Protein–RNA interactions for Protein: A2AGT5

Ckap5, Cytoskeleton-associated protein 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,032 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ckap5A2AGT5 C1qtnf1-201ENSMUST00000017590 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ckap5A2AGT5 Olfr1234-202ENSMUST00000111543 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ckap5A2AGT5 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ckap5A2AGT5 Arhgap33-203ENSMUST00000207858 4337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ckap5A2AGT5 Cdyl-202ENSMUST00000163595 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ckap5A2AGT5 Gm15897-201ENSMUST00000117770 1486 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Ckap5A2AGT5 Lrriq4-201ENSMUST00000108265 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ckap5A2AGT5 Pdhx-202ENSMUST00000111183 2078 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ckap5A2AGT5 Gm26551-201ENSMUST00000181262 2432 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ckap5A2AGT5 Nrg1-210ENSMUST00000208488 2403 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ckap5A2AGT5 Eme1-201ENSMUST00000039949 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ckap5A2AGT5 Gm15459-201ENSMUST00000117405 1941 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Ckap5A2AGT5 Gm8355-201ENSMUST00000177767 1941 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Ckap5A2AGT5 Clcn3-204ENSMUST00000110301 4099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ckap5A2AGT5 Acad12-202ENSMUST00000111776 2269 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ckap5A2AGT5 Bscl2-203ENSMUST00000159634 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ckap5A2AGT5 Tfap2c-202ENSMUST00000099058 2985 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ckap5A2AGT5 Mtch2-211ENSMUST00000150232 2377 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ckap5A2AGT5 Mansc1-201ENSMUST00000047443 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ckap5A2AGT5 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ckap5A2AGT5 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ckap5A2AGT5 Gm13297-201ENSMUST00000120205 934 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Ckap5A2AGT5 Gm6621-201ENSMUST00000193251 772 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Ckap5A2AGT5 Gm38411-201ENSMUST00000197971 941 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ckap5A2AGT5 3830422I06Rik-201ENSMUST00000200199 1181 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Ckap5A2AGT5 Gm5781-201ENSMUST00000219792 443 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Ckap5A2AGT5 Gm34466-201ENSMUST00000222218 505 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ckap5A2AGT5 AC139319.1-201ENSMUST00000223331 690 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ckap5A2AGT5 CT009713.10-202ENSMUST00000225734 696 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Ckap5A2AGT5 Nudt22-201ENSMUST00000041686 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ckap5A2AGT5 Rassf8-202ENSMUST00000058538 1131 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Ckap5A2AGT5 Olfr12-201ENSMUST00000081274 1121 ntAPPRIS P1 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ckap5A2AGT5 Gm12166-201ENSMUST00000093169 958 ntAPPRIS P1 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ckap5A2AGT5 Rnf10-201ENSMUST00000040555 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ckap5A2AGT5 AC137842.1-201ENSMUST00000227896 2064 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Ckap5A2AGT5 Sacs-202ENSMUST00000119509 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ckap5A2AGT5 Gm4219-201ENSMUST00000168140 2143 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ckap5A2AGT5 Pnpla5-201ENSMUST00000019012 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ckap5A2AGT5 Tollip-204ENSMUST00000151890 1753 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ckap5A2AGT5 Cfap77-204ENSMUST00000189711 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ckap5A2AGT5 Nfyc-203ENSMUST00000118902 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ckap5A2AGT5 Ces2e-202ENSMUST00000109410 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ckap5A2AGT5 Cux2-202ENSMUST00000111752 8784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ckap5A2AGT5 Scube1-203ENSMUST00000076060 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ckap5A2AGT5 Trpm4-209ENSMUST00000211743 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ckap5A2AGT5 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ckap5A2AGT5 Bcl2l1-202ENSMUST00000109820 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ckap5A2AGT5 Grin1-204ENSMUST00000114310 4276 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ckap5A2AGT5 Gm5939-201ENSMUST00000119613 2874 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Ckap5A2AGT5 