1-202ENSMUST00000109420 2475 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pagr1bF6V0H0 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pagr1bF6V0H0 Kcnt1-204ENSMUST00000114176 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pagr1bF6V0H0 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pagr1bF6V0H0 Gtf2f1-201ENSMUST00000002733 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pagr1bF6V0H0 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pagr1bF6V0H0 Ptbp2-201ENSMUST00000029780 3364 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pagr1bF6V0H0 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pagr1bF6V0H0 Bcat1-202ENSMUST00000048252 1642 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pagr1bF6V0H0 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pagr1bF6V0H0 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pagr1bF6V0H0 Adamts7-208ENSMUST00000167122 5338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pagr1bF6V0H0 Pla2g2f-201ENSMUST00000030526 2465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pagr1bF6V0H0 Grm6-201ENSMUST00000000631 4291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pagr1bF6V0H0 Cyp4f17-201ENSMUST00000165999 1693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pagr1bF6V0H0 Hif3a-202ENSMUST00000108492 6402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pagr1bF6V0H0 Gm42878-202ENSMUST00000200170 4783 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pagr1bF6V0H0 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pagr1bF6V0H0 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pagr1bF6V0H0 Serpinb2-202ENSMUST00000064916 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.5 ms