Protein–RNA interactions for Protein: E9PZQ0

Ryr1, Ryanodine receptor 1, mousemouse

Predictions only

Length 5,035 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ryr1E9PZQ0 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC8□□□□□ -1.13
Ryr1E9PZQ0 Gas5-224ENSMUST00000162558 502 ntTSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
Ryr1E9PZQ0 Gm42617-201ENSMUST00000197640 1229 ntBASIC8□□□□□ -1.13
Ryr1E9PZQ0 Gm5291-201ENSMUST00000201965 899 ntBASIC8□□□□□ -1.13
Ryr1E9PZQ0 AC102312.1-202ENSMUST00000218600 851 ntTSL 2 BASIC8□□□□□ -1.13
Ryr1E9PZQ0 AI463170-204ENSMUST00000220157 447 ntTSL 3 BASIC8□□□□□ -1.13
Ryr1E9PZQ0 Taar7f-201ENSMUST00000071691 1077 ntAPPRIS P1 BASIC8□□□□□ -1.13
Ryr1E9PZQ0 Taar7d-201ENSMUST00000092657 1077 ntAPPRIS P1 BASIC8□□□□□ -1.13
Ryr1E9PZQ0 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8□□□□□ -1.13
Ryr1E9PZQ0 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
Ryr1E9PZQ0 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC8□□□□□ -1.13
Ryr1E9PZQ0 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
Ryr1E9PZQ0 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
Ryr1E9PZQ0 Gm45012-201ENSMUST00000208323 1666 ntTSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
Ryr1E9PZQ0 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
Ryr1E9PZQ0 Cep89-201ENSMUST00000079414 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
Ryr1E9PZQ0 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
Ryr1E9PZQ0 Arfgap1-204ENSMUST00000108861 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
Ryr1E9PZQ0 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
Ryr1E9PZQ0 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
Ryr1E9PZQ0 Gm15196-201ENSMUST00000121406 482 ntBASIC8□□□□□ -1.13
Ryr1E9PZQ0 Msrb3-202ENSMUST00000130950 561 ntTSL 3 BASIC8□□□□□ -1.13
Ryr1E9PZQ0 Gm8494-201ENSMUST00000178171 1233 ntBASIC8□□□□□ -1.13
Ryr1E9PZQ0 Ing5-203ENSMUST00000190476 918 ntTSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
Ryr1E9PZQ0 AC153954.1-201ENSMUST00000216959 255 ntBASIC8□□□□□ -1.13
Ryr1E9PZQ0 CT009539.1-201ENSMUST00000226465 220 ntBASIC8□□□□□ -1.13
Ryr1E9PZQ0 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
Ryr1E9PZQ0 Gm9072-201ENSMUST00000218390 1514 ntBASIC8□□□□□ -1.13
Ryr1E9PZQ0 Lrrc74b-202ENSMUST00000065125 1539 ntTSL 2 BASIC8□□□□□ -1.13
Ryr1E9PZQ0 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC8□□□□□ -1.13
Ryr1E9PZQ0 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
Ryr1E9PZQ0 Slc40a1-201ENSMUST00000027137 3370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
Ryr1E9PZQ0 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
Ryr1E9PZQ0 Nde1-203ENSMUST00000117958 1551 ntTSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
Ryr1E9PZQ0 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
Ryr1E9PZQ0 2300003K06Rik-201ENSMUST00000105054 1265 ntAPPRIS P1 BASIC8□□□□□ -1.13
Ryr1E9PZQ0 Gm14152-201ENSMUST00000127020 1073 ntTSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
Ryr1E9PZQ0 Atad3aos-204ENSMUST00000174185 482 ntTSL 3 BASIC8□□□□□ -1.13
Ryr1E9PZQ0 Mir3100-201ENSMUST00000174918 65 ntBASIC8□□□□□ -1.13
Ryr1E9PZQ0 Gm35549-202ENSMUST00000203656 1009 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8□□□□□ -1.13
Ryr1E9PZQ0 9430078K24Rik-201ENSMUST00000218818 1082 ntTSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
Ryr1E9PZQ0 Slc25a21-205ENSMUST00000217690 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
Ryr1E9PZQ0 Lgals12-203ENSMUST00000159983 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
Ryr1E9PZQ0 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
Ryr1E9PZQ0 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC8□□□□□ -1.13
Ryr1E9PZQ0 Acoxl-202ENSMUST00000110344 1573 ntTSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
Ryr1E9PZQ0 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8□□□□□ -1.13
Ryr1E9PZQ0 Gm11476-201ENSMUST00000127006 2019 ntTSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
Ryr1E9PZQ0 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
Ryr1E9PZQ0 Gm13117-201ENSMUST00000120894 691 ntBASIC8□□□□□ -1.13
