Protein–RNA interactions for Protein: E9Q035

Gm20425, Predicted gene 20425, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 978 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20425E9Q035 Pdcd6ip-201ENSMUST00000035086 5951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm20425E9Q035 Phactr2-201ENSMUST00000079698 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Gm20425E9Q035 4933417C20Rik-201ENSMUST00000193962 1874 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Gm20425E9Q035 F3-201ENSMUST00000029771 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm20425E9Q035 Kdm2b-204ENSMUST00000118027 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Gm20425E9Q035 Tnpo2-202ENSMUST00000166592 4884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Gm20425E9Q035 Gm36500-201ENSMUST00000221821 1626 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Gm20425E9Q035 Hck-204ENSMUST00000191431 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm20425E9Q035 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm20425E9Q035 Ube2j2-204ENSMUST00000105582 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm20425E9Q035 Gm18222-201ENSMUST00000202416 1387 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Gm20425E9Q035 Gm12203-201ENSMUST00000118235 598 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Gm20425E9Q035 Gm12209-201ENSMUST00000120089 596 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Gm20425E9Q035 Gm15635-202ENSMUST00000131160 917 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Gm20425E9Q035 A330102I10Rik-202ENSMUST00000140415 682 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm20425E9Q035 Gm11752-201ENSMUST00000143291 510 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Gm20425E9Q035 Crb3-204ENSMUST00000163763 868 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Gm20425E9Q035 Gm5370-201ENSMUST00000187187 574 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Gm20425E9Q035 Sox2ot-208ENSMUST00000197103 802 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Gm20425E9Q035 Gm43818-201ENSMUST00000200605 466 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Gm20425E9Q035 Spc24-204ENSMUST00000216057 627 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm20425E9Q035 Majin-201ENSMUST00000025699 1239 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm20425E9Q035 9430041J12Rik-201ENSMUST00000050989 534 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Gm20425E9Q035 Aatk-201ENSMUST00000064307 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm20425E9Q035 Ddx19b-202ENSMUST00000065784 3104 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm20425E9Q035 Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 2935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm20425E9Q035 Klc2-202ENSMUST00000113727 2874 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Gm20425E9Q035 Ccdc22-201ENSMUST00000033483 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm20425E9Q035 Arhgap10-202ENSMUST00000210519 2295 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm20425E9Q035 Cttnbp2nl-202ENSMUST00000098763 4834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm20425E9Q035 Tufm-202ENSMUST00000106392 1754 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Gm20425E9Q035 Ercc5-201ENSMUST00000027214 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm20425E9Q035 Asic3-202ENSMUST00000196296 1593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Gm20425E9Q035 Syngr2-201ENSMUST00000026649 1520 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm20425E9Q035 Cngb1-201ENSMUST00000093268 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm20425E9Q035 Afap1l1-201ENSMUST00000120472 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm20425E9Q035 Gm36445-201ENSMUST00000209344 1432 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Gm20425E9Q035 Prss47-204ENSMUST00000222769 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Gm20425E9Q035 Alkbh3-202ENSMUST00000111240 1395 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Gm20425E9Q035 Polr3e-202ENSMUST00000106483 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Gm20425E9Q035 Zfp157-202ENSMUST00000100524 869 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Gm20425E9Q035 Rhox2b-201ENSMUST00000115191 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm20425E9Q035 Gm12539-201ENSMUST00000121549 1098 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Gm20425E9Q035 4933427G23Rik-202ENSMUST00000126393 544 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Gm20425E9Q035 Rdh18-ps-201ENSMUST00000137395 944 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Gm20425E9Q035 P2rx4-204ENSMUST00000139631 1030 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Gm20425E9Q035 P2rx4-206ENSMUST00000142664 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm20425E9Q035 Rdh18-ps-202ENSMUST00000143917 953 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm20425E9Q035 Dnm3os-203ENSMUST00000185878 557 