Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2P8

Vamp5, Vesicle-associated membrane protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 102 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vamp5Q9Z2P8 Spry2-201ENSMUST00000022709 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Vamp5Q9Z2P8 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Vamp5Q9Z2P8 AC122314.1-201ENSMUST00000223056 2239 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Vamp5Q9Z2P8 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Vamp5Q9Z2P8 Neat1-202ENSMUST00000174287 3004 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Vamp5Q9Z2P8 Mei1-201ENSMUST00000089178 3974 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Vamp5Q9Z2P8 Rab31-201ENSMUST00000070673 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Vamp5Q9Z2P8 Dopey2-207ENSMUST00000227156 7340 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Vamp5Q9Z2P8 Hdac5-202ENSMUST00000107150 3759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Vamp5Q9Z2P8 Rnf180-205ENSMUST00000226044 3279 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Vamp5Q9Z2P8 Tax1bp1-201ENSMUST00000080723 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Vamp5Q9Z2P8 Galnt11-202ENSMUST00000114950 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Vamp5Q9Z2P8 Sgce-203ENSMUST00000101677 1656 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Vamp5Q9Z2P8 Ngfr-201ENSMUST00000000122 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Vamp5Q9Z2P8 Zfp41-201ENSMUST00000054555 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Vamp5Q9Z2P8 Gtf3c1-204ENSMUST00000205659 6570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Vamp5Q9Z2P8 Grk4-202ENSMUST00000074651 3234 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Vamp5Q9Z2P8 Mapk8ip3-202ENSMUST00000115228 5424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Vamp5Q9Z2P8 Tpra1-219ENSMUST00000203345 3359 ntTSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Vamp5Q9Z2P8 Tcf4-204ENSMUST00000114978 2437 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Vamp5Q9Z2P8 Mrpl45-201ENSMUST00000019026 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Vamp5Q9Z2P8 Aak1-201ENSMUST00000003710 7203 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Vamp5Q9Z2P8 Astn1-209ENSMUST00000194369 3344 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Vamp5Q9Z2P8 Ap1s2-201ENSMUST00000033734 1785 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Vamp5Q9Z2P8 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Vamp5Q9Z2P8 Atl3-202ENSMUST00000170373 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Vamp5Q9Z2P8 Gnas-203ENSMUST00000087876 3719 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Vamp5Q9Z2P8 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Vamp5Q9Z2P8 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Vamp5Q9Z2P8 Dcaf11-203ENSMUST00000117701 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Vamp5Q9Z2P8 Gm37368-201ENSMUST00000193173 3212 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Vamp5Q9Z2P8 Gja5-203ENSMUST00000199597 3668 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Vamp5Q9Z2P8 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Vamp5Q9Z2P8 Tcf4-252ENSMUST00000202477 1873 ntTSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Vamp5Q9Z2P8 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Vamp5Q9Z2P8 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Vamp5Q9Z2P8 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Vamp5Q9Z2P8 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Vamp5Q9Z2P8 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Vamp5Q9Z2P8 Helq-201ENSMUST00000044684 3689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Vamp5Q9Z2P8 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Vamp5Q9Z2P8 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Vamp5Q9Z2P8 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Vamp5Q9Z2P8 Pdik1l-201ENSMUST00000061234 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Vamp5Q9Z2P8 Adgre5-203ENSMUST00000109802 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Vamp5Q9Z2P8 Vipas39-203ENSMUST00000179379 2418 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Vamp5Q9Z2P8 Trpm7-202ENSMUST00000103224 7107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Vamp5Q9Z2P8 Cyp26b1-204ENSMUST00000204146 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Vamp5Q9Z2P8 Tcf4-258ENSMUST00000202937 2103 ntTSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Vamp5Q9Z2P8 Gm15991-202ENSMUST00000212123 3565 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Vamp5Q9Z2P8 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Vamp5Q9Z2P8 Gm37600-201ENSMUST00000193764 3292 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Vamp5Q9Z2P8 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Vamp5Q9Z2P8 Astl-201ENSMUST00000059839 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Vamp5Q9Z2P8 Bpnt1-201ENSMUST00000027916 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Vamp5Q9Z2P8 Pabpc4-203ENSMUST00000106241 3050 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Vamp5Q9Z2P8 Srek1-201ENSMUST00000074616 3934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Vamp5Q9Z2P8 Thrb-203ENSMUST00000091471 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Vamp5Q9Z2P8 Srrm2-201ENSMUST00000088621 8564 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Vamp5Q9Z2P8 Kifap3-202ENSMUST00000077642 4012 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Vamp5Q9Z2P8 Lig1-210ENSMUST00000165964 3166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Vamp5Q9Z2P8 Gm26577-201ENSMUST00000180680 2184 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Vamp5Q9Z2P8 Rims4-201ENSMUST00000044734 4962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Vamp5Q9Z2P8 Dpysl5-202ENSMUST00000101442 1309 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Vamp5Q9Z2P8 Dclk1-204ENSMUST00000196745 7962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Vamp5Q9Z2P8 Bach1-201ENSMUST00000026703 5867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Vamp5Q9Z2P8 Mbd1-202ENSMUST00000224047 2838 ntAPPRIS P1 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Vamp5Q9Z2P8 Fut8-201ENSMUST00000062804 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Vamp5Q9Z2P8 Med13l-201ENSMUST00000100816 9296 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Vamp5Q9Z2P8 Gngt2-201ENSMUST00000036088 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Vamp5Q9Z2P8 Ank1-204ENSMUST00000117270 5652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Vamp5Q9Z2P8 5830417I10Rik-201ENSMUST00000135913 6190 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Vamp5Q9Z2P8 Rasl12-201ENSMUST00000085453 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Vamp5Q9Z2P8 Lsamp-208ENSMUST00000189358 2766 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Vamp5Q9Z2P8 Erlin1-206ENSMUST00000170801 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Vamp5Q9Z2P8 1700019D03Rik-202ENSMUST00000114492 3565 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Vamp5Q9Z2P8 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Vamp5Q9Z2P8 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Vamp5Q9Z2P8 Oaz2-ps-201ENSMUST00000121735 537 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Vamp5Q9Z2P8 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Vamp5Q9Z2P8 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Vamp5Q9Z2P8 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Vamp5Q9Z2P8 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Vamp5Q9Z2P8 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Vamp5Q9Z2P8 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Vamp5Q9Z2P8 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Vamp5Q9Z2P8 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Vamp5Q9Z2P8 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Vamp5Q9Z2P8 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Vamp5Q9Z2P8 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Vamp5Q9Z2P8 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Vamp5Q9Z2P8 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Vamp5Q9Z2P8 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Vamp5Q9Z2P8 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Vamp5Q9Z2P8 Jarid2-201ENSMUST00000044608 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Vamp5Q9Z2P8 Triobp-204ENSMUST00000109690 7023 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Vamp5Q9Z2P8 Gipr-201ENSMUST00000094790 2856 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Vamp5Q9Z2P8 Rgs3-205ENSMUST00000107424 4084 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Vamp5Q9Z2P8 Vps18-201ENSMUST00000037280 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Vamp5Q9Z2P8 Adra1a-206ENSMUST00000225182 2337 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.2 ms