Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY53

Nphp1, Nephrocystin-1, mousemouse

Predictions only

Length 687 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nphp1Q9QY53 Olfr763-201ENSMUST00000077460 2523 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nphp1Q9QY53 Gm26519-201ENSMUST00000181193 2249 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nphp1Q9QY53 Elp4-202ENSMUST00000122965 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nphp1Q9QY53 Rpl39-201ENSMUST00000115231 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nphp1Q9QY53 Tldc2-202ENSMUST00000166140 639 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nphp1Q9QY53 Gm20457-201ENSMUST00000173374 682 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nphp1Q9QY53 Naa60-209ENSMUST00000175809 279 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nphp1Q9QY53 Gm27682-201ENSMUST00000183930 110 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Nphp1Q9QY53 Zfp709-202ENSMUST00000188374 717 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nphp1Q9QY53 Gm31651-201ENSMUST00000198864 560 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nphp1Q9QY53 Gm9299-201ENSMUST00000206392 1140 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Nphp1Q9QY53 Reep1-202ENSMUST00000212631 953 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nphp1Q9QY53 AC110091.3-202ENSMUST00000217104 791 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nphp1Q9QY53 Pfdn1-201ENSMUST00000025204 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nphp1Q9QY53 Gdap1l1-202ENSMUST00000109420 2475 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nphp1Q9QY53 Plekha5-212ENSMUST00000204876 1928 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nphp1Q9QY53 Sostdc1-201ENSMUST00000041407 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nphp1Q9QY53 Dlgap3-203ENSMUST00000106094 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nphp1Q9QY53 Tcf4-230ENSMUST00000201205 2270 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nphp1Q9QY53 Evi5l-202ENSMUST00000176072 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nphp1Q9QY53 Malt1-202ENSMUST00000224056 4028 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nphp1Q9QY53 Ccdc25-201ENSMUST00000022614 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nphp1Q9QY53 Ckm-203ENSMUST00000208710 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nphp1Q9QY53 Mul1-202ENSMUST00000105813 3944 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nphp1Q9QY53 Slc34a1-201ENSMUST00000057167 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nphp1Q9QY53 Gm2885-201ENSMUST00000181895 1442 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nphp1Q9QY53 Eya1-203ENSMUST00000168081 4366 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nphp1Q9QY53 Wwox-203ENSMUST00000109108 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nphp1Q9QY53 Gm13829-201ENSMUST00000119600 138 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Nphp1Q9QY53 Gm14704-201ENSMUST00000120300 874 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Nphp1Q9QY53 Gm12291-201ENSMUST00000121627 311 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Nphp1Q9QY53 D930015M05Rik-201ENSMUST00000126002 1190 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nphp1Q9QY53 Gm17208-201ENSMUST00000168388 535 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Nphp1Q9QY53 Dtnb-223ENSMUST00000174547 2112 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nphp1Q9QY53 Gm43818-201ENSMUST00000200605 466 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Nphp1Q9QY53 Tgif2-ps1-201ENSMUST00000203590 713 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Nphp1Q9QY53 Tm2d3-207ENSMUST00000206517 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nphp1Q9QY53 Bcdin3d-201ENSMUST00000040313 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nphp1Q9QY53 Dnajb5-203ENSMUST00000098112 3093 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nphp1Q9QY53 Gm10544-201ENSMUST00000180516 2239 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nphp1Q9QY53 Tars2-202ENSMUST00000074339 2313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nphp1Q9QY53 Plekha7-203ENSMUST00000181998 5149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Nphp1Q9QY53 Pgghg-201ENSMUST00000079403 2981 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Nphp1Q9QY53 Dysf-214ENSMUST00000204354 6432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nphp1Q9QY53 Epb41-203ENSMUST00000084253 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nphp1Q9QY53 Mob1a-202ENSMUST00000055261 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nphp1Q9QY53 Ubap2l-202ENSMUST00000064639 4073 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nphp1Q9QY53 Skp1a-201ENSMUST00000037324 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nphp1Q9QY53 Gm853-201ENSMUST00000023884 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nphp1Q9QY53 