Protein–RNA interactions for Protein: E9PUP1

Syde2, Synapse defective 1, Rho GTPase, homolog 2 (C. elegans), mousemouse

Predictions only

Length 1,314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syde2E9PUP1 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Syde2E9PUP1 Kdelr1-205ENSMUST00000211716 1350 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Syde2E9PUP1 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Syde2E9PUP1 Myl6-202ENSMUST00000217733 1668 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Syde2E9PUP1 Gm45242-201ENSMUST00000210666 2129 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Syde2E9PUP1 4930470G03Rik-201ENSMUST00000122926 2447 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Syde2E9PUP1 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Syde2E9PUP1 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Syde2E9PUP1 B3gat1-206ENSMUST00000161431 3858 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Syde2E9PUP1 Olfr288-202ENSMUST00000165379 2083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Syde2E9PUP1 Hmga1-203ENSMUST00000117600 1635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Syde2E9PUP1 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Syde2E9PUP1 Mboat2-201ENSMUST00000078902 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Syde2E9PUP1 9030407P20Rik-201ENSMUST00000180933 2310 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Syde2E9PUP1 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Syde2E9PUP1 Armc7-201ENSMUST00000035240 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Syde2E9PUP1 Gm11595-201ENSMUST00000107440 1200 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Syde2E9PUP1 Gm13996-201ENSMUST00000118456 430 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Syde2E9PUP1 Ndufa2-201ENSMUST00000014438 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Syde2E9PUP1 Apoe-208ENSMUST00000174191 472 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Syde2E9PUP1 Gm8913-201ENSMUST00000209491 641 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Syde2E9PUP1 Abhd14b-210ENSMUST00000217496 631 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Syde2E9PUP1 Gzmn-202ENSMUST00000225535 989 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Syde2E9PUP1 Rpl24-201ENSMUST00000023269 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Syde2E9PUP1 Pjvk-201ENSMUST00000099986 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Syde2E9PUP1 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Syde2E9PUP1 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Syde2E9PUP1 Dnmt3l-201ENSMUST00000000746 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Syde2E9PUP1 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Syde2E9PUP1 Sbsn-201ENSMUST00000080518 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Syde2E9PUP1 Zkscan7-202ENSMUST00000215872 4035 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Syde2E9PUP1 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Syde2E9PUP1 Polr2c-202ENSMUST00000211939 3881 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Syde2E9PUP1 Zfp108-201ENSMUST00000072713 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Syde2E9PUP1 E130317F20Rik-202ENSMUST00000217802 3420 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Syde2E9PUP1 Myt1l-204ENSMUST00000218198 2735 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Syde2E9PUP1 Rpusd2-201ENSMUST00000028796 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Syde2E9PUP1 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Syde2E9PUP1 Gm2673-201ENSMUST00000120958 1608 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Syde2E9PUP1 Hadhb-202ENSMUST00000114783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Syde2E9PUP1 Dnajb4-201ENSMUST00000029669 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Syde2E9PUP1 Gm5884-201ENSMUST00000036712 1479 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Syde2E9PUP1 Nkain3-201ENSMUST00000102998 3098 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Syde2E9PUP1 Cux2-210ENSMUST00000168288 4697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Syde2E9PUP1 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Syde2E9PUP1 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Syde2E9PUP1 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Syde2E9PUP1 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Syde2E9PUP1 AC122314.1-201ENSMUST00000223056 2239 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Syde2E9PUP1 Calcr-203ENSMUST00000168592 2064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Syde2E9PUP1 Adsl-206ENSMUST00000168756 1439 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Syde2E9PUP1 Arhgef39-201ENSMUST00000054538 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Syde2E9PUP1 Gm11564-201ENSMUST00000105055 691 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Syde2E9PUP1 Nmb-202ENSMUST00000119428 678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Syde2E9PUP1 Gm9083-201ENSMUST00000120423 819 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Syde2E9PUP1 Rpsa-ps12-201ENSMUST00000120596 892 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Syde2E9PUP1 Mcpt8-201ENSMUST00000015594 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Syde2E9PUP1 6430590A07Rik-201ENSMUST00000181813 1032 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Syde2E9PUP1 Gm27023-201ENSMUST00000182372 285 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Syde2E9PUP1 Gm34767-201ENSMUST00000191813 1062 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Syde2E9PUP1 Gm43947-201ENSMUST00000203019 959 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Syde2E9PUP1 Rassf4-202ENSMUST00000203029 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Syde2E9PUP1 Zfp706-203ENSMUST00000226453 517 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Syde2E9PUP1 Dhrs2-201ENSMUST00000022820 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Syde2E9PUP1 Treml1-201ENSMUST00000024792 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Syde2E9PUP1 Prr15l-202ENSMUST00000062172 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Syde2E9PUP1 Olfr450-201ENSMUST00000067503 933 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Syde2E9PUP1 Rpl18-201ENSMUST00000072503 679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Syde2E9PUP1 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Syde2E9PUP1 B230344G16Rik-201ENSMUST00000180782 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Syde2E9PUP1 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Syde2E9PUP1 Pitpnb-201ENSMUST00000086635 2761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Syde2E9PUP1 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Syde2E9PUP1 Gabrg3-201ENSMUST00000068394 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Syde2E9PUP1 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Syde2E9PUP1 Crcp-201ENSMUST00000026608 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Syde2E9PUP1 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Syde2E9PUP1 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Syde2E9PUP1 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Syde2E9PUP1 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Syde2E9PUP1 Rinl-201ENSMUST00000059857 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Syde2E9PUP1 Phf8-205ENSMUST00000112668 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Syde2E9PUP1 Det1-202ENSMUST00000107431 1439 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Syde2E9PUP1 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Syde2E9PUP1 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Syde2E9PUP1 Set-202ENSMUST00000102866 2824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Syde2E9PUP1 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Syde2E9PUP1 Txndc2-201ENSMUST00000050236 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Syde2E9PUP1 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Syde2E9PUP1 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Syde2E9PUP1 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Syde2E9PUP1 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Syde2E9PUP1 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Syde2E9PUP1 Ins2-203ENSMUST00000105931 472 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Syde2E9PUP1 Limd2-203ENSMUST00000106875 936 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Syde2E9PUP1 Olfr647-ps1-201ENSMUST00000121599 960 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Syde2E9PUP1 1110018N20Rik-202ENSMUST00000147446 1162 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Syde2E9PUP1 Asb17os-201ENSMUST00000156292 496 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Syde2E9PUP1 Tmem40-205ENSMUST00000166254 811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Syde2E9PUP1 Gm8018-201ENSMUST00000173536 789 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.2 ms