Protein–RNA interactions for Protein: A3KMN5

Prr16, Protein Largen, mousemouse

Predictions only

Length 304 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prr16A3KMN5 Pkig-203ENSMUST00000109400 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Prr16A3KMN5 3110009E18Rik-203ENSMUST00000112644 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Prr16A3KMN5 Rpl19-ps12-201ENSMUST00000121251 591 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Prr16A3KMN5 Polr3c-202ENSMUST00000125183 923 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Prr16A3KMN5 Gm12347-201ENSMUST00000127883 470 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Prr16A3KMN5 Gm20521-201ENSMUST00000134077 1245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Prr16A3KMN5 Gm12167-201ENSMUST00000148132 578 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Prr16A3KMN5 Ablim2-213ENSMUST00000150146 415 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Prr16A3KMN5 Egfl7-211ENSMUST00000152988 723 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Prr16A3KMN5 Gm27572-201ENSMUST00000183702 255 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Prr16A3KMN5 Gm18041-201ENSMUST00000218210 618 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Prr16A3KMN5 AC152453.1-201ENSMUST00000218802 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Prr16A3KMN5 Olfr54-201ENSMUST00000072152 942 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Prr16A3KMN5 Olfr1375-201ENSMUST00000073543 942 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Prr16A3KMN5 Phldb1-213ENSMUST00000144251 3589 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Prr16A3KMN5 Rnf14-202ENSMUST00000170811 2886 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Prr16A3KMN5 Zfp595-205ENSMUST00000171466 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Prr16A3KMN5 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Prr16A3KMN5 Lrriq4-201ENSMUST00000108265 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Prr16A3KMN5 Ccr7-201ENSMUST00000103134 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Prr16A3KMN5 Gm2115-201ENSMUST00000180387 7055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Prr16A3KMN5 Atg16l1-203ENSMUST00000113190 3102 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Prr16A3KMN5 Exosc2-201ENSMUST00000038474 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Prr16A3KMN5 Chia1-201ENSMUST00000079132 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Prr16A3KMN5 Tnks1bp1-201ENSMUST00000048400 4799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Prr16A3KMN5 Phactr3-201ENSMUST00000103065 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Prr16A3KMN5 B230209E15Rik-201ENSMUST00000209115 1597 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Prr16A3KMN5 Zscan29-205ENSMUST00000163766 3611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Prr16A3KMN5 Ext1-201ENSMUST00000077273 7663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Prr16A3KMN5 Tspan12-201ENSMUST00000031678 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Prr16A3KMN5 Foxred2-202ENSMUST00000117725 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Prr16A3KMN5 Arhgef37-201ENSMUST00000171629 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Prr16A3KMN5 Psmd13-208ENSMUST00000163610 1382 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Prr16A3KMN5 Hsd17b6-201ENSMUST00000026462 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Prr16A3KMN5 C77080-202ENSMUST00000097873 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Prr16A3KMN5 Stx4a-202ENSMUST00000121705 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Prr16A3KMN5 Gm8793-201ENSMUST00000183069 1303 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Prr16A3KMN5 6330418K02Rik-201ENSMUST00000124298 743 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Prr16A3KMN5 Gm14209-201ENSMUST00000154946 462 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Prr16A3KMN5 Gm3893-201ENSMUST00000178882 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Prr16A3KMN5 4930516B21Rik-201ENSMUST00000181600 1195 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Prr16A3KMN5 Gm19184-201ENSMUST00000196798 928 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Prr16A3KMN5 Gm43416-201ENSMUST00000201916 1015 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Prr16A3KMN5 Gm17823-201ENSMUST00000217830 1006 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Prr16A3KMN5 n-R5s195-201ENSMUST00000082891 119 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Prr16A3KMN5 Gm10478-201ENSMUST00000084451 396 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Prr16A3KMN5 Tnk2-201ENSMUST00000115120 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Prr16A3KMN5 Gm10433-202ENSMUST00000146364 1984 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Prr16A3KMN5 Slc6a18-210ENSMUST00000223074 