Protein–RNA interactions for Protein: W8DXL4

Lrit3, Leucine-rich repeat, immunoglobulin-like domain and transmembrane domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 681 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrit3W8DXL4 Gm12403-201ENSMUST00000121384 959 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Lrit3W8DXL4 Mpc1-202ENSMUST00000124023 555 ntTSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Lrit3W8DXL4 Gm20482-202ENSMUST00000174729 825 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Lrit3W8DXL4 Gm10359-201ENSMUST00000180167 1002 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Lrit3W8DXL4 Gm12033-201ENSMUST00000180654 1002 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Lrit3W8DXL4 Gm5559-201ENSMUST00000180755 1002 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Lrit3W8DXL4 Gm4335-201ENSMUST00000182581 1004 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Lrit3W8DXL4 Gm29237-201ENSMUST00000186216 448 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Lrit3W8DXL4 Gm38144-201ENSMUST00000192790 465 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Lrit3W8DXL4 Gm45720-201ENSMUST00000211881 484 ntTSL 3 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Lrit3W8DXL4 Cd63-204ENSMUST00000219317 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Lrit3W8DXL4 Tnfrsf4-201ENSMUST00000030952 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Lrit3W8DXL4 Nkiras2-202ENSMUST00000051947 831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Lrit3W8DXL4 Krtap4-7-201ENSMUST00000055121 984 ntAPPRIS P1 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Lrit3W8DXL4 Il27-201ENSMUST00000058429 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Lrit3W8DXL4 Prss2-201ENSMUST00000070380 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Lrit3W8DXL4 Mybphl-201ENSMUST00000090563 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Lrit3W8DXL4 Ddx23-201ENSMUST00000003450 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Lrit3W8DXL4 Spock3-202ENSMUST00000117377 3066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Lrit3W8DXL4 Eif4e2-206ENSMUST00000113233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Lrit3W8DXL4 Gypa-201ENSMUST00000063359 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Lrit3W8DXL4 0610009O20Rik-201ENSMUST00000025314 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Lrit3W8DXL4 Mpi-201ENSMUST00000034856 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Lrit3W8DXL4 Gria4-203ENSMUST00000163309 2338 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Lrit3W8DXL4 Dpysl5-203ENSMUST00000114729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Lrit3W8DXL4 Ankrd61-201ENSMUST00000079624 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Lrit3W8DXL4 Wnk1-203ENSMUST00000088644 11330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Lrit3W8DXL4 Rp2-201ENSMUST00000033372 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Lrit3W8DXL4 Gm43423-201ENSMUST00000198390 2094 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Lrit3W8DXL4 Ccdc185-201ENSMUST00000060041 2055 ntAPPRIS P1 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Lrit3W8DXL4 Gm9754-201ENSMUST00000031305 3004 ntTSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Lrit3W8DXL4 Nol10-201ENSMUST00000046011 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Lrit3W8DXL4 Dhx57-201ENSMUST00000038166 4918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Lrit3W8DXL4 Ascc1-202ENSMUST00000164083 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Lrit3W8DXL4 Chrnd-202ENSMUST00000186373 2949 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Lrit3W8DXL4 Alox12e-201ENSMUST00000019051 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Lrit3W8DXL4 Gm37861-201ENSMUST00000193534 2869 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Lrit3W8DXL4 Aida-201ENSMUST00000109166 4279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Lrit3W8DXL4 Sp2-201ENSMUST00000062652 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Lrit3W8DXL4 Enc1-201ENSMUST00000041623 4737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Lrit3W8DXL4 Lgals8-203ENSMUST00000124888 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Lrit3W8DXL4 Acp5-203ENSMUST00000165735 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Lrit3W8DXL4 Nkain3-202ENSMUST00000119374 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Lrit3W8DXL4 Smim14-205ENSMUST00000139122 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Lrit3W8DXL4 Glipr2-202ENSMUST00000107855 1816 ntTSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Lrit3W8DXL4 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Lrit3W8DXL4 Rph3a-203ENSMUST00000202326 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Lrit3W8DXL4 Tsku-205ENSMUST00000167405 2597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Lrit3W8DXL4 Phlda2-201ENSMUST00000010904 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Lrit3W8DXL4 