Protein–RNA interactions for Protein: W4VSP1

Speer3, MCG129800, mousemouse

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Length 261 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Speer3W4VSP1 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Speer3W4VSP1 Phf24-202ENSMUST00000107975 6494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Speer3W4VSP1 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Speer3W4VSP1 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Speer3W4VSP1 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Speer3W4VSP1 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Speer3W4VSP1 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Speer3W4VSP1 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Speer3W4VSP1 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Speer3W4VSP1 Myo18b-201ENSMUST00000086617 8280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Speer3W4VSP1 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Speer3W4VSP1 Tbc1d1-202ENSMUST00000101195 5432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Speer3W4VSP1 Kifc1-204ENSMUST00000173492 2350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Speer3W4VSP1 Slc6a4-202ENSMUST00000108402 2796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Speer3W4VSP1 Eif4enif1-213ENSMUST00000179770 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Speer3W4VSP1 Smg7-203ENSMUST00000111836 3928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Speer3W4VSP1 Rccd1-201ENSMUST00000047362 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Speer3W4VSP1 1810058I24Rik-203ENSMUST00000152147 2521 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Speer3W4VSP1 D6Ertd527e-203ENSMUST00000203747 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Speer3W4VSP1 Ndc80-201ENSMUST00000024851 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Speer3W4VSP1 Slc22a2-201ENSMUST00000046959 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Speer3W4VSP1 Atxn7l1os2-201ENSMUST00000138617 2019 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Speer3W4VSP1 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Speer3W4VSP1 Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 1701 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Speer3W4VSP1 Gm43980-201ENSMUST00000204899 1612 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Speer3W4VSP1 Asb10-202ENSMUST00000117900 1432 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Speer3W4VSP1 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Speer3W4VSP1 Oasl1-202ENSMUST00000112143 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Speer3W4VSP1 Kdm2b-203ENSMUST00000086200 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Speer3W4VSP1 Dnm2-206ENSMUST00000172482 2613 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Speer3W4VSP1 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Speer3W4VSP1 Alox12e-201ENSMUST00000019051 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Speer3W4VSP1 Aldh6a1-201ENSMUST00000085192 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Speer3W4VSP1 Micu1-201ENSMUST00000020311 2336 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Speer3W4VSP1 Pold3-201ENSMUST00000032969 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Speer3W4VSP1 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Speer3W4VSP1 Gm11893-201ENSMUST00000117829 491 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Speer3W4VSP1 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Speer3W4VSP1 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Speer3W4VSP1 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Speer3W4VSP1 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
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Speer3W4VSP1 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Speer3W4VSP1 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Speer3W4VSP1 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Speer3W4VSP1 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Speer3W4VSP1 Gm5178-201ENSMUST00000219380 898 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Speer3W4VSP1 mt-Nd3-201ENSMUST00000082411 348 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Speer3W4VSP1 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Speer3W4VSP1 Mcpt9-201ENSMUST00000095798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Speer3W4VSP1 Tgm1-201ENSMUST00000002389 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Speer3W4VSP1 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Speer3W4VSP1 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Speer3W4VSP1 Dab2ip-201ENSMUST00000065001 6392 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Speer3W4VSP1 Sorl1-201ENSMUST00000060989 10715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Speer3W4VSP1 Asph-212ENSMUST00000108340 6646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Speer3W4VSP1 Ttc14-201ENSMUST00000099153 9661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
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Speer3W4VSP1 Gm10652-201ENSMUST00000199790 2622 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Speer3W4VSP1 Bud13-201ENSMUST00000074957 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Speer3W4VSP1 Klhl30-201ENSMUST00000027533 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
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Speer3W4VSP1 2810430I11Rik-201ENSMUST00000154246 3416 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
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Speer3W4VSP1 Zfp354c-202ENSMUST00000109135 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Speer3W4VSP1 Egfl6-201ENSMUST00000000412 2704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Speer3W4VSP1 Fosb-207ENSMUST00000208505 3523 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Speer3W4VSP1 Dip2a-202ENSMUST00000105417 6383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Speer3W4VSP1 Hhatl-202ENSMUST00000163981 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Speer3W4VSP1 Eme1-201ENSMUST00000039949 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Speer3W4VSP1 Col26a1-202ENSMUST00000111103 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Speer3W4VSP1 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Speer3W4VSP1 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Speer3W4VSP1 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Speer3W4VSP1 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Speer3W4VSP1 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Speer3W4VSP1 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Speer3W4VSP1 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Speer3W4VSP1 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Speer3W4VSP1 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Speer3W4VSP1 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Speer3W4VSP1 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Speer3W4VSP1 Haus7-202ENSMUST00000077243 1032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Speer3W4VSP1 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Speer3W4VSP1 BC061237-201ENSMUST00000096899 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Speer3W4VSP1 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Speer3W4VSP1 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Speer3W4VSP1 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Speer3W4VSP1 Pcdhgb6-201ENSMUST00000003599 4684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
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