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Prr16A3KMN5 Polrmt-202ENSMUST00000159016 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Prr16A3KMN5 Olfr56-201ENSMUST00000056759 1925 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Prr16A3KMN5 Cplx2-201ENSMUST00000026985 4928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Prr16A3KMN5 Pik3cd-201ENSMUST00000038859 4905 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Prr16A3KMN5 Ptgdr2-201ENSMUST00000037261 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Prr16A3KMN5 Smarcd2-203ENSMUST00000106843 2548 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Prr16A3KMN5 Rad9b-202ENSMUST00000117263 2371 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Prr16A3KMN5 Tppp-201ENSMUST00000022057 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Prr16A3KMN5 Plcd3-201ENSMUST00000103077 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Prr16A3KMN5 5830462O15Rik-201ENSMUST00000214603 1655 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Prr16A3KMN5 Dhx57-201ENSMUST00000038166 4918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Prr16A3KMN5 Rsbn1-201ENSMUST00000051139 4762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Prr16A3KMN5 Thpo-201ENSMUST00000076422 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Prr16A3KMN5 Stim1-201ENSMUST00000033289 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Prr16A3KMN5 Spred3-201ENSMUST00000048923 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Prr16A3KMN5 Kpna7-203ENSMUST00000116454 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Prr16A3KMN5 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Prr16A3KMN5 Parp16-202ENSMUST00000213396 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Prr16A3KMN5 Prss36-202ENSMUST00000118755 3028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Prr16A3KMN5 Pds5b-201ENSMUST00000016569 7417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Prr16A3KMN5 Max-201ENSMUST00000082136 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Prr16A3KMN5 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Prr16A3KMN5 Mirg-202ENSMUST00000181543 1300 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Prr16A3KMN5 Supt6-201ENSMUST00000002121 6488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Prr16A3KMN5 Gm16191-202ENSMUST00000148464 484 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Prr16A3KMN5 1700069L16Rik-203ENSMUST00000162388 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Prr16A3KMN5 Gm17180-201ENSMUST00000172211 435 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Prr16A3KMN5 Pyy-204ENSMUST00000177304 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Prr16A3KMN5 Gm43438-201ENSMUST00000198133 379 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Prr16A3KMN5 Gm45880-201ENSMUST00000213041 853 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Prr16A3KMN5 Lim2-201ENSMUST00000004732 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Prr16A3KMN5 Otos-201ENSMUST00000053144 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Prr16A3KMN5 Olfr91-201ENSMUST00000087144 939 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
Prr16A3KMN5 Celf1-202ENSMUST00000068726 7851 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Prr16A3KMN5 Gm36356-201ENSMUST00000209224 2277 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Prr16A3KMN5 Fbxw7-201ENSMUST00000029727 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Prr16A3KMN5 Ube2a-201ENSMUST00000016452 1732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Prr16A3KMN5 Gm9754-201ENSMUST00000031305 3004 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Prr16A3KMN5 Chrnd-202ENSMUST00000186373 2949 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Prr16A3KMN5 Dysf-214ENSMUST00000204354 6432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Prr16A3KMN5 Fmn2-201ENSMUST00000030039 6442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Prr16A3KMN5 Clmp-201ENSMUST00000034522 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Prr16A3KMN5 Dppa4-202ENSMUST00000096045 1534 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Prr16A3KMN5 Bcs1l-203ENSMUST00000113733 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Prr16A3KMN5 Evi5l-202ENSMUST00000176072 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Prr16A3KMN5 Ssc5d-201ENSMUST00000057612 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Prr16A3KMN5 Cyp1b1-201ENSMUST00000024894 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Prr16A3KMN5 Prss36-201ENSMUST00000094026 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Prr16A3KMN5 Plekhb1-203ENSMUST00000107044 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Prr16A3KMN5 Gm1661-203ENSMUST00000165128 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Prr16A3KMN5 Fbxo34-205ENSMUST00000168833 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.4 ms