Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1P4

Psma1, Proteasome subunit alpha type-1, mousemouse

Predictions only

Length 263 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psma1Q9R1P4 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Psma1Q9R1P4 Saa3-202ENSMUST00000210913 2200 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Psma1Q9R1P4 Tmem215-201ENSMUST00000049655 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Psma1Q9R1P4 Ate1-204ENSMUST00000178534 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Psma1Q9R1P4 Cep89-201ENSMUST00000079414 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Psma1Q9R1P4 Ift140-201ENSMUST00000024983 5489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Psma1Q9R1P4 Epm2aip1-202ENSMUST00000135807 4245 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Psma1Q9R1P4 Qrich2-201ENSMUST00000093909 2156 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Psma1Q9R1P4 CT025678.1-201ENSMUST00000214795 2972 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Psma1Q9R1P4 Pla2g6-201ENSMUST00000047816 2963 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Psma1Q9R1P4 Grm7-202ENSMUST00000172951 4197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Psma1Q9R1P4 Cdc42se1-201ENSMUST00000053872 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Psma1Q9R1P4 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Psma1Q9R1P4 Cldn15-201ENSMUST00000001790 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Psma1Q9R1P4 Micalcl-201ENSMUST00000033033 2259 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Psma1Q9R1P4 Nol4-204ENSMUST00000097651 4549 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Psma1Q9R1P4 Slc27a2-201ENSMUST00000061491 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Psma1Q9R1P4 Arhgap12-211ENSMUST00000182383 2500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Psma1Q9R1P4 Nop58-201ENSMUST00000027174 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Psma1Q9R1P4 Ocln-203ENSMUST00000159459 1950 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Psma1Q9R1P4 Chodl-203ENSMUST00000114216 1550 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Psma1Q9R1P4 Grm1-201ENSMUST00000044306 6930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Psma1Q9R1P4 Sirt2-202ENSMUST00000122915 1828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Psma1Q9R1P4 Olfm2-201ENSMUST00000034692 1836 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Psma1Q9R1P4 Vps29-208ENSMUST00000155671 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Psma1Q9R1P4 Nek3-202ENSMUST00000110730 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Psma1Q9R1P4 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Psma1Q9R1P4 2810407A14Rik-201ENSMUST00000069809 1699 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Psma1Q9R1P4 Zfp41-201ENSMUST00000054555 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Psma1Q9R1P4 Bcl2l15-202ENSMUST00000106822 1902 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Psma1Q9R1P4 AC157950.1-201ENSMUST00000217561 2168 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Psma1Q9R1P4 Ptger4-202ENSMUST00000120563 3312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Psma1Q9R1P4 Tcf4-249ENSMUST00000202435 2427 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Psma1Q9R1P4 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Psma1Q9R1P4 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Psma1Q9R1P4 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Psma1Q9R1P4 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Psma1Q9R1P4 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Psma1Q9R1P4 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Psma1Q9R1P4 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Psma1Q9R1P4 Gm30906-201ENSMUST00000219578 535 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Psma1Q9R1P4 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Psma1Q9R1P4 Fam173b-201ENSMUST00000042702 1164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Psma1Q9R1P4 Nupl1-206ENSMUST00000225111 2936 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Psma1Q9R1P4 BC055324-201ENSMUST00000045876 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Psma1Q9R1P4 Prodh-205ENSMUST00000136776 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Psma1Q9R1P4 Brinp2-201ENSMUST00000004133 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Psma1Q9R1P4 Rtn4rl1-201ENSMUST00000102514 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Psma1Q9R1P4 Syvn1-204ENSMUST00000138532 3464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Psma1Q9R1P4 Pggt1b-201ENSMUST00000025354 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Psma1Q9R1P4 Wnt5a-201ENSMUST00000063465 7010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Psma1Q9R1P4 Jph2-202ENSMUST00000109425 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Psma1Q9R1P4 Wdr4-207ENSMUST00000171171 4153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Psma1Q9R1P4 Hk2-201ENSMUST00000000642 5513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Psma1Q9R1P4 Ccng2-202ENSMUST00000121127 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Psma1Q9R1P4 Gm37391-201ENSMUST00000194891 2318 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Psma1Q9R1P4 Polr3e-202ENSMUST00000106483 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Psma1Q9R1P4 Sv2a-201ENSMUST00000035371 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Psma1Q9R1P4 Smarcb1-201ENSMUST00000000925 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Psma1Q9R1P4 Faah-201ENSMUST00000049095 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Psma1Q9R1P4 Sqle-202ENSMUST00000100640 2636 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Psma1Q9R1P4 Ercc2-201ENSMUST00000062831 3578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Psma1Q9R1P4 Stab1-201ENSMUST00000036618 7999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Psma1Q9R1P4 Prex1-203ENSMUST00000109246 2386 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Psma1Q9R1P4 Esrp1-203ENSMUST00000108311 3864 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Psma1Q9R1P4 Gtf3c4-201ENSMUST00000037117 6941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Psma1Q9R1P4 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Psma1Q9R1P4 4933439K11Rik-203ENSMUST00000169111 1869 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Psma1Q9R1P4 Haus6-201ENSMUST00000070607 6158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Psma1Q9R1P4 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Psma1Q9R1P4 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Psma1Q9R1P4 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Psma1Q9R1P4 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Psma1Q9R1P4 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Psma1Q9R1P4 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Psma1Q9R1P4 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Psma1Q9R1P4 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Psma1Q9R1P4 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Psma1Q9R1P4 Cntnap4-201ENSMUST00000034225 4848 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Psma1Q9R1P4 Pdcd6-203ENSMUST00000222759 1376 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Psma1Q9R1P4 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Psma1Q9R1P4 Capn3-201ENSMUST00000028748 2606 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Psma1Q9R1P4 Trpm1-217ENSMUST00000206263 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Psma1Q9R1P4 Zmynd8-203ENSMUST00000099084 5232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Psma1Q9R1P4 Reep2-201ENSMUST00000043484 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Psma1Q9R1P4 Gm44292-201ENSMUST00000205194 2364 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Psma1Q9R1P4 Atxn7l1os2-201ENSMUST00000138617 2019 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Psma1Q9R1P4 Rbm10-202ENSMUST00000082089 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Psma1Q9R1P4 Arhgap20os-204ENSMUST00000152203 2113 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Psma1Q9R1P4 Nox3-201ENSMUST00000115800 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Psma1Q9R1P4 Gm5936-201ENSMUST00000114116 2857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Psma1Q9R1P4 Gm5640-201ENSMUST00000114119 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Psma1Q9R1P4 DXBay18-201ENSMUST00000080324 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Psma1Q9R1P4 Gm14685-201ENSMUST00000088459 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Psma1Q9R1P4 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Psma1Q9R1P4 Rph3a-201ENSMUST00000079204 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Psma1Q9R1P4 Nudt8-201ENSMUST00000155405 3904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Psma1Q9R1P4 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Psma1Q9R1P4 Decr2-201ENSMUST00000040907 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Psma1Q9R1P4 Ercc2-202ENSMUST00000108460 3485 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.3 ms