Protein–RNA interactions for Protein: D3Z3K2

Ccnb1ip1, E3 ubiquitin-protein ligase CCNB1IP1, mousemouse

Predictions only

Length 276 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccnb1ip1D3Z3K2 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccnb1ip1D3Z3K2 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccnb1ip1D3Z3K2 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccnb1ip1D3Z3K2 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccnb1ip1D3Z3K2 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccnb1ip1D3Z3K2 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccnb1ip1D3Z3K2 Synj2bp-205ENSMUST00000169158 691 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm9630-201ENSMUST00000178304 885 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccnb1ip1D3Z3K2 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccnb1ip1D3Z3K2 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccnb1ip1D3Z3K2 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccnb1ip1D3Z3K2 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccnb1ip1D3Z3K2 AC169036.1-201ENSMUST00000227994 296 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccnb1ip1D3Z3K2 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccnb1ip1D3Z3K2 Olfr142-201ENSMUST00000099752 918 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccnb1ip1D3Z3K2 Pomgnt1-201ENSMUST00000106494 2226 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccnb1ip1D3Z3K2 Zic4-204ENSMUST00000172646 2535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccnb1ip1D3Z3K2 Epb41l1-203ENSMUST00000103136 6249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccnb1ip1D3Z3K2 Pigc-201ENSMUST00000028021 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ggt1-201ENSMUST00000006508 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccnb1ip1D3Z3K2 Myo7a-203ENSMUST00000107127 6806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm14685-202ENSMUST00000179117 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccnb1ip1D3Z3K2 Dlk2-201ENSMUST00000061722 1532 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccnb1ip1D3Z3K2 Rps6ka6-210ENSMUST00000137712 2410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccnb1ip1D3Z3K2 Serpine1-201ENSMUST00000041388 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccnb1ip1D3Z3K2 Smtn-202ENSMUST00000020721 3335 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccnb1ip1D3Z3K2 Src-201ENSMUST00000029175 3906 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccnb1ip1D3Z3K2 Rufy2-203ENSMUST00000122231 2664 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccnb1ip1D3Z3K2 Pdhx-202ENSMUST00000111183 2078 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccnb1ip1D3Z3K2 Lrfn5-201ENSMUST00000055815 4410 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccnb1ip1D3Z3K2 Pak6-201ENSMUST00000099557 4411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccnb1ip1D3Z3K2 Pitpnm3-202ENSMUST00000108508 6450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccnb1ip1D3Z3K2 Plekhg5-204ENSMUST00000118648 3818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccnb1ip1D3Z3K2 BC024139-201ENSMUST00000054022 2623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccnb1ip1D3Z3K2 Cpn2-201ENSMUST00000064856 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccnb1ip1D3Z3K2 Hspa2-202ENSMUST00000219555 2526 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccnb1ip1D3Z3K2 Zfp536-202ENSMUST00000175941 4423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccnb1ip1D3Z3K2 Pex19-201ENSMUST00000075895 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccnb1ip1D3Z3K2 Myo18a-205ENSMUST00000100794 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccnb1ip1D3Z3K2 Pygo2-202ENSMUST00000107413 2911 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccnb1ip1D3Z3K2 6030458C11Rik-201ENSMUST00000057256 3966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccnb1ip1D3Z3K2 Rftn1-202ENSMUST00000113195 2385 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccnb1ip1D3Z3K2 Cdc25a-204ENSMUST00000198308 2880 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccnb1ip1D3Z3K2 Mbtps1-201ENSMUST00000081381 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccnb1ip1D3Z3K2 Dctn6-202ENSMUST00000117243 962 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm13385-201ENSMUST00000121089 220 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccnb1ip1D3Z3K2 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccnb1ip1D3Z3K2 Vhl-ps1-201ENSMUST00000174813 597 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccnb1ip1D3Z3K2 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccnb1ip1D3Z3K2 Tmem129-204ENSMUST00000200849 657 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccnb1ip1D3Z3K2 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccnb1ip1D3Z3K2 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccnb1ip1D3Z3K2 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccnb1ip1D3Z3K2 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccnb1ip1D3Z3K2 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccnb1ip1D3Z3K2 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccnb1ip1D3Z3K2 Rims2-202ENSMUST00000082054 4800 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccnb1ip1D3Z3K2 Trak1-213ENSMUST00000211439 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccnb1ip1D3Z3K2 Celsr3-207ENSMUST00000213524 9930 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccnb1ip1D3Z3K2 Hnrnpk-202ENSMUST00000116403 2970 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccnb1ip1D3Z3K2 Misp-202ENSMUST00000169041 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccnb1ip1D3Z3K2 Slc35f6-205ENSMUST00000196740 1972 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm45897-201ENSMUST00000212679 1998 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccnb1ip1D3Z3K2 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccnb1ip1D3Z3K2 Asph-212ENSMUST00000108340 6646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gng5-202ENSMUST00000118280 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccnb1ip1D3Z3K2 Adamts14-202ENSMUST00000120336 3645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccnb1ip1D3Z3K2 Actb-201ENSMUST00000100497 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccnb1ip1D3Z3K2 Dgcr8-201ENSMUST00000009321 4320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccnb1ip1D3Z3K2 Sema4f-201ENSMUST00000000641 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gucy1a3-204ENSMUST00000193924 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccnb1ip1D3Z3K2 Bcas3-202ENSMUST00000092821 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ccnb1ip1D3Z3K2 Sfxn3-201ENSMUST00000062213 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ppp2r1b-202ENSMUST00000114437 3430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm9946-202ENSMUST00000162741 1580 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ccnb1ip1D3Z3K2 Fyttd1-211ENSMUST00000171325 4295 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ccnb1ip1D3Z3K2 Synpo-202ENSMUST00000115318 4479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ccnb1ip1D3Z3K2 Atl3-202ENSMUST00000170373 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ccnb1ip1D3Z3K2 Tas1r1-201ENSMUST00000030792 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ccnb1ip1D3Z3K2 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm42372-201ENSMUST00000206129 5067 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ccnb1ip1D3Z3K2 Pde3a-201ENSMUST00000043259 12302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gucy2e-203ENSMUST00000108665 3645 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ccnb1ip1D3Z3K2 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm14455-201ENSMUST00000138288 2146 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ccnb1ip1D3Z3K2 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Ccnb1ip1D3Z3K2 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ccnb1ip1D3Z3K2 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Ccnb1ip1D3Z3K2 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms