Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0A5

Nek3, Serine/threonine-protein kinase Nek3, mousemouse

Predictions only

Length 511 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nek3Q9R0A5 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Nek3Q9R0A5 Adamts20-204ENSMUST00000155907 6886 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Nek3Q9R0A5 AC101945.2-201ENSMUST00000227886 1377 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
Nek3Q9R0A5 Naga-201ENSMUST00000023088 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Nek3Q9R0A5 Marco-201ENSMUST00000027639 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Nek3Q9R0A5 Trip13-201ENSMUST00000022053 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Nek3Q9R0A5 Trpc7-208ENSMUST00000174457 2424 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Nek3Q9R0A5 1300002E11Rik-202ENSMUST00000181780 1650 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Nek3Q9R0A5 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Nek3Q9R0A5 Stk25-201ENSMUST00000027498 4249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Nek3Q9R0A5 Mrgprg-201ENSMUST00000058092 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Nek3Q9R0A5 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Nek3Q9R0A5 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Nek3Q9R0A5 Gm12291-201ENSMUST00000121627 311 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
Nek3Q9R0A5 Abhd14a-202ENSMUST00000171678 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Nek3Q9R0A5 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Nek3Q9R0A5 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
Nek3Q9R0A5 Alkbh7-202ENSMUST00000074141 736 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Nek3Q9R0A5 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Nek3Q9R0A5 Ppil3-201ENSMUST00000081677 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Nek3Q9R0A5 Gm815-201ENSMUST00000099536 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Nek3Q9R0A5 AC157950.1-201ENSMUST00000217561 2168 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
Nek3Q9R0A5 Tcea1-201ENSMUST00000081551 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Nek3Q9R0A5 Foxred2-202ENSMUST00000117725 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Nek3Q9R0A5 Gm43858-201ENSMUST00000199418 1778 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
Nek3Q9R0A5 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Nek3Q9R0A5 Reep3-201ENSMUST00000020023 5430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Nek3Q9R0A5 Rusc1-201ENSMUST00000052539 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Nek3Q9R0A5 Tmem17-201ENSMUST00000059319 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Nek3Q9R0A5 Spcs3-201ENSMUST00000067476 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Nek3Q9R0A5 Ddx10-201ENSMUST00000065630 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Nek3Q9R0A5 Thap2-202ENSMUST00000218842 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Nek3Q9R0A5 Ttc34-201ENSMUST00000050220 3200 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Nek3Q9R0A5 Oxr1-204ENSMUST00000110297 4596 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Nek3Q9R0A5 Rabif-201ENSMUST00000047978 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Nek3Q9R0A5 Wnt7b-201ENSMUST00000023015 3371 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Nek3Q9R0A5 Gm7104-201ENSMUST00000179741 2532 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Nek3Q9R0A5 Trim9-209ENSMUST00000222316 3049 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Nek3Q9R0A5 Gm16907-201ENSMUST00000180734 2317 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Nek3Q9R0A5 Pparg-204ENSMUST00000203732 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Nek3Q9R0A5 Tcf12-218ENSMUST00000184783 3489 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Nek3Q9R0A5 Slc38a10-204ENSMUST00000103018 4578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Nek3Q9R0A5 Adtrp-202ENSMUST00000121404 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Nek3Q9R0A5 Cflar-202ENSMUST00000097722 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Nek3Q9R0A5 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Nek3Q9R0A5 Kcna10-201ENSMUST00000055064 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Nek3Q9R0A5 Snx6-201ENSMUST00000005798 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Nek3Q9R0A5 Shroom1-202ENSMUST00000093114 2886 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Nek3Q9R0A5 Edrf1-201ENSMUST00000051169 5424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Nek3Q9R0A5 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Nek3Q9R0A5 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Nek3Q9R0A5 Ube2j2-206ENSMUST00000118192 922 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Nek3Q9R0A5 Gm15821-201ENSMUST00000121995 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Nek3Q9R0A5 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Nek3Q9R0A5 Gm11851-201ENSMUST00000132219 692 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Nek3Q9R0A5 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Nek3Q9R0A5 Gm9061-201ENSMUST00000182707 1006 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Nek3Q9R0A5 1700022A21Rik-201ENSMUST00000182745 1051 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Nek3Q9R0A5 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Nek3Q9R0A5 AC159263.1-201ENSMUST00000220746 482 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Nek3Q9R0A5 Olfr272-201ENSMUST00000051600 962 ntAPPRIS P1 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Nek3Q9R0A5 Zbtb42-203ENSMUST00000174780 3160 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Nek3Q9R0A5 Diaph3-202ENSMUST00000168889 4582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Nek3Q9R0A5 Diaph3-201ENSMUST00000022599 4582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Nek3Q9R0A5 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Nek3Q9R0A5 Fetub-201ENSMUST00000023587 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Nek3Q9R0A5 Duoxa2-201ENSMUST00000028656 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Nek3Q9R0A5 Kif2c-201ENSMUST00000065896 2842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Nek3Q9R0A5 Kcnn1-204ENSMUST00000212086 2964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Nek3Q9R0A5 Sec61g-203ENSMUST00000109643 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Nek3Q9R0A5 Igsf23-204ENSMUST00000208974 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Nek3Q9R0A5 Tcf4-205ENSMUST00000114980 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Nek3Q9R0A5 Gm43721-201ENSMUST00000199677 2313 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Nek3Q9R0A5 Sp7-201ENSMUST00000078508 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Nek3Q9R0A5 Incenp-201ENSMUST00000025562 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Nek3Q9R0A5 Rap1gap2-202ENSMUST00000102521 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Nek3Q9R0A5 Sorcs1-206ENSMUST00000209783 3489 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Nek3Q9R0A5 Sgo2a-201ENSMUST00000027202 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Nek3Q9R0A5 Otop1-201ENSMUST00000063136 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Nek3Q9R0A5 Wdcp-205ENSMUST00000220215 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Nek3Q9R0A5 Cit-203ENSMUST00000112008 6087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Nek3Q9R0A5 Adcyap1r1-208ENSMUST00000172084 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Nek3Q9R0A5 Nr4a3-201ENSMUST00000030025 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Nek3Q9R0A5 Cog7-203ENSMUST00000205438 3355 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Nek3Q9R0A5 Ccpg1-208ENSMUST00000150826 2939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Nek3Q9R0A5 Slc25a46-201ENSMUST00000060396 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Nek3Q9R0A5 Rrnad1-201ENSMUST00000005016 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Nek3Q9R0A5 Plekha2-204ENSMUST00000128715 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Nek3Q9R0A5 Cog6-201ENSMUST00000036665 3182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Nek3Q9R0A5 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Nek3Q9R0A5 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Nek3Q9R0A5 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Nek3Q9R0A5 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Nek3Q9R0A5 Gm44069-201ENSMUST00000204898 506 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Nek3Q9R0A5 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Nek3Q9R0A5 AC153506.3-201ENSMUST00000219287 1029 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Nek3Q9R0A5 Bphl-201ENSMUST00000040656 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Nek3Q9R0A5 Gm26035-201ENSMUST00000083065 308 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Nek3Q9R0A5 St6galnac4-204ENSMUST00000179989 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Nek3Q9R0A5 Rita1-207ENSMUST00000177800 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79.1 ms