Protein–RNA interactions for Protein: A3KG45

Gm6880, MCG1035527 (Fragment), mousemouse

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Length 208 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm6880A3KG45 Gtf2ird1-209ENSMUST00000171794 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Gm6880A3KG45 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Gm6880A3KG45 E230029C05Rik-202ENSMUST00000207458 2445 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Gm6880A3KG45 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Gm6880A3KG45 Lipe-202ENSMUST00000054301 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Gm6880A3KG45 Kdm3a-214ENSMUST00000207023 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Gm6880A3KG45 Cd81-201ENSMUST00000037941 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Gm6880A3KG45 Mcm9-206ENSMUST00000220007 3513 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Gm6880A3KG45 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Gm6880A3KG45 Wnk1-203ENSMUST00000088644 11330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Gm6880A3KG45 Fetub-203ENSMUST00000167399 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Gm6880A3KG45 Sh2d7-202ENSMUST00000118413 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Gm6880A3KG45 H2-Ob-204ENSMUST00000173764 1319 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Gm6880A3KG45 Gm8862-201ENSMUST00000198379 1346 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Gm6880A3KG45 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Gm6880A3KG45 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Gm6880A3KG45 Ap2m1-201ENSMUST00000007216 2937 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Gm6880A3KG45 Gm16278-201ENSMUST00000148064 2071 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Gm6880A3KG45 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Gm6880A3KG45 Gm13055-201ENSMUST00000127875 1961 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Gm6880A3KG45 Cd300lf-202ENSMUST00000106561 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Gm6880A3KG45 Dclk2-206ENSMUST00000193632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Gm6880A3KG45 Necab1-201ENSMUST00000041606 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Gm6880A3KG45 Itgb4-202ENSMUST00000068981 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Gm6880A3KG45 Zap70-201ENSMUST00000027291 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Gm6880A3KG45 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Gm6880A3KG45 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
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Gm6880A3KG45 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Gm6880A3KG45 Trpm4-201ENSMUST00000042194 4234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Gm6880A3KG45 Ncor2-203ENSMUST00000111393 8661 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Gm6880A3KG45 Lcn6-203ENSMUST00000114199 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Gm6880A3KG45 Gm14130-201ENSMUST00000118417 987 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Gm6880A3KG45 Gm12012-201ENSMUST00000118857 1066 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Gm6880A3KG45 Gm14704-201ENSMUST00000120300 874 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Gm6880A3KG45 Gm11961-202ENSMUST00000141157 760 ntTSL 3 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Gm6880A3KG45 C230066G23Rik-201ENSMUST00000150195 650 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
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Gm6880A3KG45 Gm42839-201ENSMUST00000198978 525 ntTSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
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Gm6880A3KG45 Cdc34-208ENSMUST00000219791 799 ntTSL 3 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Gm6880A3KG45 AC124171.1-201ENSMUST00000221151 567 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Gm6880A3KG45 Crip3-201ENSMUST00000024764 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Gm6880A3KG45 Itln1-201ENSMUST00000043094 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
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Gm6880A3KG45 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Gm6880A3KG45 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Gm6880A3KG45 Plch2-201ENSMUST00000105631 5053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Gm6880A3KG45 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Gm6880A3KG45 Slc19a2-202ENSMUST00000159230 3432 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
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Gm6880A3KG45 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
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Gm6880A3KG45 4933431M02Rik-201ENSMUST00000203905 1432 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Gm6880A3KG45 Ldlrad3-201ENSMUST00000058790 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
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Gm6880A3KG45 Nmral1-202ENSMUST00000079130 1459 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Gm6880A3KG45 Actc1-201ENSMUST00000090269 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Gm6880A3KG45 Sv2b-202ENSMUST00000165175 5524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Gm6880A3KG45 Asap1-218ENSMUST00000177374 4582 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Gm6880A3KG45 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Gm6880A3KG45 Edrf1-201ENSMUST00000051169 5424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Gm6880A3KG45 Polg-201ENSMUST00000073889 7837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Gm6880A3KG45 Olfr649-202ENSMUST00000106859 1382 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Gm6880A3KG45 Adarb1-201ENSMUST00000020496 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Gm6880A3KG45 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Gm6880A3KG45 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Gm6880A3KG45 F3-201ENSMUST00000029771 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Gm6880A3KG45 Skap1-202ENSMUST00000100519 1100 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Gm6880A3KG45 Gm11930-201ENSMUST00000117788 190 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Gm6880A3KG45 Igfbp2-202ENSMUST00000120564 991 ntTSL 3 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Gm6880A3KG45 Tnfrsf18-203ENSMUST00000122001 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Gm6880A3KG45 Gm15547-201ENSMUST00000122152 333 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Gm6880A3KG45 Gm23363-201ENSMUST00000175024 79 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Gm6880A3KG45 Gm26636-201ENSMUST00000181696 1115 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Gm6880A3KG45 Gm27046-201ENSMUST00000182160 463 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Gm6880A3KG45 Gm29054-201ENSMUST00000187589 1185 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Gm6880A3KG45 5330425B07Rik-201ENSMUST00000196714 1027 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Gm6880A3KG45 Gm4598-201ENSMUST00000206756 1080 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Gm6880A3KG45 4930479H17Rik-201ENSMUST00000208824 292 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Gm6880A3KG45 Lcn10-201ENSMUST00000058912 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Gm6880A3KG45 Rpl30-201ENSMUST00000009039 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Gm6880A3KG45 Tjap1-203ENSMUST00000180283 2368 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
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