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Gm20425E9Q035 Myl10-202ENSMUST00000196068 911 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm20425E9Q035 Myl10-203ENSMUST00000196436 598 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Gm20425E9Q035 Dnd1-ps-201ENSMUST00000196992 964 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Gm20425E9Q035 Mrto4-ps1-201ENSMUST00000220565 721 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Gm20425E9Q035 Gm2824-203ENSMUST00000226189 1228 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Gm20425E9Q035 Upk2-201ENSMUST00000047740 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm20425E9Q035 Gm9823-201ENSMUST00000051212 327 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Gm20425E9Q035 Efr3a-205ENSMUST00000173858 2848 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm20425E9Q035 Ebf1-202ENSMUST00000101326 3422 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm20425E9Q035 Klhdc7b-201ENSMUST00000166926 1818 ntAPPRIS P2 BASIC15.03■□□□□ -0
Gm20425E9Q035 Tbc1d22a-201ENSMUST00000063414 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm20425E9Q035 Gadl1-203ENSMUST00000121770 1763 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Gm20425E9Q035 Srr-202ENSMUST00000108447 3138 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Gm20425E9Q035 Gm28551-201ENSMUST00000144660 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm20425E9Q035 Ppp4r3b-202ENSMUST00000102856 2410 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm20425E9Q035 Gm16090-201ENSMUST00000130296 1704 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm20425E9Q035 Gm33543-203ENSMUST00000211096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Gm20425E9Q035 Pitpnm2-204ENSMUST00000159677 1690 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Gm20425E9Q035 Tcf4-230ENSMUST00000201205 2270 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Gm20425E9Q035 Pir-201ENSMUST00000033749 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gm20425E9Q035 Calcr-204ENSMUST00000170266 2175 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gm20425E9Q035 Fgfr3-215ENSMUST00000202138 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gm20425E9Q035 4931414P19Rik-201ENSMUST00000022786 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gm20425E9Q035 Actc1-201ENSMUST00000090269 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gm20425E9Q035 Phactr3-201ENSMUST00000103065 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gm20425E9Q035 Elp4-202ENSMUST00000122965 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gm20425E9Q035 Spock3-201ENSMUST00000093480 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Gm20425E9Q035 Rnf185-201ENSMUST00000064364 2906 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gm20425E9Q035 Ccdc94-201ENSMUST00000086869 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gm20425E9Q035 Sirt2-202ENSMUST00000122915 1828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gm20425E9Q035 Capn9-201ENSMUST00000093033 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gm20425E9Q035 Spatc1l-202ENSMUST00000105414 1060 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gm20425E9Q035 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gm20425E9Q035 Gm13369-201ENSMUST00000119442 987 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Gm20425E9Q035 Gm16315-201ENSMUST00000163009 783 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Gm20425E9Q035 Prr13-204ENSMUST00000164957 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gm20425E9Q035 Gm27331-201ENSMUST00000183705 60 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Gm20425E9Q035 Net1-207ENSMUST00000223258 597 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gm20425E9Q035 AC154171.1-201ENSMUST00000224610 643 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Gm20425E9Q035 Rrp36-201ENSMUST00000024766 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gm20425E9Q035 Ddo-203ENSMUST00000213503 1759 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Gm20425E9Q035 Flcn-202ENSMUST00000091246 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Gm20425E9Q035 Pik3cd-205ENSMUST00000118704 4894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Gm20425E9Q035 Lrp1-202ENSMUST00000118455 2097 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Gm20425E9Q035 Gm45253-201ENSMUST00000210694 2076 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Gm20425E9Q035 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Gm20425E9Q035 Gm14608-201ENSMUST00000120030 1553 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
Gm20425E9Q035 Fetub-201ENSMUST00000023587 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Gm20425E9Q035 Arl14ep-201ENSMUST00000028536 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Gm20425E9Q035 Rbbp5-207ENSMUST00000190997 2856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Gm20425E9Q035 Fzd1-201ENSMUST00000054294 4197 ntAPPRIS P1 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.6 ms