Protein–RNA interactions for Protein: A2A935

Prdm16, PR domain zinc finger protein 16, mousemouse

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Length 1,275 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prdm16A2A935 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Prdm16A2A935 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Prdm16A2A935 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Prdm16A2A935 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Prdm16A2A935 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Prdm16A2A935 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Prdm16A2A935 Acad12-202ENSMUST00000111776 2269 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Prdm16A2A935 Serpinh1-203ENSMUST00000207849 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Prdm16A2A935 Pipox-201ENSMUST00000017597 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Prdm16A2A935 Luc7l-201ENSMUST00000025023 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Prdm16A2A935 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Prdm16A2A935 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Prdm16A2A935 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Prdm16A2A935 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Prdm16A2A935 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Prdm16A2A935 Stau2-215ENSMUST00000162435 2735 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Prdm16A2A935 Nrf1-209ENSMUST00000115209 2406 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Prdm16A2A935 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Prdm16A2A935 Gm15711-201ENSMUST00000118889 535 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Prdm16A2A935 Gm11752-201ENSMUST00000143291 510 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Prdm16A2A935 Gm11290-203ENSMUST00000147811 314 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
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Prdm16A2A935 Gm3508-201ENSMUST00000186012 792 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Prdm16A2A935 Gm18304-201ENSMUST00000189162 546 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Prdm16A2A935 4930412E21Rik-201ENSMUST00000194267 778 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Prdm16A2A935 AC154634.3-201ENSMUST00000224589 736 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Prdm16A2A935 Tm2d3-201ENSMUST00000032726 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Prdm16A2A935 Nudt7-201ENSMUST00000066514 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Prdm16A2A935 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Prdm16A2A935 Dhrs3-206ENSMUST00000154208 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Prdm16A2A935 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Prdm16A2A935 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Prdm16A2A935 Gm16853-201ENSMUST00000181812 1986 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Prdm16A2A935 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Prdm16A2A935 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Prdm16A2A935 Nek7-201ENSMUST00000027642 3737 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Prdm16A2A935 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Prdm16A2A935 Prdx1-202ENSMUST00000106470 877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
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Prdm16A2A935 Gm13935-201ENSMUST00000121859 798 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
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Prdm16A2A935 Washc3-201ENSMUST00000020248 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Prdm16A2A935 Mob2-203ENSMUST00000209732 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Prdm16A2A935 AC154252.2-201ENSMUST00000223593 767 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Prdm16A2A935 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Prdm16A2A935 Cox5a-201ENSMUST00000000090 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Prdm16A2A935 F830115B05Rik-201ENSMUST00000197638 1894 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Prdm16A2A935 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Prdm16A2A935 Cipc-211ENSMUST00000191463 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Prdm16A2A935 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Prdm16A2A935 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Prdm16A2A935 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Prdm16A2A935 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Prdm16A2A935 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Prdm16A2A935 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Prdm16A2A935 Kdelr1-201ENSMUST00000002855 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Prdm16A2A935 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Prdm16A2A935 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Prdm16A2A935 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
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Prdm16A2A935 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Prdm16A2A935 Ankrd61-203ENSMUST00000110718 1774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Prdm16A2A935 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Prdm16A2A935 Trav13-1-201ENSMUST00000103651 331 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Prdm16A2A935 Hopx-202ENSMUST00000113453 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
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Prdm16A2A935 Nr1h2-ps-201ENSMUST00000183844 478 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Prdm16A2A935 Gm43298-201ENSMUST00000200887 866 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Prdm16A2A935 Gm35082-202ENSMUST00000208164 525 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Prdm16A2A935 5330413P13Rik-205ENSMUST00000210961 913 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
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Prdm16A2A935 Cd37-202ENSMUST00000098461 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Prdm16A2A935 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Prdm16A2A935 Abhd18-202ENSMUST00000108078 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Prdm16A2A935 Rpsa-201ENSMUST00000035105 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Prdm16A2A935 Gramd2-201ENSMUST00000098661 1368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Prdm16A2A935 Gm20721-201ENSMUST00000168292 1484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Prdm16A2A935 BC025446-201ENSMUST00000055719 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Prdm16A2A935 Cd8b1-201ENSMUST00000065248 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Prdm16A2A935 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Prdm16A2A935 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Prdm16A2A935 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Prdm16A2A935 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Prdm16A2A935 Alx1-201ENSMUST00000040859 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Prdm16A2A935 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Prdm16A2A935 Gm26777-201ENSMUST00000181852 2573 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Prdm16A2A935 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Prdm16A2A935 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Prdm16A2A935 Gm19385-201ENSMUST00000214714 1813 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Prdm16A2A935 Polr3g-201ENSMUST00000048993 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Prdm16A2A935 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Prdm16A2A935 Spred2-202ENSMUST00000093299 4449 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
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