Protein–RNA interactions for Protein: C6EQI3

Gm17333, ASL1 fusion protein, mousemouse

Predictions only

Length 125 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm17333C6EQI3 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm17333C6EQI3 Mon2-201ENSMUST00000037557 5511 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm17333C6EQI3 Gm37391-201ENSMUST00000194891 2318 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm17333C6EQI3 Nupl1-206ENSMUST00000225111 2936 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm17333C6EQI3 Vat1l-201ENSMUST00000049509 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm17333C6EQI3 Pex1-201ENSMUST00000006061 4433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm17333C6EQI3 Krt32-201ENSMUST00000107419 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm17333C6EQI3 Gm8798-201ENSMUST00000211877 1661 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm17333C6EQI3 Chia1-201ENSMUST00000079132 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm17333C6EQI3 Cdk5rap3-201ENSMUST00000103152 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm17333C6EQI3 Tcf4-249ENSMUST00000202435 2427 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm17333C6EQI3 Faap100-201ENSMUST00000026448 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm17333C6EQI3 Sorcs1-206ENSMUST00000209783 3489 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm17333C6EQI3 Zbtb7b-202ENSMUST00000107432 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm17333C6EQI3 Ctr9-201ENSMUST00000005749 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm17333C6EQI3 Gm2670-201ENSMUST00000180668 2804 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
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Gm17333C6EQI3 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm17333C6EQI3 Usp17le-201ENSMUST00000053464 1626 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm17333C6EQI3 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm17333C6EQI3 Lmnb2-201ENSMUST00000057623 3531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm17333C6EQI3 Zbtb21-201ENSMUST00000052089 5410 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm17333C6EQI3 Snx10-201ENSMUST00000049152 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm17333C6EQI3 Tbc1d17-201ENSMUST00000047085 8750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm17333C6EQI3 Ttpa-203ENSMUST00000121491 2862 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm17333C6EQI3 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm17333C6EQI3 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm17333C6EQI3 Lpar1-205ENSMUST00000107575 3421 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm17333C6EQI3 Rad54b-202ENSMUST00000095145 2403 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm17333C6EQI3 Son-202ENSMUST00000114037 8399 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
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Gm17333C6EQI3 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm17333C6EQI3 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
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Gm17333C6EQI3 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm17333C6EQI3 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm17333C6EQI3 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
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Gm17333C6EQI3 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
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Gm17333C6EQI3 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
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Gm17333C6EQI3 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
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Gm17333C6EQI3 Dnm2-201ENSMUST00000072362 3502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm17333C6EQI3 Trp53-202ENSMUST00000108657 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm17333C6EQI3 Copb2-201ENSMUST00000035033 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
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Gm17333C6EQI3 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm17333C6EQI3 Emilin1-201ENSMUST00000031055 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm17333C6EQI3 Capn3-201ENSMUST00000028748 2606 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm17333C6EQI3 Adam33-202ENSMUST00000110232 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm17333C6EQI3 Triml2-203ENSMUST00000209872 1395 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm17333C6EQI3 Fitm2-201ENSMUST00000109418 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
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Gm17333C6EQI3 5830411N06Rik-202ENSMUST00000093984 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm17333C6EQI3 Set-202ENSMUST00000102866 2824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm17333C6EQI3 Gata3-201ENSMUST00000102976 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
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Gm17333C6EQI3 Abhd18-202ENSMUST00000108078 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm17333C6EQI3 CT025624.1-201ENSMUST00000224007 2700 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm17333C6EQI3 Fbxl12-201ENSMUST00000086458 2056 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm17333C6EQI3 Fbxl12-202ENSMUST00000086459 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm17333C6EQI3 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
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Gm17333C6EQI3 Etf1-201ENSMUST00000025218 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm17333C6EQI3 Fen1-203ENSMUST00000142241 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm17333C6EQI3 Cacna1e-207ENSMUST00000211821 6765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
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Gm17333C6EQI3 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm17333C6EQI3 Gm24420-201ENSMUST00000176676 59 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm17333C6EQI3 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm17333C6EQI3 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm17333C6EQI3 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
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Gm17333C6EQI3 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm17333C6EQI3 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm17333C6EQI3 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm17333C6EQI3 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm17333C6EQI3 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm17333C6EQI3 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm17333C6EQI3 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC10.61□□□□□ -0.71
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Gm17333C6EQI3 Epb41-207ENSMUST00000105975 5235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm17333C6EQI3 Spata33-202ENSMUST00000212161 2941 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm17333C6EQI3 Itfg2-203ENSMUST00000142615 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm17333C6EQI3 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
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