Protein–RNA interactions for Protein: W4VSN7

Gm3550, 60S ribosomal protein L29, mousemouse

Predictions only

Length 160 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3550W4VSN7 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm3550W4VSN7 7420426K07Rik-201ENSMUST00000098460 1504 ntAPPRIS P1 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm3550W4VSN7 Kcnn1-204ENSMUST00000212086 2964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm3550W4VSN7 Etv3-205ENSMUST00000170036 5127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm3550W4VSN7 Fancc-201ENSMUST00000073029 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm3550W4VSN7 Gm5466-201ENSMUST00000119395 1890 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm3550W4VSN7 Zap70-201ENSMUST00000027291 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm3550W4VSN7 Dll1-201ENSMUST00000014917 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm3550W4VSN7 Sin3a-206ENSMUST00000168177 5086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm3550W4VSN7 Map3k2-201ENSMUST00000096575 10791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm3550W4VSN7 Micu1-204ENSMUST00000165563 2442 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm3550W4VSN7 Gm34006-202ENSMUST00000216467 1918 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm3550W4VSN7 AC096628.2-201ENSMUST00000225443 1413 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm3550W4VSN7 Pitpnm3-202ENSMUST00000108508 6450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm3550W4VSN7 Rbpj-207ENSMUST00000201883 4961 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm3550W4VSN7 Gm26841-201ENSMUST00000180725 1787 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm3550W4VSN7 Atp9a-204ENSMUST00000109177 3456 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm3550W4VSN7 Rasgrp2-207ENSMUST00000113475 573 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm3550W4VSN7 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm3550W4VSN7 Gm13689-201ENSMUST00000119360 685 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm3550W4VSN7 Gm11400-201ENSMUST00000120853 1214 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm3550W4VSN7 Gm15821-201ENSMUST00000121995 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm3550W4VSN7 Fbxw4-204ENSMUST00000160018 931 ntTSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm3550W4VSN7 Gm26894-201ENSMUST00000180828 1134 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm3550W4VSN7 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm3550W4VSN7 Gm4610-201ENSMUST00000198222 905 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm3550W4VSN7 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm3550W4VSN7 Nme2-201ENSMUST00000021217 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm3550W4VSN7 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm3550W4VSN7 Cby3-201ENSMUST00000052596 703 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm3550W4VSN7 Snx10-201ENSMUST00000049152 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm3550W4VSN7 Adam33-202ENSMUST00000110232 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm3550W4VSN7 Mgll-201ENSMUST00000089449 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm3550W4VSN7 4931414P19Rik-201ENSMUST00000022786 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm3550W4VSN7 Hoxd10-201ENSMUST00000061745 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm3550W4VSN7 Slc6a6-201ENSMUST00000032185 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm3550W4VSN7 Ripor3-201ENSMUST00000099073 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm3550W4VSN7 Irf6-201ENSMUST00000076521 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm3550W4VSN7 Renbp-209ENSMUST00000155597 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm3550W4VSN7 Mfsd14b-201ENSMUST00000054730 3251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm3550W4VSN7 Tcf4-204ENSMUST00000114978 2437 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm3550W4VSN7 Dmbt1-201ENSMUST00000084509 6243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm3550W4VSN7 Wipf3-201ENSMUST00000126637 4414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm3550W4VSN7 Gm20633-201ENSMUST00000176742 2831 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm3550W4VSN7 Gorasp1-201ENSMUST00000035099 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm3550W4VSN7 Adm-201ENSMUST00000033054 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm3550W4VSN7 Tbc1d1-202ENSMUST00000101195 5432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm3550W4VSN7 Ttc14-201ENSMUST00000099153 9661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm3550W4VSN7 Mpp3-204ENSMUST00000107168 3094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm3550W4VSN7 Ctsl-201ENSMUST00000021933 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm3550W4VSN7 Grid2ip-203ENSMUST00000120825 3865 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm3550W4VSN7 Mtch2-211ENSMUST00000150232 2377 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm3550W4VSN7 Hlf-201ENSMUST00000004051 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm3550W4VSN7 Hsd3b4-202ENSMUST00000196861 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm3550W4VSN7 Gm10681-201ENSMUST00000058728 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm3550W4VSN7 Pck2-205ENSMUST00000226352 2784 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm3550W4VSN7 Ddx46-202ENSMUST00000172272 5676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm3550W4VSN7 Ddx46-201ENSMUST00000099479 5664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm3550W4VSN7 Kiss1r-201ENSMUST00000045529 3163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm3550W4VSN7 Nek1-209ENSMUST00000211672 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm3550W4VSN7 Trpv4-202ENSMUST00000112217 2436 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm3550W4VSN7 Nmral1-204ENSMUST00000120056 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm3550W4VSN7 Eme1-201ENSMUST00000039949 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm3550W4VSN7 Anapc11-201ENSMUST00000026128 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm3550W4VSN7 Gm6161-201ENSMUST00000121942 1102 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm3550W4VSN7 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm3550W4VSN7 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm3550W4VSN7 Tbx3os1-203ENSMUST00000140101 490 ntTSL 3 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm3550W4VSN7 Hnrnpa3-207ENSMUST00000164947 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm3550W4VSN7 Gm6254-201ENSMUST00000168178 1072 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm3550W4VSN7 Gm6153-201ENSMUST00000172004 1058 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm3550W4VSN7 Gm9242-201ENSMUST00000177820 1074 ntAPPRIS P1 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm3550W4VSN7 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm3550W4VSN7 Gm37917-201ENSMUST00000194711 392 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm3550W4VSN7 Gm5641-202ENSMUST00000198699 1080 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm3550W4VSN7 CT573086.1-201ENSMUST00000227202 1074 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm3550W4VSN7 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm3550W4VSN7 Duoxa1-201ENSMUST00000028653 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm3550W4VSN7 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm3550W4VSN7 A930007I19Rik-203ENSMUST00000181726 2099 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm3550W4VSN7 AC137842.1-201ENSMUST00000227896 2064 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm3550W4VSN7 Vax2os-203ENSMUST00000155159 4063 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm3550W4VSN7 Dag1-204ENSMUST00000191899 5662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm3550W4VSN7 Apaf1-207ENSMUST00000161987 2710 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm3550W4VSN7 Otx2-201ENSMUST00000118578 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm3550W4VSN7 Gne-209ENSMUST00000173234 2149 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm3550W4VSN7 Gm26747-201ENSMUST00000180597 1716 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm3550W4VSN7 Tulp2-201ENSMUST00000024233 1749 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm3550W4VSN7 Bdnf-205ENSMUST00000111045 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm3550W4VSN7 Ylpm1-202ENSMUST00000101202 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm3550W4VSN7 Acadsb-201ENSMUST00000015829 6081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm3550W4VSN7 Atp6ap1-202ENSMUST00000114171 2157 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm3550W4VSN7 Mast1-201ENSMUST00000109741 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm3550W4VSN7 Apc2-201ENSMUST00000020349 9074 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm3550W4VSN7 Ifnar2-201ENSMUST00000023693 3047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm3550W4VSN7 Fam187a-201ENSMUST00000100369 1563 ntAPPRIS P1 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm3550W4VSN7 Kcnab2-203ENSMUST00000159186 1552 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm3550W4VSN7 Rgs6-204ENSMUST00000185674 1362 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm3550W4VSN7 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm3550W4VSN7 Triml2-203ENSMUST00000209872 1395 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 101.9 ms