Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1P4

Lgr5, Leucine-rich repeat-containing G-protein coupled receptor 5, mousemouse

Predictions only

Length 907 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lgr5Q9Z1P4 Gadl1-203ENSMUST00000121770 1763 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lgr5Q9Z1P4 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Lgr5Q9Z1P4 Usp17le-201ENSMUST00000053464 1626 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Lgr5Q9Z1P4 Stx18-203ENSMUST00000114126 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Lgr5Q9Z1P4 Phkg1-201ENSMUST00000026617 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Lgr5Q9Z1P4 Gm17767-201ENSMUST00000189410 1470 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Lgr5Q9Z1P4 Crcp-201ENSMUST00000026608 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Lgr5Q9Z1P4 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Lgr5Q9Z1P4 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lgr5Q9Z1P4 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lgr5Q9Z1P4 Trp53-202ENSMUST00000108657 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lgr5Q9Z1P4 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lgr5Q9Z1P4 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lgr5Q9Z1P4 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lgr5Q9Z1P4 Adsl-206ENSMUST00000168756 1439 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lgr5Q9Z1P4 Alg2-201ENSMUST00000044148 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lgr5Q9Z1P4 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lgr5Q9Z1P4 Pla2g5-204ENSMUST00000102513 2289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lgr5Q9Z1P4 Lag3-201ENSMUST00000032217 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lgr5Q9Z1P4 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lgr5Q9Z1P4 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lgr5Q9Z1P4 CT010488.1-201ENSMUST00000214890 1522 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lgr5Q9Z1P4 Suclg1-201ENSMUST00000064740 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lgr5Q9Z1P4 Tssk5-201ENSMUST00000071119 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lgr5Q9Z1P4 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lgr5Q9Z1P4 Limd2-203ENSMUST00000106875 936 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lgr5Q9Z1P4 Hemk1-202ENSMUST00000118051 453 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lgr5Q9Z1P4 Gm13315-201ENSMUST00000120376 991 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Lgr5Q9Z1P4 Uxt-202ENSMUST00000123836 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lgr5Q9Z1P4 Gm22902-201ENSMUST00000158488 302 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Lgr5Q9Z1P4 Gm20498-202ENSMUST00000164386 1043 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lgr5Q9Z1P4 Tpd52l1-203ENSMUST00000213639 827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lgr5Q9Z1P4 Abhd14b-210ENSMUST00000217496 631 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lgr5Q9Z1P4 Psma7-201ENSMUST00000029082 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lgr5Q9Z1P4 1110017D15Rik-201ENSMUST00000030152 1114 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lgr5Q9Z1P4 Olfr450-201ENSMUST00000067503 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lgr5Q9Z1P4 Ctbp1-212ENSMUST00000202962 3595 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lgr5Q9Z1P4 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lgr5Q9Z1P4 Ficd-201ENSMUST00000065698 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lgr5Q9Z1P4 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lgr5Q9Z1P4 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lgr5Q9Z1P4 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lgr5Q9Z1P4 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lgr5Q9Z1P4 Adi1-201ENSMUST00000020957 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lgr5Q9Z1P4 Rlbp1-202ENSMUST00000179243 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lgr5Q9Z1P4 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lgr5Q9Z1P4 Lztr1-201ENSMUST00000023444 3112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lgr5Q9Z1P4 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lgr5Q9Z1P4 Sgsm3-208ENSMUST00000139517 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lgr5Q9Z1P4 Adtrp-202ENSMUST00000121404 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lgr5Q9Z1P4 Arl4a-205ENSMUST00000146905 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lgr5Q9Z1P4 Fam166b-203ENSMUST00000107929 865 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lgr5Q9Z1P4 Gm9083-201ENSMUST00000120423 819 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Lgr5Q9Z1P4 Rpsa-ps12-201ENSMUST00000120596 892 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Lgr5Q9Z1P4 Gm11597-201ENSMUST00000121423 964 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Lgr5Q9Z1P4 Cox16-204ENSMUST00000166723 579 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lgr5Q9Z1P4 Gm5070-201ENSMUST00000177599 862 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Lgr5Q9Z1P4 Pmvk-203ENSMUST00000184515 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lgr5Q9Z1P4 Gm37666-201ENSMUST00000194110 866 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Lgr5Q9Z1P4 Rpl7a-ps2-201ENSMUST00000200554 774 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Lgr5Q9Z1P4 Gm43050-201ENSMUST00000201062 338 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lgr5Q9Z1P4 Net1-206ENSMUST00000222504 447 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lgr5Q9Z1P4 Ift43-205ENSMUST00000222821 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lgr5Q9Z1P4 AC125209.1-201ENSMUST00000225812 766 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Lgr5Q9Z1P4 Ppie-201ENSMUST00000030404 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lgr5Q9Z1P4 Kcnk7-201ENSMUST00000052448 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lgr5Q9Z1P4 2410015M20Rik-201ENSMUST00000052832 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lgr5Q9Z1P4 Prr15l-202ENSMUST00000062172 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lgr5Q9Z1P4 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lgr5Q9Z1P4 Slc3a2-207ENSMUST00000206598 1393 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lgr5Q9Z1P4 Phyhd1-202ENSMUST00000091132 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lgr5Q9Z1P4 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lgr5Q9Z1P4 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lgr5Q9Z1P4 9030407P20Rik-201ENSMUST00000180933 2310 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lgr5Q9Z1P4 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lgr5Q9Z1P4 Acbd5-213ENSMUST00000227809 1986 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lgr5Q9Z1P4 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lgr5Q9Z1P4 Acin1-202ENSMUST00000022794 2365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lgr5Q9Z1P4 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lgr5Q9Z1P4 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lgr5Q9Z1P4 B230369F24Rik-201ENSMUST00000141846 2560 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lgr5Q9Z1P4 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lgr5Q9Z1P4 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lgr5Q9Z1P4 Plekha5-212ENSMUST00000204876 1928 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lgr5Q9Z1P4 Plekha2-204ENSMUST00000128715 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lgr5Q9Z1P4 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lgr5Q9Z1P4 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lgr5Q9Z1P4 Mir874-201ENSMUST00000104769 76 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Lgr5Q9Z1P4 Gm13813-201ENSMUST00000120998 787 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Lgr5Q9Z1P4 Odf4-202ENSMUST00000125134 646 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lgr5Q9Z1P4 Gm6963-201ENSMUST00000147879 379 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Lgr5Q9Z1P4 Malat1-204ENSMUST00000173523 656 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lgr5Q9Z1P4 Gm27552-201ENSMUST00000183351 62 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Lgr5Q9Z1P4 Gm27844-201ENSMUST00000183613 62 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Lgr5Q9Z1P4 Gm32633-201ENSMUST00000205726 587 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lgr5Q9Z1P4 Ube2g1-201ENSMUST00000021148 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lgr5Q9Z1P4 Gm31224-201ENSMUST00000212682 513 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lgr5Q9Z1P4 Gm19208-201ENSMUST00000213861 912 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Lgr5Q9Z1P4 Gm10312-201ENSMUST00000078515 489 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Lgr5Q9Z1P4 Car6-201ENSMUST00000030817 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.9 ms