Nynrin-202ENSMUST00000168479 7511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nphp1Q9QY53 Ildr1-202ENSMUST00000089618 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nphp1Q9QY53 Clcn6-201ENSMUST00000030879 3306 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nphp1Q9QY53 Dnajc14-207ENSMUST00000219508 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nphp1Q9QY53 Gm11751-201ENSMUST00000126187 460 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nphp1Q9QY53 Gm15046-201ENSMUST00000130153 408 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nphp1Q9QY53 Pisd-ps2-202ENSMUST00000142526 1175 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Nphp1Q9QY53 Pfdn6-205ENSMUST00000174426 396 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nphp1Q9QY53 Gm26927-201ENSMUST00000182385 965 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Nphp1Q9QY53 1700094J05Rik-202ENSMUST00000190491 997 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nphp1Q9QY53 Mymx-204ENSMUST00000208801 437 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nphp1Q9QY53 Gm40466-201ENSMUST00000212174 422 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Nphp1Q9QY53 Cradd-202ENSMUST00000217809 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nphp1Q9QY53 AC153506.3-201ENSMUST00000219287 1029 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nphp1Q9QY53 n-R5s77-201ENSMUST00000083757 119 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Nphp1Q9QY53 Rgs9bp-201ENSMUST00000069912 6590 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nphp1Q9QY53 Vps35-201ENSMUST00000034131 3474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nphp1Q9QY53 Asap1-218ENSMUST00000177374 4582 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nphp1Q9QY53 Naga-201ENSMUST00000023088 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nphp1Q9QY53 Dcaf4-208ENSMUST00000223291 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nphp1Q9QY53 Ahcyl2-201ENSMUST00000064872 2019 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nphp1Q9QY53 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nphp1Q9QY53 Nmral1-202ENSMUST00000079130 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nphp1Q9QY53 Cdk10-212ENSMUST00000213005 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nphp1Q9QY53 Klhl38-201ENSMUST00000022985 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nphp1Q9QY53 Myh7-201ENSMUST00000102803 6135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nphp1Q9QY53 Ebna1bp2-201ENSMUST00000030501 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nphp1Q9QY53 Gm2115-201ENSMUST00000180387 7055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nphp1Q9QY53 Nbeal2-206ENSMUST00000133191 8782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nphp1Q9QY53 Hnrnpk-232ENSMUST00000225674 2704 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Nphp1Q9QY53 Usp19-204ENSMUST00000178075 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nphp1Q9QY53 Usp19-202ENSMUST00000085044 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nphp1Q9QY53 Mdm2-202ENSMUST00000105263 3145 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nphp1Q9QY53 Ranbp17-202ENSMUST00000102815 5001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nphp1Q9QY53 Aacs-201ENSMUST00000031445 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nphp1Q9QY53 Gm36500-201ENSMUST00000221821 1626 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nphp1Q9QY53 Akna-201ENSMUST00000035724 5387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nphp1Q9QY53 Mpp3-204ENSMUST00000107168 3094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nphp1Q9QY53 Cdc25c-201ENSMUST00000060710 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nphp1Q9QY53 Max-201ENSMUST00000082136 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nphp1Q9QY53 Cyp1b1-201ENSMUST00000024894 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nphp1Q9QY53 Hdgfl2-210ENSMUST00000225843 2238 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nphp1Q9QY53 Ins2-204ENSMUST00000105932 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nphp1Q9QY53 Timm10b-202ENSMUST00000106780 671 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nphp1Q9QY53 Timm10-202ENSMUST00000111631 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nphp1Q9QY53 Lsm2-202ENSMUST00000114011 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nphp1Q9QY53 Litaf-202ENSMUST00000117360 763 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nphp1Q9QY53 Gm15824-201ENSMUST00000119516 955 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Nphp1Q9QY53 Gm1335-201ENSMUST00000121653 386 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Nphp1Q9QY53 Gm12363-201ENSMUST00000122250 668 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Nphp1Q9QY53 Sbk3-201ENSMUST00000133272 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55 ms