Styxl1-205ENSMUST00000111164 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Lrit3W8DXL4 Gm13786-201ENSMUST00000122371 333 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Lrit3W8DXL4 Gm11754-201ENSMUST00000156576 661 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Lrit3W8DXL4 Abhd14a-202ENSMUST00000171678 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Lrit3W8DXL4 Smad7-204ENSMUST00000174411 769 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Lrit3W8DXL4 Dtnb-223ENSMUST00000174547 2112 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Lrit3W8DXL4 Gm24514-201ENSMUST00000174961 285 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Lrit3W8DXL4 Gm4819-201ENSMUST00000182170 1009 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Lrit3W8DXL4 Gm26927-201ENSMUST00000182385 965 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Lrit3W8DXL4 Gm6082-201ENSMUST00000215204 454 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Lrit3W8DXL4 Gm17870-201ENSMUST00000219489 1174 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Lrit3W8DXL4 AC154462.2-201ENSMUST00000227519 370 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Lrit3W8DXL4 Hbb-bs-201ENSMUST00000023934 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Lrit3W8DXL4 Treml1-201ENSMUST00000024792 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Lrit3W8DXL4 Cldnd2-201ENSMUST00000040227 664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Lrit3W8DXL4 Upk2-201ENSMUST00000047740 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Lrit3W8DXL4 Gm13199-201ENSMUST00000071016 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Lrit3W8DXL4 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Lrit3W8DXL4 Ncam2-201ENSMUST00000037785 4893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Lrit3W8DXL4 Gm43796-201ENSMUST00000202853 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.46
Lrit3W8DXL4 Cenpl-202ENSMUST00000111618 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.46
Lrit3W8DXL4 Bptf-202ENSMUST00000106762 11847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.46
Lrit3W8DXL4 1500009C09Rik-202ENSMUST00000143238 1552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Lrit3W8DXL4 Gm15459-201ENSMUST00000117405 1941 ntBASIC12.21□□□□□ -0.46
Lrit3W8DXL4 Gm8355-201ENSMUST00000177767 1941 ntBASIC12.21□□□□□ -0.46
Lrit3W8DXL4 Ano6-201ENSMUST00000071874 4927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Lrit3W8DXL4 Nol9-201ENSMUST00000084116 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Lrit3W8DXL4 Hdgfl2-210ENSMUST00000225843 2238 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.21□□□□□ -0.46
Lrit3W8DXL4 Gpc2-205ENSMUST00000161827 2586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Lrit3W8DXL4 Spata21-201ENSMUST00000051907 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Lrit3W8DXL4 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Lrit3W8DXL4 Fam71f1-204ENSMUST00000166462 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Lrit3W8DXL4 Slc25a42-201ENSMUST00000063788 3081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Lrit3W8DXL4 Ctdspl2-204ENSMUST00000110578 3386 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Lrit3W8DXL4 Krt32-201ENSMUST00000107419 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Lrit3W8DXL4 Renbp-209ENSMUST00000155597 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Lrit3W8DXL4 Fktn-204ENSMUST00000221657 6241 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Lrit3W8DXL4 Gm7324-201ENSMUST00000094051 1647 ntAPPRIS P1 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Lrit3W8DXL4 Ikzf4-201ENSMUST00000133342 5150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Lrit3W8DXL4 Def8-203ENSMUST00000093049 1909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Lrit3W8DXL4 Pdgfc-201ENSMUST00000029652 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Lrit3W8DXL4 Trav4d-3-201ENSMUST00000103592 331 ntAPPRIS P1 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Lrit3W8DXL4 Trav4d-4-201ENSMUST00000103600 354 ntAPPRIS P1 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Lrit3W8DXL4 Trav4n-3-201ENSMUST00000103618 331 ntAPPRIS P1 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Lrit3W8DXL4 Trav4n-4-201ENSMUST00000103627 354 ntAPPRIS P1 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Lrit3W8DXL4 Trav4-3-201ENSMUST00000103655 411 ntAPPRIS P1 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Lrit3W8DXL4 Trav4-4-dv10-201ENSMUST00000103663 361 ntAPPRIS P1 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Lrit3W8DXL4 Cpsf4l-203ENSMUST00000106617 1123 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Lrit3W8DXL4 Tomm5-204ENSMUST00000107810 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Lrit3W8DXL4 Mogat1-201ENSMUST00000012331 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Lrit3W8DXL4 Gm11290-201ENSMUST00000124833 396 ntTSL 3 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.3 ms