Protein–RNA interactions for Protein: B2RVW2

Clrn2, Clarin 2, mousemouse

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Length 232 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clrn2B2RVW2 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Clrn2B2RVW2 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Clrn2B2RVW2 Smim14-205ENSMUST00000139122 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Clrn2B2RVW2 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Clrn2B2RVW2 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Clrn2B2RVW2 Cpa1-201ENSMUST00000031806 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Clrn2B2RVW2 Ttc4-201ENSMUST00000026480 2121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Clrn2B2RVW2 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Clrn2B2RVW2 Oxr1-204ENSMUST00000110297 4596 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Clrn2B2RVW2 Acot6-202ENSMUST00000222921 3622 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Clrn2B2RVW2 Xrra1-202ENSMUST00000207855 1334 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Clrn2B2RVW2 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Clrn2B2RVW2 Fbxl12-207ENSMUST00000151861 1668 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Clrn2B2RVW2 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Clrn2B2RVW2 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Clrn2B2RVW2 Rsph3b-201ENSMUST00000024572 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Clrn2B2RVW2 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Clrn2B2RVW2 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Clrn2B2RVW2 Pla2g10-202ENSMUST00000115807 964 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Clrn2B2RVW2 Gm15479-201ENSMUST00000139309 1133 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Clrn2B2RVW2 S100a14-201ENSMUST00000164481 915 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Clrn2B2RVW2 Gstp1-201ENSMUST00000169613 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Clrn2B2RVW2 Gm3625-201ENSMUST00000170816 102 ntAPPRIS P1 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Clrn2B2RVW2 1700125G22Rik-201ENSMUST00000181124 861 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Clrn2B2RVW2 Gm8856-201ENSMUST00000185254 1144 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Clrn2B2RVW2 Ak6-205ENSMUST00000190729 1184 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Clrn2B2RVW2 Phgdh-ps1-201ENSMUST00000207540 754 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Clrn2B2RVW2 Gm32468-201ENSMUST00000214199 1040 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Clrn2B2RVW2 4930447K03Rik-201ENSMUST00000222745 1033 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Clrn2B2RVW2 AC108416.1-202ENSMUST00000228927 1201 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Clrn2B2RVW2 Ldlrad3-201ENSMUST00000058790 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Clrn2B2RVW2 Gm8385-201ENSMUST00000058999 643 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Clrn2B2RVW2 Gm10308-201ENSMUST00000095183 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Clrn2B2RVW2 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Clrn2B2RVW2 Rap1gap2-202ENSMUST00000102521 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Clrn2B2RVW2 Polr3g-201ENSMUST00000048993 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Clrn2B2RVW2 Gm5989-201ENSMUST00000096092 2077 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Clrn2B2RVW2 Gngt2-201ENSMUST00000036088 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Clrn2B2RVW2 Cluh-201ENSMUST00000092915 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Clrn2B2RVW2 Ptgir-201ENSMUST00000086101 2725 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Clrn2B2RVW2 Whamm-203ENSMUST00000209044 1879 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Clrn2B2RVW2 Atat1-212ENSMUST00000141662 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Clrn2B2RVW2 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Clrn2B2RVW2 Dppa4-201ENSMUST00000050705 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Clrn2B2RVW2 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Clrn2B2RVW2 E430024P14Rik-203ENSMUST00000160545 2833 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Clrn2B2RVW2 Dido1-207ENSMUST00000130986 4898 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Clrn2B2RVW2 Adcyap1r1-202ENSMUST00000070756 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Clrn2B2RVW2 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Clrn2B2RVW2 Kcnd3-201ENSMUST00000079169 2102 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Clrn2B2RVW2 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Clrn2B2RVW2 Gm21982-201ENSMUST00000146232 3821 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Clrn2B2RVW2 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Clrn2B2RVW2 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Clrn2B2RVW2 Dctn2-201ENSMUST00000026479 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Clrn2B2RVW2 Ncmap-202ENSMUST00000105857 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Clrn2B2RVW2 Sgsm1-203ENSMUST00000112324 1102 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Clrn2B2RVW2 Hcrtr1-203ENSMUST00000120154 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Clrn2B2RVW2 Gm13388-201ENSMUST00000126659 425 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
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Clrn2B2RVW2 Dhrs3-206ENSMUST00000154208 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Clrn2B2RVW2 Gm20470-201ENSMUST00000174654 331 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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Clrn2B2RVW2 Tnnt1-213ENSMUST00000178163 934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Clrn2B2RVW2 1700030M09Rik-202ENSMUST00000181679 964 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Clrn2B2RVW2 4930404N11Rik-201ENSMUST00000020456 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Clrn2B2RVW2 4930578M07Rik-202ENSMUST00000212946 552 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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Clrn2B2RVW2 CU062626.3-201ENSMUST00000225522 1411 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Clrn2B2RVW2 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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Clrn2B2RVW2 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Clrn2B2RVW2 Gm17089-201ENSMUST00000171098 1394 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Clrn2B2RVW2 Gm10729-202ENSMUST00000193403 1375 ntBASIC14.96□□□□□ -0.02
Clrn2B2RVW2 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Clrn2B2RVW2 AC126444.1-201ENSMUST00000225938 1768 ntBASIC14.96□□□□□ -0.02
Clrn2B2RVW2 Slamf7-204ENSMUST00000194531 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Clrn2B2RVW2 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Clrn2B2RVW2 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Clrn2B2RVW2 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Clrn2B2RVW2 1110034G24Rik-202ENSMUST00000110132 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Clrn2B2RVW2 Gm43908-201ENSMUST00000205074 1472 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Clrn2B2RVW2 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Clrn2B2RVW2 Pomt2-201ENSMUST00000037788 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Clrn2B2RVW2 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Clrn2B2RVW2 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Clrn2B2RVW2 S100pbp-205ENSMUST00000117350 2241 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Clrn2B2RVW2 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Clrn2B2RVW2 Gm11595-201ENSMUST00000107440 1200 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Clrn2B2RVW2 Rap1a-ps2-201ENSMUST00000118467 559 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Clrn2B2RVW2 Cabp2-202ENSMUST00000159556 781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Clrn2B2RVW2 1700040D17Rik-201ENSMUST00000181305 998 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Clrn2B2RVW2 Brsk1-205ENSMUST00000206024 1216 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Clrn2B2RVW2 Ift43-205ENSMUST00000222821 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Clrn2B2RVW2 AC123665.1-201ENSMUST00000228204 438 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Clrn2B2RVW2 Tmem51os1-203ENSMUST00000150202 1667 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Clrn2B2RVW2 Atp9a-201ENSMUST00000029060 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Clrn2B2RVW2 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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