Protein–RNA interactions for Protein: E9Q3H4

Susd1, Sushi domain-containing 1, mousemouse

Predictions only

Length 752 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Susd1E9Q3H4 4930458D05Rik-201ENSMUST00000142871 3055 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Susd1E9Q3H4 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Susd1E9Q3H4 Creb3l3-201ENSMUST00000117422 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Susd1E9Q3H4 Arhgap10-202ENSMUST00000210519 2295 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Susd1E9Q3H4 Usp10-210ENSMUST00000144458 3726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Susd1E9Q3H4 Rtkn2-203ENSMUST00000117086 2246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Susd1E9Q3H4 Itgal-201ENSMUST00000106306 5195 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Susd1E9Q3H4 Plin3-201ENSMUST00000019726 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Susd1E9Q3H4 Epb41l5-208ENSMUST00000191046 6870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Susd1E9Q3H4 Myh14-203ENSMUST00000107900 6400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Susd1E9Q3H4 Riox2-203ENSMUST00000120674 1753 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Susd1E9Q3H4 Fastkd3-201ENSMUST00000051784 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Susd1E9Q3H4 AC101945.2-201ENSMUST00000227886 1377 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Susd1E9Q3H4 Col22a1-202ENSMUST00000159993 8809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Susd1E9Q3H4 Bak1-202ENSMUST00000078691 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Susd1E9Q3H4 Apol6-201ENSMUST00000127957 2034 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Susd1E9Q3H4 Camk2b-206ENSMUST00000101585 1650 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Susd1E9Q3H4 Itga3-203ENSMUST00000120375 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Susd1E9Q3H4 Zfp207-206ENSMUST00000165565 2311 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Susd1E9Q3H4 Hyal1-204ENSMUST00000144392 1332 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Susd1E9Q3H4 Renbp-209ENSMUST00000155597 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Susd1E9Q3H4 Sumf2-204ENSMUST00000171300 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Susd1E9Q3H4 G2e3-201ENSMUST00000054308 6803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Susd1E9Q3H4 Gpat3-201ENSMUST00000031255 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Susd1E9Q3H4 Lims1-203ENSMUST00000105468 1205 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Susd1E9Q3H4 Rpl38-204ENSMUST00000106602 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Susd1E9Q3H4 Ngf-202ENSMUST00000106925 1187 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Susd1E9Q3H4 Med28-203ENSMUST00000119579 636 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Susd1E9Q3H4 Gm11803-201ENSMUST00000119966 444 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Susd1E9Q3H4 Chchd7-207ENSMUST00000121210 548 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Susd1E9Q3H4 Gm13112-201ENSMUST00000138795 1258 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Susd1E9Q3H4 Klk12-201ENSMUST00000014063 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Susd1E9Q3H4 4932443L11Rik-201ENSMUST00000148353 414 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Susd1E9Q3H4 6030498E09Rik-202ENSMUST00000168144 510 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Susd1E9Q3H4 Grp-202ENSMUST00000173530 617 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Susd1E9Q3H4 2610306M01Rik-201ENSMUST00000185414 1042 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Susd1E9Q3H4 Gm38411-201ENSMUST00000197971 941 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Susd1E9Q3H4 Gm7067-201ENSMUST00000207698 1249 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Susd1E9Q3H4 Gm45564-201ENSMUST00000210460 530 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Susd1E9Q3H4 Gstt2-203ENSMUST00000218500 794 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Susd1E9Q3H4 Mrps17-201ENSMUST00000042191 832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Susd1E9Q3H4 H2afv-201ENSMUST00000093346 519 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Susd1E9Q3H4 Camkmt-201ENSMUST00000095188 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Susd1E9Q3H4 Zfp595-205ENSMUST00000171466 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Susd1E9Q3H4 Erlin1-206ENSMUST00000170801 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Susd1E9Q3H4 Kiss1r-201ENSMUST00000045529 3163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Susd1E9Q3H4 Gm14149-201ENSMUST00000123048 1853 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Susd1E9Q3H4 Cebpd-201ENSMUST00000096232 3746 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Susd1E9Q3H4 Ppp1r16b-201ENSMUST00000045503 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Susd1E9Q3H4 