Protein–RNA interactions for Protein: A2ANU3

Syndig1, Synapse differentiation-inducing gene protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syndig1A2ANU3 Cox7a2-201ENSMUST00000034881 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Syndig1A2ANU3 Sema4b-201ENSMUST00000032754 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Syndig1A2ANU3 Cpxm2-201ENSMUST00000033149 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Syndig1A2ANU3 Bicd1-202ENSMUST00000086829 9667 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Syndig1A2ANU3 Mier3-203ENSMUST00000109272 5279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Syndig1A2ANU3 9930014A18Rik-201ENSMUST00000180730 3074 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Syndig1A2ANU3 Hoxb13-201ENSMUST00000062709 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Syndig1A2ANU3 Edem3-203ENSMUST00000188145 3262 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Syndig1A2ANU3 Nmral1-204ENSMUST00000120056 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Syndig1A2ANU3 Gm9946-202ENSMUST00000162741 1580 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Syndig1A2ANU3 Bcas3-201ENSMUST00000074875 2814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Syndig1A2ANU3 Zfp365-201ENSMUST00000064656 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Syndig1A2ANU3 Banp-201ENSMUST00000026354 1970 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Syndig1A2ANU3 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Syndig1A2ANU3 Fcgr1-201ENSMUST00000029748 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Syndig1A2ANU3 Tmem251-201ENSMUST00000057416 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Syndig1A2ANU3 Taok2-202ENSMUST00000117394 4985 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Syndig1A2ANU3 Gm43868-201ENSMUST00000205187 2114 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Syndig1A2ANU3 Mgat3-201ENSMUST00000044970 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Syndig1A2ANU3 AC168058.1-201ENSMUST00000219521 2282 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Syndig1A2ANU3 Mir1247-201ENSMUST00000116706 82 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Syndig1A2ANU3 Gm5940-201ENSMUST00000117582 1068 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Syndig1A2ANU3 Neurl3-202ENSMUST00000188666 1206 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Syndig1A2ANU3 0610005C13Rik-202ENSMUST00000209510 671 ntTSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Syndig1A2ANU3 Gm18934-201ENSMUST00000216671 1044 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Syndig1A2ANU3 Gm36198-201ENSMUST00000217490 416 ntTSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Syndig1A2ANU3 AC144543.1-201ENSMUST00000221840 1064 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Syndig1A2ANU3 Oit1-201ENSMUST00000022269 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Syndig1A2ANU3 Gm7399-201ENSMUST00000032395 858 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Syndig1A2ANU3 9430041J12Rik-201ENSMUST00000050989 534 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Syndig1A2ANU3 Gm10012-201ENSMUST00000078252 192 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Syndig1A2ANU3 Eme1-201ENSMUST00000039949 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Syndig1A2ANU3 Trpc7-206ENSMUST00000173513 2241 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Syndig1A2ANU3 D6Ertd527e-203ENSMUST00000203747 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Syndig1A2ANU3 Ndc80-201ENSMUST00000024851 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Syndig1A2ANU3 Gm4782-201ENSMUST00000168705 2046 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Syndig1A2ANU3 Prmt2-201ENSMUST00000020452 2016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Syndig1A2ANU3 Tal1-203ENSMUST00000161601 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Syndig1A2ANU3 Pfkl-201ENSMUST00000020522 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Syndig1A2ANU3 Vax2os-201ENSMUST00000123402 1435 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Syndig1A2ANU3 Acvr1c-201ENSMUST00000028178 9162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Syndig1A2ANU3 Lctl-201ENSMUST00000034969 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Syndig1A2ANU3 Mip-201ENSMUST00000026455 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Syndig1A2ANU3 Cyb561d1-202ENSMUST00000106654 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Syndig1A2ANU3 Tmem132e-202ENSMUST00000092852 4105 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Syndig1A2ANU3 Brd3-202ENSMUST00000077737 5272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Syndig1A2ANU3 Ttc25-202ENSMUST00000092684 2240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Syndig1A2ANU3 Fzd1-201ENSMUST00000054294 4197 ntAPPRIS P1 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Syndig1A2ANU3 Gm42480-201ENSMUST00000198434 2595 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Syndig1A2ANU3 