Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXZ7

Nr2e3, Photoreceptor-specific nuclear receptor, mousemouse

Predictions only

Length 395 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nr2e3Q9QXZ7 AC140451.2-201ENSMUST00000228030 664 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Nr2e3Q9QXZ7 Fgf2-201ENSMUST00000038885 462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nr2e3Q9QXZ7 Krtcap2-201ENSMUST00000040888 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nr2e3Q9QXZ7 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nr2e3Q9QXZ7 Ap2a1-201ENSMUST00000085399 3442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nr2e3Q9QXZ7 Rnps1-201ENSMUST00000088512 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nr2e3Q9QXZ7 Nudt18-201ENSMUST00000089049 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nr2e3Q9QXZ7 Gm44094-201ENSMUST00000204703 2030 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Nr2e3Q9QXZ7 Pik3cd-205ENSMUST00000118704 4894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nr2e3Q9QXZ7 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nr2e3Q9QXZ7 Slc38a10-204ENSMUST00000103018 4578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nr2e3Q9QXZ7 Dct-201ENSMUST00000022725 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nr2e3Q9QXZ7 Smpd4-206ENSMUST00000163997 1722 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nr2e3Q9QXZ7 Prkg1-202ENSMUST00000073581 2841 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nr2e3Q9QXZ7 Kif5c-201ENSMUST00000028102 6856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nr2e3Q9QXZ7 Mul1-202ENSMUST00000105813 3944 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nr2e3Q9QXZ7 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nr2e3Q9QXZ7 Ppp4r3b-201ENSMUST00000020755 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nr2e3Q9QXZ7 Gucd1-201ENSMUST00000039796 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nr2e3Q9QXZ7 Slc6a8-201ENSMUST00000033752 3964 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Nr2e3Q9QXZ7 Bud13-201ENSMUST00000074957 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Nr2e3Q9QXZ7 Tle6-201ENSMUST00000072020 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Nr2e3Q9QXZ7 Slc5a11-201ENSMUST00000033035 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Nr2e3Q9QXZ7 Lrrc30-201ENSMUST00000097290 1759 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Nr2e3Q9QXZ7 Aldh9a1-201ENSMUST00000028004 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Nr2e3Q9QXZ7 Olfr71-202ENSMUST00000107862 2587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Nr2e3Q9QXZ7 4931414P19Rik-201ENSMUST00000022786 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Nr2e3Q9QXZ7 Vmn1r65-201ENSMUST00000086338 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Nr2e3Q9QXZ7 Snord83b-201ENSMUST00000104546 94 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Nr2e3Q9QXZ7 Psme2b-201ENSMUST00000104958 837 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Nr2e3Q9QXZ7 Arl5c-202ENSMUST00000107563 823 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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Nr2e3Q9QXZ7 Gm22121-201ENSMUST00000175148 54 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Nr2e3Q9QXZ7 Mir7085-201ENSMUST00000184353 66 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Nr2e3Q9QXZ7 Gm4768-201ENSMUST00000206199 686 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Nr2e3Q9QXZ7 AC126253.1-201ENSMUST00000227974 824 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Nr2e3Q9QXZ7 Adcyap1r1-202ENSMUST00000070756 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Nr2e3Q9QXZ7 Sall4-201ENSMUST00000029061 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Nr2e3Q9QXZ7 Slc25a25-204ENSMUST00000113308 2643 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Nr2e3Q9QXZ7 Nmral1-202ENSMUST00000079130 1459 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Nr2e3Q9QXZ7 Prnd-203ENSMUST00000110171 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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Nr2e3Q9QXZ7 Ces2e-202ENSMUST00000109410 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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Nr2e3Q9QXZ7 Tnpo2-202ENSMUST00000166592 4884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Nr2e3Q9QXZ7 Tcf4-230ENSMUST00000201205 2270 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Nr2e3Q9QXZ7 Hmox2-201ENSMUST00000004172 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Nr2e3Q9QXZ7 4930579D09Rik-201ENSMUST00000132321 469 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Nr2e3Q9QXZ7 Gm8565-201ENSMUST00000183259 1014 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Nr2e3Q9QXZ7 Ssr2-202ENSMUST00000192495 620 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
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Nr2e3Q9QXZ7 Brk1-201ENSMUST00000035725 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Nr2e3Q9QXZ7 Tmem86b-201ENSMUST00000055085 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Nr2e3Q9QXZ7 Cebpe-201ENSMUST00000064290 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Nr2e3Q9QXZ7 Vmn1r213-201ENSMUST00000076897 1155 ntAPPRIS P2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Nr2e3Q9QXZ7 Dmrtc1c2-201ENSMUST00000087896 1255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Nr2e3Q9QXZ7 Gm26519-201ENSMUST00000181193 2249 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Nr2e3Q9QXZ7 D6Ertd527e-203ENSMUST00000203747 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Nr2e3Q9QXZ7 Mier3-203ENSMUST00000109272 5279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Nr2e3Q9QXZ7 AI593442-203ENSMUST00000213937 5674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Nr2e3Q9QXZ7 5930412G12Rik-203ENSMUST00000134673 2087 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Nr2e3Q9QXZ7 Atp6ap1-202ENSMUST00000114171 2157 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Nr2e3Q9QXZ7 Ncam2-201ENSMUST00000037785 4893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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Nr2e3Q9QXZ7 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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Nr2e3Q9QXZ7 Cabp5-202ENSMUST00000117400 1258 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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Nr2e3Q9QXZ7 Alms1-ps2-201ENSMUST00000160606 1170 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Nr2e3Q9QXZ7 2010320O07Rik-201ENSMUST00000160935 525 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Nr2e3Q9QXZ7 Fam168a-206ENSMUST00000208013 1129 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Nr2e3Q9QXZ7 Gm32025-201ENSMUST00000217960 307 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Nr2e3Q9QXZ7 Cox7a2-201ENSMUST00000034881 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Nr2e3Q9QXZ7 Bcdin3d-201ENSMUST00000040313 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Nr2e3Q9QXZ7 Dcst1-201ENSMUST00000070820 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Nr2e3Q9QXZ7 Ssh1-204ENSMUST00000159592 8436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Nr2e3Q9QXZ7 Cdc25c-201ENSMUST00000060710 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Nr2e3Q9QXZ7 Sgce-201ENSMUST00000004750 1703 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Nr2e3Q9QXZ7 Hnrnpdl-202ENSMUST00000128187 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Nr2e3Q9QXZ7 Hpcal4-202ENSMUST00000106246 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Nr2e3Q9QXZ7 Tnfrsf21-201ENSMUST00000024708 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Nr2e3Q9QXZ7 Tifa-203ENSMUST00000164447 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Nr2e3Q9QXZ7 Ldhal6b-201ENSMUST00000189788 1445 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Nr2e3Q9QXZ7 Clcn6-201ENSMUST00000030879 3306 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Nr2e3Q9QXZ7 Ddx31-201ENSMUST00000113853 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nr2e3Q9QXZ7 Foxred2-202ENSMUST00000117725 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nr2e3Q9QXZ7 Gpr132-201ENSMUST00000021729 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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Nr2e3Q9QXZ7 Zfp444-204ENSMUST00000108567 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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