Msh6-201ENSMUST00000005503 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Susd1E9Q3H4 Nfkb1-206ENSMUST00000164430 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Susd1E9Q3H4 Chchd10-203ENSMUST00000219839 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Susd1E9Q3H4 Tfe3-206ENSMUST00000115679 3239 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Susd1E9Q3H4 Ndufaf7-201ENSMUST00000024887 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Susd1E9Q3H4 Prss47-204ENSMUST00000222769 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Susd1E9Q3H4 Cpeb1-201ENSMUST00000098331 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Susd1E9Q3H4 Usp19-203ENSMUST00000166103 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Susd1E9Q3H4 Zap70-201ENSMUST00000027291 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Susd1E9Q3H4 Per2-201ENSMUST00000069620 5833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Susd1E9Q3H4 Rtn4-203ENSMUST00000102841 4060 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Susd1E9Q3H4 2610001J05Rik-203ENSMUST00000185219 1606 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Susd1E9Q3H4 Pgpep1-201ENSMUST00000070173 4883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Susd1E9Q3H4 1700128E19Rik-201ENSMUST00000134409 2439 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Susd1E9Q3H4 Crybg1-202ENSMUST00000200401 7525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Susd1E9Q3H4 Gm13050-201ENSMUST00000122149 1345 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Susd1E9Q3H4 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Susd1E9Q3H4 Gm5592-202ENSMUST00000206490 2623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Susd1E9Q3H4 Neu2-204ENSMUST00000165109 1824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Susd1E9Q3H4 Zbtb32-201ENSMUST00000108150 854 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Susd1E9Q3H4 Gm11424-201ENSMUST00000121929 829 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Susd1E9Q3H4 Gm12945-201ENSMUST00000140080 674 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Susd1E9Q3H4 Dpy30-202ENSMUST00000164832 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Susd1E9Q3H4 Gm37922-201ENSMUST00000195596 455 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Susd1E9Q3H4 Dnd1-ps-201ENSMUST00000196992 964 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Susd1E9Q3H4 AC138604.1-201ENSMUST00000226969 739 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Susd1E9Q3H4 Bcdin3d-201ENSMUST00000040313 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Susd1E9Q3H4 Plaur-201ENSMUST00000002284 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Susd1E9Q3H4 Ankrd61-203ENSMUST00000110718 1774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Susd1E9Q3H4 Gm45743-201ENSMUST00000212701 2795 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Susd1E9Q3H4 Ccdc162-208ENSMUST00000179614 2739 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Susd1E9Q3H4 2900089D17Rik-201ENSMUST00000124015 2475 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Susd1E9Q3H4 Ugt1a8-201ENSMUST00000113139 2227 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Susd1E9Q3H4 D6Ertd527e-203ENSMUST00000203747 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Susd1E9Q3H4 Prok2-203ENSMUST00000101120 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Susd1E9Q3H4 Zc3h4-202ENSMUST00000209289 5853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Susd1E9Q3H4 Ptpn14-201ENSMUST00000027898 2666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Susd1E9Q3H4 Gm10561-201ENSMUST00000181563 1943 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Susd1E9Q3H4 Olfr1411-203ENSMUST00000216444 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Susd1E9Q3H4 Def8-203ENSMUST00000093049 1909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Susd1E9Q3H4 Pde1c-209ENSMUST00000203372 3147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Susd1E9Q3H4 Tacc3-202ENSMUST00000079534 2899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Susd1E9Q3H4 Bscl2-203ENSMUST00000159634 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Susd1E9Q3H4 Ngly1-207ENSMUST00000224656 2329 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Susd1E9Q3H4 Mul1-202ENSMUST00000105813 3944 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Susd1E9Q3H4 Gm5989-201ENSMUST00000096092 2077 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Susd1E9Q3H4 Ocrl-203ENSMUST00000115020 3210 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Susd1E9Q3H4 Gm36745-201ENSMUST00000213455 1594 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Susd1E9Q3H4 Duoxa2-201ENSMUST00000028656 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Susd1E9Q3H4 Cpa1-201ENSMUST00000031806 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Susd1E9Q3H4 Ccdc94-201ENSMUST00000086869 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.2 ms