Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXT8

Kcnip3, Calsenilin, mousemouse

Predictions only

Length 256 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnip3Q9QXT8 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Kcnip3Q9QXT8 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Kcnip3Q9QXT8 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Kcnip3Q9QXT8 Trappc2l-201ENSMUST00000015157 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Kcnip3Q9QXT8 Plk-ps1-201ENSMUST00000119494 1787 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Kcnip3Q9QXT8 Erich5-201ENSMUST00000060894 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Kcnip3Q9QXT8 Kalrn-210ENSMUST00000114964 2693 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Kcnip3Q9QXT8 Dnaic2-202ENSMUST00000092469 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Kcnip3Q9QXT8 Clpx-201ENSMUST00000015501 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Kcnip3Q9QXT8 Ctnnd1-204ENSMUST00000099941 5783 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Kcnip3Q9QXT8 Zfp710-202ENSMUST00000164056 5871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Kcnip3Q9QXT8 Cad-211ENSMUST00000202795 6559 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Kcnip3Q9QXT8 Myocd-203ENSMUST00000108695 5114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Kcnip3Q9QXT8 Runx1-202ENSMUST00000113956 4738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Kcnip3Q9QXT8 Pcdhga6-201ENSMUST00000195823 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Kcnip3Q9QXT8 Smg8-201ENSMUST00000020801 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Kcnip3Q9QXT8 Apopt1-203ENSMUST00000162316 3107 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Kcnip3Q9QXT8 Fn3krp-201ENSMUST00000038096 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Kcnip3Q9QXT8 AC124577.2-201ENSMUST00000217413 2420 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Kcnip3Q9QXT8 Uqcc1-203ENSMUST00000109632 2313 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Kcnip3Q9QXT8 Gm18262-201ENSMUST00000222560 1946 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Kcnip3Q9QXT8 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Kcnip3Q9QXT8 Shtn1-201ENSMUST00000047511 4081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Kcnip3Q9QXT8 Ehbp1l1-202ENSMUST00000075606 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Kcnip3Q9QXT8 Mfap3l-203ENSMUST00000161421 4142 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Kcnip3Q9QXT8 Ighg1-202ENSMUST00000194304 2482 ntAPPRIS P5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Kcnip3Q9QXT8 Ank1-204ENSMUST00000117270 5652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Kcnip3Q9QXT8 Gm21986-201ENSMUST00000113671 5560 ntTSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Kcnip3Q9QXT8 Acad12-202ENSMUST00000111776 2269 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Kcnip3Q9QXT8 Adora1-201ENSMUST00000038191 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Kcnip3Q9QXT8 Gm45253-201ENSMUST00000210694 2076 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Kcnip3Q9QXT8 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Kcnip3Q9QXT8 Nxph1-202ENSMUST00000160300 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Kcnip3Q9QXT8 Atic-201ENSMUST00000027384 2845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Kcnip3Q9QXT8 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Kcnip3Q9QXT8 Sptan1-204ENSMUST00000113717 7958 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Kcnip3Q9QXT8 Gm5475-202ENSMUST00000148928 2320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Kcnip3Q9QXT8 Aip-202ENSMUST00000117831 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Kcnip3Q9QXT8 2610507I01Rik-201ENSMUST00000154354 1360 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Kcnip3Q9QXT8 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Kcnip3Q9QXT8 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Kcnip3Q9QXT8 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Kcnip3Q9QXT8 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Kcnip3Q9QXT8 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
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Kcnip3Q9QXT8 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
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Kcnip3Q9QXT8 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Kcnip3Q9QXT8 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Kcnip3Q9QXT8 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Kcnip3Q9QXT8 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Kcnip3Q9QXT8 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Kcnip3Q9QXT8 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Kcnip3Q9QXT8 Dcaf8-202ENSMUST00000191689 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Kcnip3Q9QXT8 Hkdc1-201ENSMUST00000020277 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Kcnip3Q9QXT8 Trak1-213ENSMUST00000211439 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Kcnip3Q9QXT8 Umod-206ENSMUST00000209095 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Kcnip3Q9QXT8 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Kcnip3Q9QXT8 Vsx2-202ENSMUST00000169934 3249 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Kcnip3Q9QXT8 Gm10392-201ENSMUST00000100807 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Kcnip3Q9QXT8 Gcom1-201ENSMUST00000163998 1726 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Kcnip3Q9QXT8 Mtmr4-201ENSMUST00000092802 5525 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Kcnip3Q9QXT8 Kif2c-201ENSMUST00000065896 2842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Kcnip3Q9QXT8 Tmem115-201ENSMUST00000010189 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Kcnip3Q9QXT8 Tcf4-250ENSMUST00000202458 2610 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Kcnip3Q9QXT8 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Kcnip3Q9QXT8 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Kcnip3Q9QXT8 Emc1-201ENSMUST00000042096 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Kcnip3Q9QXT8 Gm42863-201ENSMUST00000197875 2958 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Kcnip3Q9QXT8 Anxa8-201ENSMUST00000022519 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Kcnip3Q9QXT8 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Kcnip3Q9QXT8 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Kcnip3Q9QXT8 Fnbp1-210ENSMUST00000113564 3892 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Kcnip3Q9QXT8 Calr3-201ENSMUST00000019876 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Kcnip3Q9QXT8 Alkbh4-201ENSMUST00000041100 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Kcnip3Q9QXT8 4933406P04Rik-201ENSMUST00000092680 1789 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Kcnip3Q9QXT8 Mical3-217ENSMUST00000207889 9204 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Kcnip3Q9QXT8 4632427E13Rik-202ENSMUST00000147198 6559 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Kcnip3Q9QXT8 Asph-207ENSMUST00000108333 2652 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Kcnip3Q9QXT8 Polm-202ENSMUST00000109837 2697 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Kcnip3Q9QXT8 Rita1-207ENSMUST00000177800 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Kcnip3Q9QXT8 Ccng2-202ENSMUST00000121127 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Kcnip3Q9QXT8 Cmya5-201ENSMUST00000062122 11850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Kcnip3Q9QXT8 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Kcnip3Q9QXT8 AU022754-201ENSMUST00000180441 2976 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Kcnip3Q9QXT8 Olfr1234-202ENSMUST00000111543 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Kcnip3Q9QXT8 Gtf2ird1-202ENSMUST00000074114 3330 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Kcnip3Q9QXT8 Tex19.1-201ENSMUST00000039088 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Kcnip3Q9QXT8 Otop1-201ENSMUST00000063136 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Kcnip3Q9QXT8 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Kcnip3Q9QXT8 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Kcnip3Q9QXT8 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Kcnip3Q9QXT8 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Kcnip3Q9QXT8 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Kcnip3Q9QXT8 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Kcnip3Q9QXT8 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Kcnip3Q9QXT8 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Kcnip3Q9QXT8 Plekhn1-203ENSMUST00000217885 1982 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Kcnip3Q9QXT8 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
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