Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZ47

Tnnt3, Troponin T, fast skeletal muscle, mousemouse

Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnnt3Q9QZ47 Egfem1-202ENSMUST00000119598 2687 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tnnt3Q9QZ47 Nudt8-201ENSMUST00000155405 3904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tnnt3Q9QZ47 Gjb5-201ENSMUST00000046498 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tnnt3Q9QZ47 Rapgef2-201ENSMUST00000118100 6573 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tnnt3Q9QZ47 Tspan2-201ENSMUST00000029451 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tnnt3Q9QZ47 Gnb4-205ENSMUST00000155737 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tnnt3Q9QZ47 AC160410.1-201ENSMUST00000219298 1972 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Tnnt3Q9QZ47 Gm37014-201ENSMUST00000194723 2253 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Tnnt3Q9QZ47 Lnx1-204ENSMUST00000117388 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tnnt3Q9QZ47 Slx4ip-201ENSMUST00000028737 2556 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tnnt3Q9QZ47 Atp13a1-201ENSMUST00000034326 3915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tnnt3Q9QZ47 Zfp341-201ENSMUST00000081926 3299 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tnnt3Q9QZ47 4931406C07Rik-208ENSMUST00000216955 1750 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tnnt3Q9QZ47 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Tnnt3Q9QZ47 Dhrs3-207ENSMUST00000171001 1349 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tnnt3Q9QZ47 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Tnnt3Q9QZ47 Xpot-203ENSMUST00000218004 6005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tnnt3Q9QZ47 Myh6-205ENSMUST00000226297 6008 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tnnt3Q9QZ47 Chrdl1-202ENSMUST00000074660 4096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tnnt3Q9QZ47 Slc23a4-201ENSMUST00000044387 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tnnt3Q9QZ47 Bbof1-201ENSMUST00000081828 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tnnt3Q9QZ47 Pdzrn4-202ENSMUST00000169942 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tnnt3Q9QZ47 Tor3a-201ENSMUST00000079625 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tnnt3Q9QZ47 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tnnt3Q9QZ47 Gm15851-201ENSMUST00000160564 662 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tnnt3Q9QZ47 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Tnnt3Q9QZ47 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Tnnt3Q9QZ47 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Tnnt3Q9QZ47 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tnnt3Q9QZ47 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tnnt3Q9QZ47 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Tnnt3Q9QZ47 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tnnt3Q9QZ47 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tnnt3Q9QZ47 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tnnt3Q9QZ47 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tnnt3Q9QZ47 Slc30a3-206ENSMUST00000202740 1989 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tnnt3Q9QZ47 Pdhx-201ENSMUST00000011058 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tnnt3Q9QZ47 Arhgap1-202ENSMUST00000111329 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tnnt3Q9QZ47 Smarcb1-201ENSMUST00000000925 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tnnt3Q9QZ47 Rnf223-201ENSMUST00000209248 2908 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tnnt3Q9QZ47 Oraov1-204ENSMUST00000128057 2231 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tnnt3Q9QZ47 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tnnt3Q9QZ47 Clspn-201ENSMUST00000048391 5027 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tnnt3Q9QZ47 Mirt1-202ENSMUST00000180667 1633 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tnnt3Q9QZ47 A730071L15Rik-201ENSMUST00000181545 1615 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tnnt3Q9QZ47 Lipe-201ENSMUST00000003207 3613 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tnnt3Q9QZ47 AC122371.1-201ENSMUST00000220876 1477 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tnnt3Q9QZ47 Itgal-202ENSMUST00000117762 5222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tnnt3Q9QZ47 Galc-201ENSMUST00000021390 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tnnt3Q9QZ47 Chit1-202ENSMUST00000159963 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tnnt3Q9QZ47 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tnnt3Q9QZ47 Dcaf11-203ENSMUST00000117701 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tnnt3Q9QZ47 Zfp541-202ENSMUST00000209369 4879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tnnt3Q9QZ47 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tnnt3Q9QZ47 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tnnt3Q9QZ47 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tnnt3Q9QZ47 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tnnt3Q9QZ47 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tnnt3Q9QZ47 AC169036.1-201ENSMUST00000227994 296 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Tnnt3Q9QZ47 Rbm4b-201ENSMUST00000036744 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tnnt3Q9QZ47 Nrg1-206ENSMUST00000208205 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tnnt3Q9QZ47 Mtus2-203ENSMUST00000085558 7543 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tnnt3Q9QZ47 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tnnt3Q9QZ47 Usp5-202ENSMUST00000122110 3076 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tnnt3Q9QZ47 Gcdh-201ENSMUST00000003907 2167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tnnt3Q9QZ47 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tnnt3Q9QZ47 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tnnt3Q9QZ47 Mecr-201ENSMUST00000030742 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tnnt3Q9QZ47 Samd5-201ENSMUST00000100070 6818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tnnt3Q9QZ47 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tnnt3Q9QZ47 Gm44831-201ENSMUST00000208469 2989 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Tnnt3Q9QZ47 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tnnt3Q9QZ47 Kpna7-203ENSMUST00000116454 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tnnt3Q9QZ47 Tjp3-205ENSMUST00000219479 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tnnt3Q9QZ47 Rara-201ENSMUST00000068133 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tnnt3Q9QZ47 Flnc-202ENSMUST00000101617 8939 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tnnt3Q9QZ47 Tomm5-204ENSMUST00000107810 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tnnt3Q9QZ47 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Tnnt3Q9QZ47 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tnnt3Q9QZ47 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tnnt3Q9QZ47 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tnnt3Q9QZ47 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tnnt3Q9QZ47 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tnnt3Q9QZ47 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tnnt3Q9QZ47 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tnnt3Q9QZ47 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Tnnt3Q9QZ47 Gm5425-201ENSMUST00000214125 459 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Tnnt3Q9QZ47 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Tnnt3Q9QZ47 Pi16-202ENSMUST00000114701 2756 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tnnt3Q9QZ47 4931406C07Rik-203ENSMUST00000180339 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tnnt3Q9QZ47 Ppp3r1-201ENSMUST00000102880 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tnnt3Q9QZ47 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Tnnt3Q9QZ47 Pkib-203ENSMUST00000095668 3311 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tnnt3Q9QZ47 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tnnt3Q9QZ47 Cacna1g-205ENSMUST00000107786 7984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tnnt3Q9QZ47 Dnajc14-207ENSMUST00000219508 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tnnt3Q9QZ47 Tekt2-201ENSMUST00000030658 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tnnt3Q9QZ47 Slc6a16-201ENSMUST00000179310 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tnnt3Q9QZ47 Gm8994-202ENSMUST00000204530 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tnnt3Q9QZ47 Gm9195-201ENSMUST00000208955 8870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.9 ms