Kcnk13-201ENSMUST00000049788 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Syndig1A2ANU3 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Syndig1A2ANU3 Map1lc3b-201ENSMUST00000034270 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Syndig1A2ANU3 Fam118b-203ENSMUST00000121564 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Syndig1A2ANU3 Arpc3-203ENSMUST00000111713 708 ntTSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Syndig1A2ANU3 Gm11754-201ENSMUST00000156576 661 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Syndig1A2ANU3 Proscos-202ENSMUST00000178990 666 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Syndig1A2ANU3 Gm27331-201ENSMUST00000183705 60 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Syndig1A2ANU3 1700113H08Rik-202ENSMUST00000189456 974 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Syndig1A2ANU3 Gm6013-201ENSMUST00000212264 699 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Syndig1A2ANU3 Gemin7-201ENSMUST00000051364 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Syndig1A2ANU3 Utp23-201ENSMUST00000059599 740 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Syndig1A2ANU3 Rn7sk-201ENSMUST00000083103 331 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Syndig1A2ANU3 Gm26315-201ENSMUST00000083890 321 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Syndig1A2ANU3 Gm24447-201ENSMUST00000083977 338 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Syndig1A2ANU3 Olfr707-201ENSMUST00000088687 924 ntAPPRIS P1 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Syndig1A2ANU3 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Syndig1A2ANU3 Olfr1532-ps1-201ENSMUST00000098140 924 ntAPPRIS P1 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Syndig1A2ANU3 Ccdc33-202ENSMUST00000098681 1093 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Syndig1A2ANU3 B230118H07Rik-202ENSMUST00000099682 895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Syndig1A2ANU3 Alkbh4-201ENSMUST00000041100 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Syndig1A2ANU3 Sostdc1-201ENSMUST00000041407 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Syndig1A2ANU3 Stxbp1-202ENSMUST00000077458 3616 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Syndig1A2ANU3 Gm10176-201ENSMUST00000159707 2264 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Syndig1A2ANU3 Gm7553-201ENSMUST00000185805 1426 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Syndig1A2ANU3 1110002L01Rik-202ENSMUST00000168012 3569 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Syndig1A2ANU3 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Syndig1A2ANU3 Strada-201ENSMUST00000007444 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Syndig1A2ANU3 Wdr45-204ENSMUST00000115689 1568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Syndig1A2ANU3 1500009C09Rik-202ENSMUST00000143238 1552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Syndig1A2ANU3 Pef1-201ENSMUST00000030563 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Syndig1A2ANU3 Ppp6r1-201ENSMUST00000064099 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Syndig1A2ANU3 Sdad1-201ENSMUST00000031364 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Syndig1A2ANU3 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Syndig1A2ANU3 Gm37269-201ENSMUST00000193906 1891 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Syndig1A2ANU3 Col14a1-203ENSMUST00000110221 5679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Syndig1A2ANU3 Pitpnm2-204ENSMUST00000159677 1690 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Syndig1A2ANU3 Smarcb1-201ENSMUST00000000925 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Syndig1A2ANU3 Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 2935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Syndig1A2ANU3 Itga6-202ENSMUST00000112101 4156 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Syndig1A2ANU3 Catsper3-202ENSMUST00000109898 1311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Syndig1A2ANU3 Poli-205ENSMUST00000161542 2736 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Syndig1A2ANU3 Plcd3-201ENSMUST00000103077 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Syndig1A2ANU3 Ntrk2-204ENSMUST00000224259 3049 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Syndig1A2ANU3 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Syndig1A2ANU3 Togaram2-205ENSMUST00000153445 3302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Syndig1A2ANU3 Asl-202ENSMUST00000159619 2088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Syndig1A2ANU3 Ugt1a8-201ENSMUST00000113139 2227 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Syndig1A2ANU3 Col9a3-201ENSMUST00000103059 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Syndig1A2ANU3 Ppih-203ENSMUST00000106318 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Syndig1A2ANU3 Mast1-201ENSMUST00000109741 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.1 ms