Protein–RNA interactions for Protein: E9Q548

Gm20518, Predicted gene 20518, mousemouse

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Length 580 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20518E9Q548 Kmt5b-205ENSMUST00000113972 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm20518E9Q548 Cacna1c-225ENSMUST00000219223 7483 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm20518E9Q548 Otub2-201ENSMUST00000021620 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm20518E9Q548 Twistnb-201ENSMUST00000020877 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm20518E9Q548 Syngr2-202ENSMUST00000120928 1402 ntTSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm20518E9Q548 Fn1-211ENSMUST00000187938 7965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm20518E9Q548 Arhgef2-219ENSMUST00000176500 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm20518E9Q548 Pphln1-203ENSMUST00000109256 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm20518E9Q548 Slc29a2-201ENSMUST00000025826 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm20518E9Q548 Olfr533-204ENSMUST00000216258 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm20518E9Q548 Erg-201ENSMUST00000077773 2232 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm20518E9Q548 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm20518E9Q548 Ctbs-201ENSMUST00000029840 2629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm20518E9Q548 Tbc1d16-201ENSMUST00000036113 6986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm20518E9Q548 Gm44401-201ENSMUST00000204462 2375 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm20518E9Q548 Bcl2l1-202ENSMUST00000109820 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm20518E9Q548 Foxb1-201ENSMUST00000071281 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm20518E9Q548 Krt40-201ENSMUST00000074253 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm20518E9Q548 Tulp2-201ENSMUST00000024233 1749 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm20518E9Q548 Ngly1-207ENSMUST00000224656 2329 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm20518E9Q548 Gdf6-201ENSMUST00000057613 3532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm20518E9Q548 Ahdc1-201ENSMUST00000044521 6105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm20518E9Q548 Tmem39a-201ENSMUST00000002924 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm20518E9Q548 Acad12-202ENSMUST00000111776 2269 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm20518E9Q548 Camk2b-206ENSMUST00000101585 1650 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm20518E9Q548 Chchd10-203ENSMUST00000219839 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm20518E9Q548 AC122371.1-201ENSMUST00000220876 1477 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
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Gm20518E9Q548 Agbl3-203ENSMUST00000115014 805 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
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Gm20518E9Q548 H2afb1-201ENSMUST00000122446 348 ntAPPRIS P1 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm20518E9Q548 Gm11592-201ENSMUST00000133160 637 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm20518E9Q548 Oprm1-229ENSMUST00000152674 1179 ntTSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm20518E9Q548 Gm8810-201ENSMUST00000172895 754 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
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Gm20518E9Q548 Gm44799-201ENSMUST00000207639 1202 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
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Gm20518E9Q548 Rpl36-201ENSMUST00000080492 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm20518E9Q548 AC117194.1-201ENSMUST00000224847 3002 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
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Gm20518E9Q548 1700128E19Rik-201ENSMUST00000134409 2439 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm20518E9Q548 Alas1-201ENSMUST00000074082 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm20518E9Q548 Psmb9-204ENSMUST00000174576 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm20518E9Q548 Naaladl1-201ENSMUST00000044451 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm20518E9Q548 Map3k12-201ENSMUST00000023812 5182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm20518E9Q548 4933415J04Rik-201ENSMUST00000195895 1301 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm20518E9Q548 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm20518E9Q548 Zfp862-ps-204ENSMUST00000204484 6065 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm20518E9Q548 Llgl2-201ENSMUST00000103032 3551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
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Gm20518E9Q548 Vps4b-202ENSMUST00000112736 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm20518E9Q548 Rpl38-204ENSMUST00000106602 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm20518E9Q548 Mapkapk5-205ENSMUST00000111786 975 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm20518E9Q548 Rhox2b-201ENSMUST00000115191 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
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Gm20518E9Q548 Usp19-203ENSMUST00000166103 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
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Gm20518E9Q548 Acoxl-202ENSMUST00000110344 1573 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
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Gm20518E9Q548 Dpp8-201ENSMUST00000034960 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm20518E9Q548 Adamts16-201ENSMUST00000080145 4981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm20518E9Q548 Hnf1b-203ENSMUST00000108114 2659 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm20518E9Q548 Rbm11-203ENSMUST00000114253 2699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm20518E9Q548 Myh7-204ENSMUST00000168485 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm20518E9Q548 Sfpq-201ENSMUST00000030623 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm20518E9Q548 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm20518E9Q548 Gm26616-202ENSMUST00000195676 3107 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm20518E9Q548 Proser3-202ENSMUST00000108165 2466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm20518E9Q548 Cd34-201ENSMUST00000016638 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm20518E9Q548 Proser3-206ENSMUST00000215288 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm20518E9Q548 Dcun1d3-206ENSMUST00000207233 2917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm20518E9Q548 Trip4-201ENSMUST00000117083 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm20518E9Q548 Ptpn7-203ENSMUST00000187985 1990 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm20518E9Q548 Add2-202ENSMUST00000203196 1970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm20518E9Q548 Gm14342-201ENSMUST00000137629 2119 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm20518E9Q548 Gm36356-201ENSMUST00000209224 2277 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm20518E9Q548 Gm13050-201ENSMUST00000122149 1345 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm20518E9Q548 Kif13a-201ENSMUST00000056978 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm20518E9Q548 Max-201ENSMUST00000082136 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm20518E9Q548 Pianp-207ENSMUST00000162170 2053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
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