Protein–RNA interactions for Protein: Q9R233

Tapbp, Tapasin, mousemouse

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TapbpQ9R233 Gm11978-202ENSMUST00000127510 1303 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
TapbpQ9R233 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
TapbpQ9R233 Zfp354a-202ENSMUST00000102766 2592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
TapbpQ9R233 Gm21982-201ENSMUST00000146232 3821 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
TapbpQ9R233 Apbb2-203ENSMUST00000159512 6632 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
TapbpQ9R233 4930458D05Rik-201ENSMUST00000142871 3055 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
TapbpQ9R233 Kcnd3-201ENSMUST00000079169 2102 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
TapbpQ9R233 Gpr85-201ENSMUST00000060442 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
TapbpQ9R233 Nxf1-201ENSMUST00000010241 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
TapbpQ9R233 Capn3-203ENSMUST00000090028 2640 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
TapbpQ9R233 Dusp13-203ENSMUST00000120956 1070 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
TapbpQ9R233 Gm16342-201ENSMUST00000124025 1025 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
TapbpQ9R233 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
TapbpQ9R233 Gm16194-204ENSMUST00000141797 475 ntTSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
TapbpQ9R233 Gm11752-201ENSMUST00000143291 510 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
TapbpQ9R233 Abhd14a-202ENSMUST00000171678 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
TapbpQ9R233 1700030C10Rik-202ENSMUST00000186243 126 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
TapbpQ9R233 Ube2f-210ENSMUST00000191368 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
TapbpQ9R233 Gm18062-201ENSMUST00000208020 547 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
TapbpQ9R233 Gm18055-201ENSMUST00000208254 547 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
TapbpQ9R233 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
TapbpQ9R233 Rpl29-201ENSMUST00000059802 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
TapbpQ9R233 Celrr-202ENSMUST00000181433 1561 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
TapbpQ9R233 AC122228.1-201ENSMUST00000223113 2057 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
TapbpQ9R233 Cdkl2-203ENSMUST00000113140 2559 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
TapbpQ9R233 Nup98-201ENSMUST00000070165 4052 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
TapbpQ9R233 Dsp-202ENSMUST00000127906 7761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
TapbpQ9R233 Cyp1b1-201ENSMUST00000024894 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
TapbpQ9R233 Tmem201-202ENSMUST00000103208 3620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
TapbpQ9R233 Rccd1-201ENSMUST00000047362 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
TapbpQ9R233 Olfr533-206ENSMUST00000217179 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
TapbpQ9R233 Ppp1r15a-201ENSMUST00000042105 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
TapbpQ9R233 Kcnk16-202ENSMUST00000225596 2127 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
TapbpQ9R233 Terb2-201ENSMUST00000028661 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
TapbpQ9R233 Atat1-212ENSMUST00000141662 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
TapbpQ9R233 AC123834.1-201ENSMUST00000225346 2043 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
TapbpQ9R233 Rubcn-203ENSMUST00000115105 5255 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
TapbpQ9R233 Rnps1-202ENSMUST00000115371 1617 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
TapbpQ9R233 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
TapbpQ9R233 Gtf2i-201ENSMUST00000059042 4455 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
TapbpQ9R233 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
TapbpQ9R233 Gm20554-201ENSMUST00000177421 2352 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
TapbpQ9R233 Plagl1-202ENSMUST00000121646 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
TapbpQ9R233 Pde4d-205ENSMUST00000119507 2163 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
TapbpQ9R233 Mlkl-202ENSMUST00000120432 1976 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
TapbpQ9R233 Thpo-201ENSMUST00000076422 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
TapbpQ9R233 Ahsg-201ENSMUST00000023583 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
TapbpQ9R233 Sec11a-202ENSMUST00000117383 1094 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
TapbpQ9R233 Gm5303-201ENSMUST00000117943 1252 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
TapbpQ9R233 Gm13829-201ENSMUST00000119600 138 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
TapbpQ9R233 1700016P03Rik-201ENSMUST00000134252 863 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
TapbpQ9R233 Gm11574-201ENSMUST00000139752 946 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
TapbpQ9R233 Rasgef1b-209ENSMUST00000168092 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
TapbpQ9R233 Flg-208ENSMUST00000180308 1076 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
TapbpQ9R233 Gm26600-201ENSMUST00000181637 1256 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
TapbpQ9R233 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
TapbpQ9R233 Psmc3ip-201ENSMUST00000019447 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
TapbpQ9R233 Il13-201ENSMUST00000020650 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
TapbpQ9R233 AC138604.1-201ENSMUST00000226969 739 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
TapbpQ9R233 Rasgef1b-201ENSMUST00000031276 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
TapbpQ9R233 Pla2g6-201ENSMUST00000047816 2963 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
TapbpQ9R233 Ppil3-201ENSMUST00000081677 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
TapbpQ9R233 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
TapbpQ9R233 Bysl-201ENSMUST00000024783 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
TapbpQ9R233 Sp9-201ENSMUST00000090813 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
TapbpQ9R233 Fsd1-201ENSMUST00000011733 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
TapbpQ9R233 Prex1-203ENSMUST00000109246 2386 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
TapbpQ9R233 Tcf4-230ENSMUST00000201205 2270 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
TapbpQ9R233 Calcoco1-201ENSMUST00000023818 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
TapbpQ9R233 Nif3l1-206ENSMUST00000171597 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
TapbpQ9R233 Afdn-216ENSMUST00000170827 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
TapbpQ9R233 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
TapbpQ9R233 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
TapbpQ9R233 Irs1-201ENSMUST00000069799 9144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
TapbpQ9R233 Aph1a-201ENSMUST00000015894 2863 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
TapbpQ9R233 Sltm-206ENSMUST00000216816 3755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
TapbpQ9R233 Galnt17-201ENSMUST00000086023 8040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
TapbpQ9R233 Grip1-212ENSMUST00000147356 4145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
TapbpQ9R233 Miat-205ENSMUST00000182953 9163 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
TapbpQ9R233 Srms-201ENSMUST00000016498 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
TapbpQ9R233 Gm42480-201ENSMUST00000198434 2595 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
TapbpQ9R233 Armc8-201ENSMUST00000035043 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
TapbpQ9R233 Esrrb-203ENSMUST00000110204 4196 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
TapbpQ9R233 Reep3-201ENSMUST00000020023 5430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
TapbpQ9R233 Coasy-202ENSMUST00000107308 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
TapbpQ9R233 Abcg5-201ENSMUST00000066175 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
TapbpQ9R233 Gba-202ENSMUST00000167998 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
TapbpQ9R233 2810430I11Rik-201ENSMUST00000154246 3416 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
TapbpQ9R233 Arhgef2-219ENSMUST00000176500 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
TapbpQ9R233 Irak1-203ENSMUST00000101458 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
TapbpQ9R233 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
TapbpQ9R233 Gm15806-201ENSMUST00000120696 955 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
TapbpQ9R233 Rims3-204ENSMUST00000171363 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
TapbpQ9R233 Gabarapl1-204ENSMUST00000204956 539 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
TapbpQ9R233 AC153144.2-201ENSMUST00000221766 451 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
TapbpQ9R233 Gm36756-203ENSMUST00000223029 1166 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
TapbpQ9R233 Sh3bgrl3-201ENSMUST00000030651 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
TapbpQ9R233 Hdhd3-201ENSMUST00000037820 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
TapbpQ9R233 Abhd6-203ENSMUST00000225234 1958 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
TapbpQ9R233 Per2-201ENSMUST00000069620 5833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.1 ms