Protein–RNA interactions for Protein: A2BED8

Samt1, Predicted gene 10057, mousemouse

Predictions only

Length 237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samt1A2BED8 Vmn1r24-201ENSMUST00000228097 1901 ntAPPRIS P1 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Samt1A2BED8 Rcbtb2-202ENSMUST00000110952 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Samt1A2BED8 Oasl1-202ENSMUST00000112143 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Samt1A2BED8 Atxn10-201ENSMUST00000163242 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Samt1A2BED8 Mul1-202ENSMUST00000105813 3944 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Samt1A2BED8 Lbh-201ENSMUST00000024857 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Samt1A2BED8 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Samt1A2BED8 Vsx2-202ENSMUST00000169934 3249 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Samt1A2BED8 Epha5-206ENSMUST00000113406 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Samt1A2BED8 Oxr1-203ENSMUST00000090096 4515 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Samt1A2BED8 Spef1-202ENSMUST00000110218 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Samt1A2BED8 Nemp1-203ENSMUST00000118728 2362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Samt1A2BED8 Capn3-205ENSMUST00000110719 2778 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Samt1A2BED8 Tns2-201ENSMUST00000046144 4718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Samt1A2BED8 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Samt1A2BED8 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Samt1A2BED8 Ephx2-201ENSMUST00000070515 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Samt1A2BED8 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Samt1A2BED8 AC124577.2-201ENSMUST00000217413 2420 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Samt1A2BED8 Cyyr1-201ENSMUST00000114174 5464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Samt1A2BED8 Rnft2-202ENSMUST00000121369 4431 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Samt1A2BED8 Fam161a-203ENSMUST00000109557 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Samt1A2BED8 Slc12a8-202ENSMUST00000117134 2081 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Samt1A2BED8 4930432B10Rik-201ENSMUST00000181688 2085 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Samt1A2BED8 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Samt1A2BED8 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Samt1A2BED8 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Samt1A2BED8 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Samt1A2BED8 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Samt1A2BED8 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Samt1A2BED8 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Samt1A2BED8 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Samt1A2BED8 Gm4804-201ENSMUST00000182234 999 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Samt1A2BED8 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Samt1A2BED8 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Samt1A2BED8 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Samt1A2BED8 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Samt1A2BED8 2010315B03Rik-202ENSMUST00000177714 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Samt1A2BED8 Inpp4b-215ENSMUST00000217122 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Samt1A2BED8 A930024N18Rik-201ENSMUST00000181251 3955 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Samt1A2BED8 Wasf2-202ENSMUST00000105912 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Samt1A2BED8 Sec23a-201ENSMUST00000021375 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Samt1A2BED8 Cyth3-202ENSMUST00000116456 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Samt1A2BED8 Rcor3-201ENSMUST00000073279 3748 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Samt1A2BED8 Opcml-201ENSMUST00000073822 2378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Samt1A2BED8 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Samt1A2BED8 Cep170b-201ENSMUST00000092279 3817 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Samt1A2BED8 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Samt1A2BED8 Lrch1-201ENSMUST00000088970 4694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Samt1A2BED8 Slc5a11-207ENSMUST00000167299 2022 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Samt1A2BED8 Afmid-201ENSMUST00000073388 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Samt1A2BED8 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Samt1A2BED8 Uspl1-205ENSMUST00000121416 3792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Samt1A2BED8 AC122314.1-201ENSMUST00000223056 2239 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Samt1A2BED8 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Samt1A2BED8 Cntnap1-201ENSMUST00000103109 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Samt1A2BED8 Cux1-204ENSMUST00000175975 10945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Samt1A2BED8 Uqcrq-201ENSMUST00000061326 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Samt1A2BED8 Mast1-201ENSMUST00000109741 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Samt1A2BED8 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Samt1A2BED8 Rgma-201ENSMUST00000094312 3586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Samt1A2BED8 Gpr176-201ENSMUST00000039160 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Samt1A2BED8 Rlbp1-201ENSMUST00000053718 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Samt1A2BED8 Gm38376-201ENSMUST00000195493 2253 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Samt1A2BED8 Asl-203ENSMUST00000160129 2413 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Samt1A2BED8 Sdc1-201ENSMUST00000020911 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Samt1A2BED8 Tyk2-206ENSMUST00000216874 4828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Samt1A2BED8 Aurka-203ENSMUST00000109140 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Samt1A2BED8 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Samt1A2BED8 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Samt1A2BED8 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Samt1A2BED8 Asb10-202ENSMUST00000117900 1432 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Samt1A2BED8 Tesmin-202ENSMUST00000127142 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Samt1A2BED8 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Samt1A2BED8 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Samt1A2BED8 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Samt1A2BED8 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Samt1A2BED8 Camsap3-203ENSMUST00000207077 3832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Samt1A2BED8 Bop1-201ENSMUST00000023217 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Samt1A2BED8 Mlh1-201ENSMUST00000035079 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Samt1A2BED8 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Samt1A2BED8 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Samt1A2BED8 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Samt1A2BED8 Rbpj-207ENSMUST00000201883 4961 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Samt1A2BED8 Hlcs-201ENSMUST00000099512 4833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Samt1A2BED8 Celsr3-207ENSMUST00000213524 9930 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Samt1A2BED8 Pde6c-201ENSMUST00000025956 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Samt1A2BED8 Acadsb-201ENSMUST00000015829 6081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Samt1A2BED8 Acbd5-213ENSMUST00000227809 1986 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Samt1A2BED8 Cox10-201ENSMUST00000049091 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Samt1A2BED8 Nek4-201ENSMUST00000050171 2793 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Samt1A2BED8 Gdpd2-201ENSMUST00000019503 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Samt1A2BED8 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Samt1A2BED8 Nxph1-202ENSMUST00000160300 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Samt1A2BED8 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Samt1A2BED8 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Samt1A2BED8 1600020E01Rik-206ENSMUST00000204663 2007 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Samt1A2BED8 Krba1-202ENSMUST00000077093 8380 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Samt1A2BED8 Gm6157-201ENSMUST00000199935 1897 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Samt1A2BED8 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42 ms