Trav4d-3-201ENSMUST00000103592 331 ntAPPRIS P1 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ckap5A2AGT5 Trav4d-4-201ENSMUST00000103600 354 ntAPPRIS P1 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ckap5A2AGT5 Trav4n-3-201ENSMUST00000103618 331 ntAPPRIS P1 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ckap5A2AGT5 Trav4n-4-201ENSMUST00000103627 354 ntAPPRIS P1 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ckap5A2AGT5 Trav4-3-201ENSMUST00000103655 411 ntAPPRIS P1 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ckap5A2AGT5 Trav4-4-dv10-201ENSMUST00000103663 361 ntAPPRIS P1 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ckap5A2AGT5 A430093F15Rik-204ENSMUST00000186596 2115 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ckap5A2AGT5 Spata33-205ENSMUST00000212523 486 ntTSL 3 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ckap5A2AGT5 1500011B03Rik-201ENSMUST00000061251 579 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ckap5A2AGT5 Gm42878-202ENSMUST00000200170 4783 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ckap5A2AGT5 Rfx7-203ENSMUST00000183372 1457 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ckap5A2AGT5 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ckap5A2AGT5 Col22a1-202ENSMUST00000159993 8809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ckap5A2AGT5 Tmc6-201ENSMUST00000026659 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ckap5A2AGT5 Dnajb5-203ENSMUST00000098112 3093 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ckap5A2AGT5 Fetub-203ENSMUST00000167399 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ckap5A2AGT5 Tle6-201ENSMUST00000072020 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ckap5A2AGT5 Lmf2-201ENSMUST00000023283 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ckap5A2AGT5 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ckap5A2AGT5 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ckap5A2AGT5 Mpp3-204ENSMUST00000107168 3094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ckap5A2AGT5 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ckap5A2AGT5 Pianp-207ENSMUST00000162170 2053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ckap5A2AGT5 Gm26799-201ENSMUST00000180959 1361 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ckap5A2AGT5 Fgf18-202ENSMUST00000109363 991 ntTSL 3 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ckap5A2AGT5 Cabp1-203ENSMUST00000112112 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ckap5A2AGT5 E130006D01Rik-203ENSMUST00000137398 906 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ckap5A2AGT5 Gm7895-201ENSMUST00000187459 1173 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Ckap5A2AGT5 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ckap5A2AGT5 Ppil2-212ENSMUST00000164458 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ckap5A2AGT5 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ckap5A2AGT5 Dpp6-204ENSMUST00000122171 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ckap5A2AGT5 Klhl8-203ENSMUST00000112815 2898 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ckap5A2AGT5 Hectd2-208ENSMUST00000169036 3842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ckap5A2AGT5 Gm37827-201ENSMUST00000194486 1542 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Ckap5A2AGT5 Ctsl-201ENSMUST00000021933 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ckap5A2AGT5 Wwox-203ENSMUST00000109108 1771 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ckap5A2AGT5 Riox2-203ENSMUST00000120674 1753 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ckap5A2AGT5 Zer1-202ENSMUST00000113677 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ckap5A2AGT5 Pnck-203ENSMUST00000114473 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ckap5A2AGT5 Olfr56-204ENSMUST00000203149 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ckap5A2AGT5 Gm22323-201ENSMUST00000103832 109 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Ckap5A2AGT5 Pagr1b-201ENSMUST00000172958 693 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ckap5A2AGT5 Gm28638-201ENSMUST00000188152 288 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ckap5A2AGT5 Lsmem2-201ENSMUST00000191791 369 ntTSL 3 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ckap5A2AGT5 Gm44364-201ENSMUST00000198368 141 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Ckap5A2AGT5 Gm7783-201ENSMUST00000204795 781 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Ckap5A2AGT5 AC131777.1-201ENSMUST00000214749 387 ntTSL 3 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ckap5A2AGT5 Pym1-203ENSMUST00000218218 1143 ntTSL 3 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ckap5A2AGT5 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ckap5A2AGT5 Ermard-203ENSMUST00000097393 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.9 ms