Protein–RNA interactions for Protein: E9PVB3

Ccdc175, Coiled-coil domain-containing protein 175, mousemouse

Predictions only

Length 822 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc175E9PVB3 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccdc175E9PVB3 Gm29455-201ENSMUST00000186504 2659 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccdc175E9PVB3 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccdc175E9PVB3 Mir874-201ENSMUST00000104769 76 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccdc175E9PVB3 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccdc175E9PVB3 Gm30906-201ENSMUST00000219578 535 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccdc175E9PVB3 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccdc175E9PVB3 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccdc175E9PVB3 Gm9797-201ENSMUST00000052902 613 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccdc175E9PVB3 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccdc175E9PVB3 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccdc175E9PVB3 Epb41l2-207ENSMUST00000218903 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccdc175E9PVB3 Drc3-202ENSMUST00000094140 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccdc175E9PVB3 Tcf25-203ENSMUST00000211932 5002 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccdc175E9PVB3 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccdc175E9PVB3 Mid1-215ENSMUST00000171433 2546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccdc175E9PVB3 Ficd-201ENSMUST00000065698 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccdc175E9PVB3 Gm26635-201ENSMUST00000181077 3199 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccdc175E9PVB3 Serpinb12-201ENSMUST00000081277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccdc175E9PVB3 Tns2-201ENSMUST00000046144 4718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccdc175E9PVB3 Lin28a-201ENSMUST00000051674 3505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccdc175E9PVB3 Zrsr2-201ENSMUST00000090840 3867 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccdc175E9PVB3 Iqcm-203ENSMUST00000212704 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccdc175E9PVB3 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccdc175E9PVB3 AC151895.1-201ENSMUST00000219025 1742 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccdc175E9PVB3 Dner-201ENSMUST00000049126 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccdc175E9PVB3 Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccdc175E9PVB3 C030005K06Rik-201ENSMUST00000129164 2076 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ccdc175E9PVB3 Ccdc81-201ENSMUST00000041195 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ccdc175E9PVB3 Mkl1-209ENSMUST00000149582 4366 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ccdc175E9PVB3 Rara-207ENSMUST00000164748 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ccdc175E9PVB3 Tcf12-218ENSMUST00000184783 3489 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ccdc175E9PVB3 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ccdc175E9PVB3 Lmna-201ENSMUST00000029699 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ccdc175E9PVB3 Zfp422-202ENSMUST00000079749 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ccdc175E9PVB3 Accsl-201ENSMUST00000099690 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ccdc175E9PVB3 P4ha1-203ENSMUST00000105466 2918 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ccdc175E9PVB3 Dpysl5-201ENSMUST00000088081 5022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ccdc175E9PVB3 Ajuba-201ENSMUST00000054487 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ccdc175E9PVB3 Mier1-205ENSMUST00000106858 4830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ccdc175E9PVB3 Abcd1-202ENSMUST00000114461 2323 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ccdc175E9PVB3 Dclk2-206ENSMUST00000193632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ccdc175E9PVB3 Gm44851-201ENSMUST00000205735 2309 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Ccdc175E9PVB3 Prr12-201ENSMUST00000057293 7023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ccdc175E9PVB3 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ccdc175E9PVB3 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ccdc175E9PVB3 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ccdc175E9PVB3 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Ccdc175E9PVB3 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ccdc175E9PVB3 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ccdc175E9PVB3 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Ccdc175E9PVB3 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Ccdc175E9PVB3 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ccdc175E9PVB3 Oprm1-205ENSMUST00000078634 1695 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ccdc175E9PVB3 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ccdc175E9PVB3 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ccdc175E9PVB3 Gm13016-201ENSMUST00000126252 1720 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ccdc175E9PVB3 Nop58-201ENSMUST00000027174 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ccdc175E9PVB3 Pnpla6-202ENSMUST00000111070 4496 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ccdc175E9PVB3 Rpl9-204ENSMUST00000127874 2690 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ccdc175E9PVB3 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ccdc175E9PVB3 Xlr-202ENSMUST00000067782 1860 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ccdc175E9PVB3 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ccdc175E9PVB3 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ccdc175E9PVB3 Ppp1r18-205ENSMUST00000187690 3185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ccdc175E9PVB3 0610009O20Rik-201ENSMUST00000025314 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ccdc175E9PVB3 Sema4a-202ENSMUST00000107531 2897 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ccdc175E9PVB3 Sh3bp2-201ENSMUST00000067638 2885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ccdc175E9PVB3 Gm9742-201ENSMUST00000165220 1553 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ccdc175E9PVB3 Ankmy2-201ENSMUST00000041640 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ccdc175E9PVB3 Itgal-202ENSMUST00000117762 5222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ccdc175E9PVB3 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Ccdc175E9PVB3 Cdk11b-201ENSMUST00000067081 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ccdc175E9PVB3 Cpped1-203ENSMUST00000121750 2614 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ccdc175E9PVB3 Slc38a10-216ENSMUST00000179094 4052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ccdc175E9PVB3 Klhl38-201ENSMUST00000022985 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ccdc175E9PVB3 Rnf17-201ENSMUST00000095793 5264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ccdc175E9PVB3 Sgce-204ENSMUST00000115577 1776 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ccdc175E9PVB3 Pfkfb3-220ENSMUST00000192949 4801 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ccdc175E9PVB3 Ppm1l-201ENSMUST00000029355 9417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ccdc175E9PVB3 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ccdc175E9PVB3 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ccdc175E9PVB3 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ccdc175E9PVB3 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ccdc175E9PVB3 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Ccdc175E9PVB3 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ccdc175E9PVB3 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ccdc175E9PVB3 Fuom-201ENSMUST00000026539 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ccdc175E9PVB3 Afmid-201ENSMUST00000073388 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ccdc175E9PVB3 AC087890.1-201ENSMUST00000219321 1823 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ccdc175E9PVB3 Rapgef2-202ENSMUST00000118340 6544 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ccdc175E9PVB3 Il12rb1-201ENSMUST00000000808 2873 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ccdc175E9PVB3 Mmp28-202ENSMUST00000103209 3438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ccdc175E9PVB3 Myo5b-203ENSMUST00000121875 6065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ccdc175E9PVB3 Trim25-203ENSMUST00000107896 5590 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ccdc175E9PVB3 Dtx1-201ENSMUST00000031607 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ccdc175E9PVB3 Kcnt1-212ENSMUST00000197917 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ccdc175E9PVB3 Fam214b-203ENSMUST00000107957 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ccdc175E9PVB3 Foxo6os-201ENSMUST00000152384 2291 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Ccdc175E9PVB3 Armc6-201ENSMUST00000019679 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.4 ms