Protein–RNA interactions for Protein: A2AGU5

Cldn34d, Claudin 34D, mousemouse

Predictions only

Length 210 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34dA2AGU5 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Cldn34dA2AGU5 Frmpd1-202ENSMUST00000107804 5241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Cldn34dA2AGU5 Pdcd6-203ENSMUST00000222759 1376 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Cldn34dA2AGU5 Prok2-203ENSMUST00000101120 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Cldn34dA2AGU5 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Cldn34dA2AGU5 Dhx30-212ENSMUST00000197928 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Cldn34dA2AGU5 Hspa9-201ENSMUST00000025217 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Cldn34dA2AGU5 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Cldn34dA2AGU5 AC161252.3-201ENSMUST00000225465 1549 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Cldn34dA2AGU5 Pik3cd-203ENSMUST00000105689 3132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Cldn34dA2AGU5 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Cldn34dA2AGU5 Car3-201ENSMUST00000029076 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Cldn34dA2AGU5 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Cldn34dA2AGU5 Plekhd1-201ENSMUST00000140770 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Cldn34dA2AGU5 Sgce-204ENSMUST00000115577 1776 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Cldn34dA2AGU5 Glipr2-202ENSMUST00000107855 1816 ntTSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Cldn34dA2AGU5 Bcl2l15-202ENSMUST00000106822 1902 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Cldn34dA2AGU5 Fbxw7-201ENSMUST00000029727 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Cldn34dA2AGU5 Pabpc2-201ENSMUST00000063219 2586 ntAPPRIS P1 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Cldn34dA2AGU5 Mettl27-201ENSMUST00000047196 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Cldn34dA2AGU5 Mafk-202ENSMUST00000110836 3097 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Cldn34dA2AGU5 Ptprm-203ENSMUST00000224091 3773 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Cldn34dA2AGU5 Pcdhgb6-201ENSMUST00000003599 4684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Cldn34dA2AGU5 Rpap1-203ENSMUST00000110793 5458 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Cldn34dA2AGU5 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Cldn34dA2AGU5 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Cldn34dA2AGU5 Tnip1-204ENSMUST00000108885 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Cldn34dA2AGU5 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Cldn34dA2AGU5 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Cldn34dA2AGU5 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Cldn34dA2AGU5 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Cldn34dA2AGU5 Trak1-213ENSMUST00000211439 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Cldn34dA2AGU5 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Cldn34dA2AGU5 Tapbp-201ENSMUST00000025161 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Cldn34dA2AGU5 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Cldn34dA2AGU5 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Cldn34dA2AGU5 Setd1a-201ENSMUST00000047075 6487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.7
Cldn34dA2AGU5 Ttc14-201ENSMUST00000099153 9661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Cldn34dA2AGU5 Nol4-204ENSMUST00000097651 4549 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Cldn34dA2AGU5 6030458C11Rik-201ENSMUST00000057256 3966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Cldn34dA2AGU5 Usp53-202ENSMUST00000197314 3586 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.7
Cldn34dA2AGU5 Ercc4-201ENSMUST00000023206 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Cldn34dA2AGU5 Gtf2ird1-202ENSMUST00000074114 3330 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Cldn34dA2AGU5 Pou4f2-201ENSMUST00000034115 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Cldn34dA2AGU5 4931409K22Rik-201ENSMUST00000088302 2613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.7
Cldn34dA2AGU5 Gm19434-201ENSMUST00000204330 2573 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Cldn34dA2AGU5 Apol6-206ENSMUST00000149569 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cldn34dA2AGU5 Trpv6-203ENSMUST00000201471 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cldn34dA2AGU5 Wdr17-211ENSMUST00000175915 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cldn34dA2AGU5 Lrrc3-201ENSMUST00000057608 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cldn34dA2AGU5 Gm44942-201ENSMUST00000096093 2072 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Cldn34dA2AGU5 Gm11476-201ENSMUST00000127006 2019 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cldn34dA2AGU5 Reep2-201ENSMUST00000043484 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cldn34dA2AGU5 Pepd-201ENSMUST00000075068 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cldn34dA2AGU5 Adcyap1r1-203ENSMUST00000165786 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cldn34dA2AGU5 Kcnv2-201ENSMUST00000056708 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cldn34dA2AGU5 Jak1-201ENSMUST00000102781 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cldn34dA2AGU5 Chodl-203ENSMUST00000114216 1550 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cldn34dA2AGU5 Tm9sf2-201ENSMUST00000026624 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cldn34dA2AGU5 Satb2-205ENSMUST00000177424 4694 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cldn34dA2AGU5 Apol9b-201ENSMUST00000109775 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cldn34dA2AGU5 Synpo-211ENSMUST00000155195 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cldn34dA2AGU5 Arhgef2-203ENSMUST00000170653 4238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cldn34dA2AGU5 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cldn34dA2AGU5 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cldn34dA2AGU5 Ankzf1-208ENSMUST00000152233 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cldn34dA2AGU5 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
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Cldn34dA2AGU5 Tagln2-201ENSMUST00000111228 716 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
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Cldn34dA2AGU5 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
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Cldn34dA2AGU5 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Cldn34dA2AGU5 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cldn34dA2AGU5 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cldn34dA2AGU5 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Cldn34dA2AGU5 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cldn34dA2AGU5 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Cldn34dA2AGU5 Gm17330-201ENSMUST00000221047 165 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Cldn34dA2AGU5 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cldn34dA2AGU5 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cldn34dA2AGU5 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cldn34dA2AGU5 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cldn34dA2AGU5 Sdad1-201ENSMUST00000031364 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cldn34dA2AGU5 Dmbt1-202ENSMUST00000208311 6272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cldn34dA2AGU5 Pak6-202ENSMUST00000110853 3677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cldn34dA2AGU5 C130012C08Rik-201ENSMUST00000194287 3665 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Cldn34dA2AGU5 Lcmt2-202ENSMUST00000110674 3056 ntAPPRIS P1 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cldn34dA2AGU5 Ntrk2-202ENSMUST00000109838 6846 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cldn34dA2AGU5 Olfr648-202ENSMUST00000216612 2929 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cldn34dA2AGU5 Tmem237-202ENSMUST00000094917 1869 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cldn34dA2AGU5 Sspn-201ENSMUST00000032383 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cldn34dA2AGU5 Tmem136-201ENSMUST00000061833 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cldn34dA2AGU5 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cldn34dA2AGU5 Fndc3b-201ENSMUST00000046157 6875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cldn34dA2AGU5 Jph2-202ENSMUST00000109425 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cldn34dA2AGU5 Gm9279-201ENSMUST00000223175 1606 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Cldn34dA2AGU5 Gm9742-201ENSMUST00000165220 1553 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cldn34dA2AGU5 Srek1-201ENSMUST00000074616 3934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.2 ms