Protein–RNA interactions for Protein: E9PVU2

4931429L15Rik, RIKEN cDNA 4931429L15 gene, mousemouse

Predictions only

Length 379 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4931429L15RikE9PVU2 L1td1-204ENSMUST00000173659 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
4931429L15RikE9PVU2 Iffo2-202ENSMUST00000123827 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
4931429L15RikE9PVU2 Ap1s2-201ENSMUST00000033734 1785 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
4931429L15RikE9PVU2 Toe1-202ENSMUST00000106455 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
4931429L15RikE9PVU2 Gm15917-201ENSMUST00000162771 487 ntTSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
4931429L15RikE9PVU2 Mad2l1bp-201ENSMUST00000171172 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
4931429L15RikE9PVU2 Gm3786-201ENSMUST00000202659 378 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
4931429L15RikE9PVU2 Tm2d2-202ENSMUST00000210536 727 ntTSL 3 BASIC11.78□□□□□ -0.52
4931429L15RikE9PVU2 AC132384.14-201ENSMUST00000219346 1147 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
4931429L15RikE9PVU2 AI463170-204ENSMUST00000220157 447 ntTSL 3 BASIC11.78□□□□□ -0.52
4931429L15RikE9PVU2 AC134254.1-201ENSMUST00000221362 167 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
4931429L15RikE9PVU2 Timm10-201ENSMUST00000028470 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
4931429L15RikE9PVU2 Ctrc-201ENSMUST00000037059 951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
4931429L15RikE9PVU2 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
4931429L15RikE9PVU2 Hps1-208ENSMUST00000162004 2847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
4931429L15RikE9PVU2 Gm15684-201ENSMUST00000160605 1814 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
4931429L15RikE9PVU2 Adcyap1r1-206ENSMUST00000167234 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
4931429L15RikE9PVU2 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
4931429L15RikE9PVU2 Usp13-201ENSMUST00000072312 7580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
4931429L15RikE9PVU2 Lrp2bp-202ENSMUST00000110380 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
4931429L15RikE9PVU2 Tbx4-201ENSMUST00000000096 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
4931429L15RikE9PVU2 Ppp6r3-202ENSMUST00000113997 4952 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
4931429L15RikE9PVU2 Gucy1a2-201ENSMUST00000115733 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
4931429L15RikE9PVU2 Ell3-202ENSMUST00000116432 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
4931429L15RikE9PVU2 Slamf8-201ENSMUST00000065679 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
4931429L15RikE9PVU2 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
4931429L15RikE9PVU2 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
4931429L15RikE9PVU2 Pla2g5-204ENSMUST00000102513 2289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.52
4931429L15RikE9PVU2 Acat2-201ENSMUST00000007005 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
4931429L15RikE9PVU2 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
4931429L15RikE9PVU2 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
4931429L15RikE9PVU2 Gm35721-201ENSMUST00000220294 2014 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.52
4931429L15RikE9PVU2 Ash2l-204ENSMUST00000110610 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
4931429L15RikE9PVU2 Dclk2-206ENSMUST00000193632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.52
4931429L15RikE9PVU2 Riox2-203ENSMUST00000120674 1753 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
4931429L15RikE9PVU2 Ddx46-202ENSMUST00000172272 5676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.52
4931429L15RikE9PVU2 Ddx46-201ENSMUST00000099479 5664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.52
4931429L15RikE9PVU2 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
4931429L15RikE9PVU2 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
4931429L15RikE9PVU2 Gtpbp1-201ENSMUST00000046463 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
4931429L15RikE9PVU2 Eme2-201ENSMUST00000119848 5226 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
4931429L15RikE9PVU2 Ptprk-203ENSMUST00000218359 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
4931429L15RikE9PVU2 Evl-203ENSMUST00000109854 1870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
4931429L15RikE9PVU2 Gm24255-201ENSMUST00000104481 128 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
4931429L15RikE9PVU2 Tomm5-204ENSMUST00000107810 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
4931429L15RikE9PVU2 Gm12749-201ENSMUST00000122138 1159 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
4931429L15RikE9PVU2 Gm2231-201ENSMUST00000125661 612 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
4931429L15RikE9PVU2 Gm15501-201ENSMUST00000133910 849 ntTSL 3 BASIC11.77□□□□□ -0.53
4931429L15RikE9PVU2 Tnni1-205ENSMUST00000148201 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
4931429L15RikE9PVU2 Gm11210-201ENSMUST00000150203 422 ntTSL 3 BASIC11.77□□□□□ -0.53
4931429L15RikE9PVU2 Tnni1-206ENSMUST00000152075 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
4931429L15RikE9PVU2 Tnni1-207ENSMUST00000152208 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
4931429L15RikE9PVU2 4930524O07Rik-201ENSMUST00000161822 1050 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
4931429L15RikE9PVU2 Lsm2-207ENSMUST00000173004 870 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
4931429L15RikE9PVU2 Gm7029-201ENSMUST00000173226 450 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
4931429L15RikE9PVU2 Gm4819-201ENSMUST00000182170 1009 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
4931429L15RikE9PVU2 Gm6621-201ENSMUST00000193251 772 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
4931429L15RikE9PVU2 4933424G06Rik-204ENSMUST00000208994 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
4931429L15RikE9PVU2 Txndc17-201ENSMUST00000021158 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
4931429L15RikE9PVU2 Gm5363-201ENSMUST00000211927 938 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
4931429L15RikE9PVU2 Gm31992-201ENSMUST00000213387 862 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
4931429L15RikE9PVU2 AC160029.2-201ENSMUST00000218285 548 ntTSL 3 BASIC11.77□□□□□ -0.53
4931429L15RikE9PVU2 Gm8227-201ENSMUST00000223306 571 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
4931429L15RikE9PVU2 Tnfrsf4-201ENSMUST00000030952 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
4931429L15RikE9PVU2 Fam173b-201ENSMUST00000042702 1164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
4931429L15RikE9PVU2 Ccl24-201ENSMUST00000004936 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
4931429L15RikE9PVU2 S100a8-201ENSMUST00000069927 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
4931429L15RikE9PVU2 Mtus2-202ENSMUST00000085554 1009 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
4931429L15RikE9PVU2 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
4931429L15RikE9PVU2 Psmd8-207ENSMUST00000209034 1983 ntTSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.53
4931429L15RikE9PVU2 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
4931429L15RikE9PVU2 Smarcb1-201ENSMUST00000000925 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
4931429L15RikE9PVU2 Ubap2l-202ENSMUST00000064639 4073 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
4931429L15RikE9PVU2 Dmbx1-201ENSMUST00000064806 5799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
4931429L15RikE9PVU2 Kif1a-210ENSMUST00000190723 6141 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
4931429L15RikE9PVU2 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
4931429L15RikE9PVU2 Abat-203ENSMUST00000115839 2414 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
4931429L15RikE9PVU2 Gpnmb-203ENSMUST00000204260 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
4931429L15RikE9PVU2 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
4931429L15RikE9PVU2 Hspb7-201ENSMUST00000102486 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
4931429L15RikE9PVU2 Frzb-201ENSMUST00000028389 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
4931429L15RikE9PVU2 Zfp541-202ENSMUST00000209369 4879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
4931429L15RikE9PVU2 Igbp1b-201ENSMUST00000054786 1456 ntAPPRIS P1 BASIC11.76□□□□□ -0.53
4931429L15RikE9PVU2 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
4931429L15RikE9PVU2 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
4931429L15RikE9PVU2 Syne3-203ENSMUST00000109927 5263 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
4931429L15RikE9PVU2 Pdxk-ps-201ENSMUST00000159650 2342 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
4931429L15RikE9PVU2 Noxa1-202ENSMUST00000114373 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
4931429L15RikE9PVU2 Pcdhgb1-201ENSMUST00000192931 4723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
4931429L15RikE9PVU2 Gm43796-201ENSMUST00000202853 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
4931429L15RikE9PVU2 Dcaf4-208ENSMUST00000223291 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
4931429L15RikE9PVU2 Rhbdd3-203ENSMUST00000109878 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
4931429L15RikE9PVU2 Fam83e-201ENSMUST00000129507 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
4931429L15RikE9PVU2 Armcx6-202ENSMUST00000113194 2120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
4931429L15RikE9PVU2 Gm4986-201ENSMUST00000119731 549 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
4931429L15RikE9PVU2 Gm13297-201ENSMUST00000120205 934 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
4931429L15RikE9PVU2 Gm2383-201ENSMUST00000181461 807 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
4931429L15RikE9PVU2 Gm5441-202ENSMUST00000190132 449 ntTSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
4931429L15RikE9PVU2 Gm4610-201ENSMUST00000198222 905 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
4931429L15RikE9PVU2 Gm45720-201ENSMUST00000211881 484 ntTSL 3 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.1 ms