Protein–RNA interactions for Protein: E9PWG2

Trappc8, Trafficking protein particle complex 8, mousemouse

Predictions only

Length 1,437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc8E9PWG2 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Trappc8E9PWG2 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Trappc8E9PWG2 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Trappc8E9PWG2 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Trappc8E9PWG2 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Trappc8E9PWG2 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Trappc8E9PWG2 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Trappc8E9PWG2 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Trappc8E9PWG2 Smc5-202ENSMUST00000223934 3448 ntAPPRIS P2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Trappc8E9PWG2 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Trappc8E9PWG2 Smarcb1-202ENSMUST00000121304 1622 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Trappc8E9PWG2 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Trappc8E9PWG2 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Trappc8E9PWG2 Gm14460-201ENSMUST00000121511 639 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Trappc8E9PWG2 Rpsa-ps4-201ENSMUST00000121691 888 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Trappc8E9PWG2 Rps2-ps4-201ENSMUST00000121977 633 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Trappc8E9PWG2 H1foo-203ENSMUST00000161969 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Trappc8E9PWG2 Scgb1b19-201ENSMUST00000165813 418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Trappc8E9PWG2 Scgb1b3-201ENSMUST00000179481 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Trappc8E9PWG2 Mir6958-201ENSMUST00000184207 73 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Trappc8E9PWG2 Gm29539-201ENSMUST00000188031 758 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Trappc8E9PWG2 1700030I03Rik-201ENSMUST00000192978 942 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Trappc8E9PWG2 Gng8-204ENSMUST00000205716 432 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Trappc8E9PWG2 Gm7600-201ENSMUST00000209657 785 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Trappc8E9PWG2 Neil1-201ENSMUST00000034842 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Trappc8E9PWG2 Cmtm2b-201ENSMUST00000041973 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Trappc8E9PWG2 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Trappc8E9PWG2 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Trappc8E9PWG2 Gm13142-201ENSMUST00000117213 1453 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Trappc8E9PWG2 Nmral1-203ENSMUST00000115851 1306 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Trappc8E9PWG2 Gm21998-201ENSMUST00000117552 1308 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Trappc8E9PWG2 Adh4-201ENSMUST00000013458 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Trappc8E9PWG2 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Trappc8E9PWG2 Lmbr1l-202ENSMUST00000109127 2548 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Trappc8E9PWG2 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Trappc8E9PWG2 Acin1-202ENSMUST00000022794 2365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Trappc8E9PWG2 Cab39-201ENSMUST00000097666 2369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Trappc8E9PWG2 Acbd5-213ENSMUST00000227809 1986 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Trappc8E9PWG2 Gm12915-201ENSMUST00000131381 1499 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Trappc8E9PWG2 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Trappc8E9PWG2 Pcgf2-203ENSMUST00000103149 817 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Trappc8E9PWG2 Gm23596-201ENSMUST00000104304 132 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Trappc8E9PWG2 Aamdc-213ENSMUST00000154853 883 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Trappc8E9PWG2 Gm25881-201ENSMUST00000157783 103 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Trappc8E9PWG2 Gm21859-201ENSMUST00000178424 1045 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Trappc8E9PWG2 1110008E08Rik-202ENSMUST00000183621 723 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Trappc8E9PWG2 Gm5733-201ENSMUST00000190232 939 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Trappc8E9PWG2 Pf4-201ENSMUST00000031320 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Trappc8E9PWG2 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Trappc8E9PWG2 Ctsa-203ENSMUST00000103093 2534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Trappc8E9PWG2 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Trappc8E9PWG2 Amz2-203ENSMUST00000103061 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Trappc8E9PWG2 Pgbd5-203ENSMUST00000136892 1739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Trappc8E9PWG2 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Trappc8E9PWG2 Gm36500-201ENSMUST00000221821 1626 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Trappc8E9PWG2 Oprm1-215ENSMUST00000105607 2369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Trappc8E9PWG2 Gm44401-201ENSMUST00000204462 2375 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Trappc8E9PWG2 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Trappc8E9PWG2 Slc7a6-201ENSMUST00000034378 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Trappc8E9PWG2 Lrriq4-201ENSMUST00000108265 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Trappc8E9PWG2 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Trappc8E9PWG2 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Trappc8E9PWG2 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Trappc8E9PWG2 Oraov1-201ENSMUST00000033388 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Trappc8E9PWG2 Gm14150-201ENSMUST00000122404 1354 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
Trappc8E9PWG2 Snrpn-201ENSMUST00000059305 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Trappc8E9PWG2 Anxa11-201ENSMUST00000022416 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Trappc8E9PWG2 Got2-ps1-201ENSMUST00000121655 1293 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
Trappc8E9PWG2 Gm16195-201ENSMUST00000130607 442 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Trappc8E9PWG2 A430050A11Rik-201ENSMUST00000195348 646 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
Trappc8E9PWG2 Gm43058-201ENSMUST00000197645 625 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
Trappc8E9PWG2 Gm43050-202ENSMUST00000201152 651 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Trappc8E9PWG2 Gm10069-203ENSMUST00000204081 907 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Trappc8E9PWG2 8030455M16Rik-201ENSMUST00000213014 902 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Trappc8E9PWG2 AC138604.1-201ENSMUST00000226969 739 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
Trappc8E9PWG2 Sst-201ENSMUST00000004480 599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Trappc8E9PWG2 0610040F04Rik-201ENSMUST00000137478 1734 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Trappc8E9PWG2 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Trappc8E9PWG2 Il11ra1-203ENSMUST00000108041 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Trappc8E9PWG2 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Trappc8E9PWG2 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Trappc8E9PWG2 Ndc80-201ENSMUST00000024851 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Trappc8E9PWG2 Henmt1-205ENSMUST00000196533 1491 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Trappc8E9PWG2 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Trappc8E9PWG2 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Trappc8E9PWG2 Gpnmb-203ENSMUST00000204260 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Trappc8E9PWG2 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Trappc8E9PWG2 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Trappc8E9PWG2 Calcr-203ENSMUST00000168592 2064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Trappc8E9PWG2 Klk1b16-201ENSMUST00000005933 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Trappc8E9PWG2 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Trappc8E9PWG2 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Trappc8E9PWG2 Gm8617-201ENSMUST00000118796 2222 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Trappc8E9PWG2 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Trappc8E9PWG2 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Trappc8E9PWG2 Gm24934-201ENSMUST00000103764 111 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Trappc8E9PWG2 Tnnt3-206ENSMUST00000105944 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Trappc8E9PWG2 Tnnt3-210ENSMUST00000105948 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Trappc8E9PWG2 Tnnt3-212ENSMUST00000105950 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Trappc8E9PWG2 Gm13888-201ENSMUST00000119148 422 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms