Protein–RNA interactions for Protein: Q9JMD1

Sfmbt1, Scm-like with four MBT domains protein 1, mousemouse

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Length 863 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sfmbt1Q9JMD1 Tmem41b-201ENSMUST00000094097 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Sfmbt1Q9JMD1 Ermard-203ENSMUST00000097393 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Sfmbt1Q9JMD1 Smc5-202ENSMUST00000223934 3448 ntAPPRIS P2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Sfmbt1Q9JMD1 Megf6-201ENSMUST00000030897 6851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Sfmbt1Q9JMD1 Gjb5-201ENSMUST00000046498 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Sfmbt1Q9JMD1 Irx6-201ENSMUST00000034185 3370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Sfmbt1Q9JMD1 Ptgir-201ENSMUST00000086101 2725 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Sfmbt1Q9JMD1 Dph3-202ENSMUST00000067955 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Sfmbt1Q9JMD1 Cadm2-202ENSMUST00000120594 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Sfmbt1Q9JMD1 Gm43579-201ENSMUST00000202387 1307 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Sfmbt1Q9JMD1 Acoxl-202ENSMUST00000110344 1573 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Sfmbt1Q9JMD1 Pigq-209ENSMUST00000140304 1835 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Sfmbt1Q9JMD1 Set-202ENSMUST00000102866 2824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Sfmbt1Q9JMD1 Slc6a21-206ENSMUST00000210861 2838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Sfmbt1Q9JMD1 Ccdc125-201ENSMUST00000057325 2413 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Sfmbt1Q9JMD1 Stx17-201ENSMUST00000064765 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Sfmbt1Q9JMD1 Sp2-201ENSMUST00000062652 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Sfmbt1Q9JMD1 Pkig-203ENSMUST00000109400 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Sfmbt1Q9JMD1 Gm5940-201ENSMUST00000117582 1068 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Sfmbt1Q9JMD1 Cdkn1a-202ENSMUST00000119901 748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Sfmbt1Q9JMD1 Gm13562-201ENSMUST00000125198 797 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Sfmbt1Q9JMD1 Gm12843-201ENSMUST00000137607 601 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Sfmbt1Q9JMD1 A330102I10Rik-202ENSMUST00000140415 682 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Sfmbt1Q9JMD1 Gm12167-201ENSMUST00000148132 578 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Sfmbt1Q9JMD1 Nudt17-202ENSMUST00000171249 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Sfmbt1Q9JMD1 Mir7221-201ENSMUST00000184009 72 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Sfmbt1Q9JMD1 AC159896.2-201ENSMUST00000214753 269 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Sfmbt1Q9JMD1 AC154319.1-201ENSMUST00000216330 312 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Sfmbt1Q9JMD1 AL589735.1-201ENSMUST00000224353 270 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Sfmbt1Q9JMD1 Gm7399-201ENSMUST00000032395 858 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Sfmbt1Q9JMD1 Scgb3a2-201ENSMUST00000043803 842 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Sfmbt1Q9JMD1 Wnk1-203ENSMUST00000088644 11330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Sfmbt1Q9JMD1 Actr8-204ENSMUST00000224797 2328 ntAPPRIS P1 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Sfmbt1Q9JMD1 B230206H07Rik-202ENSMUST00000134845 3269 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Sfmbt1Q9JMD1 Gpnmb-203ENSMUST00000204260 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Sfmbt1Q9JMD1 Nav1-207ENSMUST00000190298 8557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Sfmbt1Q9JMD1 Taf1c-201ENSMUST00000093099 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Sfmbt1Q9JMD1 Ercc5-201ENSMUST00000027214 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Sfmbt1Q9JMD1 Ltbp4-204ENSMUST00000118961 3444 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Sfmbt1Q9JMD1 Glrx3-203ENSMUST00000211496 3440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Sfmbt1Q9JMD1 Col26a1-201ENSMUST00000057497 2724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Sfmbt1Q9JMD1 Hadhb-202ENSMUST00000114783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Sfmbt1Q9JMD1 Armcx1-206ENSMUST00000113201 2228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Sfmbt1Q9JMD1 Atp9a-204ENSMUST00000109177 3456 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Sfmbt1Q9JMD1 Scrn3-202ENSMUST00000112050 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Sfmbt1Q9JMD1 Ppp1r13l-201ENSMUST00000047621 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Sfmbt1Q9JMD1 Trim26-210ENSMUST00000179968 3203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Sfmbt1Q9JMD1 Tsku-204ENSMUST00000165901 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Sfmbt1Q9JMD1 Rp2-201ENSMUST00000033372 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Sfmbt1Q9JMD1 4930513N10Rik-204ENSMUST00000212647 3957 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Sfmbt1Q9JMD1 9230102O04Rik-201ENSMUST00000114915 528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Sfmbt1Q9JMD1 Rpl3-ps2-201ENSMUST00000117131 1214 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Sfmbt1Q9JMD1 Gm11637-201ENSMUST00000120601 592 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Sfmbt1Q9JMD1 Mmgt2-207ENSMUST00000155759 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Sfmbt1Q9JMD1 Gm17208-201ENSMUST00000168388 535 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Sfmbt1Q9JMD1 1700015O11Rik-201ENSMUST00000180964 678 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Sfmbt1Q9JMD1 Ggt5-203ENSMUST00000189972 648 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Sfmbt1Q9JMD1 Gm5850-201ENSMUST00000192923 1206 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Sfmbt1Q9JMD1 AC144543.1-201ENSMUST00000221840 1064 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Sfmbt1Q9JMD1 AC022775.2-201ENSMUST00000227885 646 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Sfmbt1Q9JMD1 Mrto4-201ENSMUST00000030513 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Sfmbt1Q9JMD1 Nsmce1-201ENSMUST00000033006 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Sfmbt1Q9JMD1 Dhx30-201ENSMUST00000062368 3806 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Sfmbt1Q9JMD1 Krtap19-2-201ENSMUST00000076186 605 ntAPPRIS P1 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Sfmbt1Q9JMD1 n-R5s77-201ENSMUST00000083757 119 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Sfmbt1Q9JMD1 Mdk-203ENSMUST00000090602 714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Sfmbt1Q9JMD1 Fgd6-201ENSMUST00000020208 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Sfmbt1Q9JMD1 Eif4e2-206ENSMUST00000113233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Sfmbt1Q9JMD1 Pole3-201ENSMUST00000030091 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Sfmbt1Q9JMD1 Nr2f2-201ENSMUST00000032768 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Sfmbt1Q9JMD1 Hsd3b3-201ENSMUST00000090743 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Sfmbt1Q9JMD1 Gcdh-202ENSMUST00000109745 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Sfmbt1Q9JMD1 Fbxo44-208ENSMUST00000167160 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Sfmbt1Q9JMD1 Ndc80-201ENSMUST00000024851 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Sfmbt1Q9JMD1 Sema7a-201ENSMUST00000043059 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Sfmbt1Q9JMD1 Arid1b-202ENSMUST00000115797 11325 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Sfmbt1Q9JMD1 Ccdc94-201ENSMUST00000086869 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Sfmbt1Q9JMD1 Acta1-201ENSMUST00000034453 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Sfmbt1Q9JMD1 Akp-ps1-201ENSMUST00000188050 1600 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Sfmbt1Q9JMD1 Galnt4-201ENSMUST00000161240 5089 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Sfmbt1Q9JMD1 Sirt2-202ENSMUST00000122915 1828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Sfmbt1Q9JMD1 Nfkb2-201ENSMUST00000073116 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Sfmbt1Q9JMD1 Dnajb5-203ENSMUST00000098112 3093 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Sfmbt1Q9JMD1 Ormdl1-201ENSMUST00000027266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Sfmbt1Q9JMD1 Slc29a1-203ENSMUST00000097317 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Sfmbt1Q9JMD1 Smarcd2-203ENSMUST00000106843 2548 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Sfmbt1Q9JMD1 Mbp-205ENSMUST00000091789 4797 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Sfmbt1Q9JMD1 Mtdh-201ENSMUST00000022865 6919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Sfmbt1Q9JMD1 Ebf1-202ENSMUST00000101326 3422 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Sfmbt1Q9JMD1 Aurkaip1-202ENSMUST00000105591 773 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Sfmbt1Q9JMD1 Gm11591-201ENSMUST00000120063 702 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Sfmbt1Q9JMD1 4933427G23Rik-202ENSMUST00000126393 544 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Sfmbt1Q9JMD1 Gm4935-201ENSMUST00000221316 1198 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Sfmbt1Q9JMD1 Rrp36-201ENSMUST00000024766 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Sfmbt1Q9JMD1 Tatdn3-201ENSMUST00000027945 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Sfmbt1Q9JMD1 Brk1-201ENSMUST00000035725 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Sfmbt1Q9JMD1 Tmem86b-201ENSMUST00000055085 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Sfmbt1Q9JMD1 Lcn10-201ENSMUST00000058912 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Sfmbt1Q9JMD1 Olfr569-201ENSMUST00000078191 945 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Sfmbt1Q9JMD1 Olfr582-201ENSMUST00000098212 960 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
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