Ryr1E9PZQ0 Elobl-203ENSMUST00000121228 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8□□□□□ -1.13
Ryr1E9PZQ0 Gm15221-201ENSMUST00000144439 414 ntTSL 3 BASIC8□□□□□ -1.13
Ryr1E9PZQ0 Pla2g1b-204ENSMUST00000145785 419 ntTSL 5 BASIC8□□□□□ -1.13
Ryr1E9PZQ0 Gm20400-201ENSMUST00000173695 665 ntTSL 3 BASIC8□□□□□ -1.13
Ryr1E9PZQ0 Mir3091-201ENSMUST00000175086 76 ntBASIC8□□□□□ -1.13
Ryr1E9PZQ0 1500015A07Rik-202ENSMUST00000184530 423 ntTSL 3 BASIC8□□□□□ -1.13
Ryr1E9PZQ0 Try5-201ENSMUST00000064324 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
Ryr1E9PZQ0 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Ryr1E9PZQ0 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
Ryr1E9PZQ0 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.99□□□□□ -1.13
Ryr1E9PZQ0 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
Ryr1E9PZQ0 Mir1941-201ENSMUST00000157834 83 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
Ryr1E9PZQ0 Gm28139-201ENSMUST00000189480 643 ntTSL 5 BASIC7.99□□□□□ -1.13
Ryr1E9PZQ0 Tbc1d24-211ENSMUST00000201583 893 ntTSL 5 BASIC7.99□□□□□ -1.13
Ryr1E9PZQ0 4933421D24Rik-201ENSMUST00000209302 1286 ntTSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Ryr1E9PZQ0 AC103672.1-201ENSMUST00000227502 365 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
Ryr1E9PZQ0 Itpa-201ENSMUST00000103193 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Ryr1E9PZQ0 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Ryr1E9PZQ0 1110034G24Rik-202ENSMUST00000110132 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Ryr1E9PZQ0 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Ryr1E9PZQ0 Ms4a15-201ENSMUST00000087923 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Ryr1E9PZQ0 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Ryr1E9PZQ0 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Ryr1E9PZQ0 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC7.99□□□□□ -1.13
Ryr1E9PZQ0 CT009489.1-201ENSMUST00000227740 1893 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
Ryr1E9PZQ0 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Ryr1E9PZQ0 Defa33-201ENSMUST00000120874 426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Ryr1E9PZQ0 Mir1905-201ENSMUST00000122779 82 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
Ryr1E9PZQ0 Hmgn2-208ENSMUST00000136327 772 ntTSL 2 BASIC7.99□□□□□ -1.13
Ryr1E9PZQ0 Defa2-201ENSMUST00000170275 426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Ryr1E9PZQ0 Lsm5-201ENSMUST00000170382 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Ryr1E9PZQ0 4930505M18Rik-201ENSMUST00000175854 1288 ntTSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Ryr1E9PZQ0 Gm29483-201ENSMUST00000188188 1078 ntTSL 3 BASIC7.99□□□□□ -1.13
Ryr1E9PZQ0 Gm38297-201ENSMUST00000195122 1057 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
Ryr1E9PZQ0 Gm9736-201ENSMUST00000219969 834 ntAPPRIS P1 BASIC7.99□□□□□ -1.13
Ryr1E9PZQ0 AC167013.1-201ENSMUST00000228592 202 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
Ryr1E9PZQ0 Il25-201ENSMUST00000037863 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Ryr1E9PZQ0 Cypt2-201ENSMUST00000041758 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Ryr1E9PZQ0 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Ryr1E9PZQ0 Klhdc7b-201ENSMUST00000166926 1818 ntAPPRIS P2 BASIC7.99□□□□□ -1.13
Ryr1E9PZQ0 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Ryr1E9PZQ0 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Ryr1E9PZQ0 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC7.99□□□□□ -1.13
Ryr1E9PZQ0 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.99□□□□□ -1.13
Ryr1E9PZQ0 Tbc1d8-204ENSMUST00000193823 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Ryr1E9PZQ0 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Ryr1E9PZQ0 Drd3-201ENSMUST00000023390 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Ryr1E9PZQ0 Pla2g15-204ENSMUST00000212963 2578 ntTSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Ryr1E9PZQ0 AC154354.1-203ENSMUST00000225565 1364 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
Ryr1E9PZQ0 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.1 ms