Protein–RNA interactions for Protein: Q9JL35

Hmgn5, High mobility group nucleosome-binding domain-containing protein 5, mousemouse

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Length 406 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hmgn5Q9JL35 Gm36500-201ENSMUST00000221821 1626 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hmgn5Q9JL35 Gsdma3-201ENSMUST00000073295 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hmgn5Q9JL35 Pced1b-201ENSMUST00000059433 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hmgn5Q9JL35 Shisa9-202ENSMUST00000170672 3421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hmgn5Q9JL35 Hook2-204ENSMUST00000210326 3080 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hmgn5Q9JL35 Gm9195-201ENSMUST00000208955 8870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hmgn5Q9JL35 Mylk-201ENSMUST00000023538 7824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hmgn5Q9JL35 2810407A14Rik-201ENSMUST00000069809 1699 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hmgn5Q9JL35 Gm36970-201ENSMUST00000193688 1859 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Hmgn5Q9JL35 Nrf1-209ENSMUST00000115209 2406 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hmgn5Q9JL35 Luc7l2-207ENSMUST00000161227 2405 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hmgn5Q9JL35 Tmem25-201ENSMUST00000002100 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hmgn5Q9JL35 Zfp783-204ENSMUST00000130490 4419 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hmgn5Q9JL35 Tbc1d1-204ENSMUST00000121370 5419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hmgn5Q9JL35 Terb2-201ENSMUST00000028661 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hmgn5Q9JL35 Igfn1-203ENSMUST00000166193 8989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hmgn5Q9JL35 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hmgn5Q9JL35 Arid3b-209ENSMUST00000171444 4171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hmgn5Q9JL35 Wwox-203ENSMUST00000109108 1771 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hmgn5Q9JL35 Gm26588-202ENSMUST00000181355 2538 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hmgn5Q9JL35 Pdp1-203ENSMUST00000108297 4201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hmgn5Q9JL35 Specc1-213ENSMUST00000202179 6676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hmgn5Q9JL35 Hgs-202ENSMUST00000106203 2901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hmgn5Q9JL35 Bbof1-201ENSMUST00000081828 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hmgn5Q9JL35 Dpysl5-201ENSMUST00000088081 5022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hmgn5Q9JL35 AC122840.1-201ENSMUST00000220915 3334 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Hmgn5Q9JL35 Ackr4-202ENSMUST00000076147 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hmgn5Q9JL35 Acvrl1-205ENSMUST00000120754 3506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hmgn5Q9JL35 Rbp3-201ENSMUST00000035695 5295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hmgn5Q9JL35 Mgll-207ENSMUST00000163271 3991 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hmgn5Q9JL35 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hmgn5Q9JL35 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Hmgn5Q9JL35 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Hmgn5Q9JL35 Selenoh-205ENSMUST00000189636 499 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hmgn5Q9JL35 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hmgn5Q9JL35 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hmgn5Q9JL35 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hmgn5Q9JL35 Gm24447-201ENSMUST00000083977 338 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Hmgn5Q9JL35 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hmgn5Q9JL35 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hmgn5Q9JL35 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hmgn5Q9JL35 Fbxl12-201ENSMUST00000086458 2056 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hmgn5Q9JL35 Fbxl12-202ENSMUST00000086459 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hmgn5Q9JL35 Gm44942-201ENSMUST00000096093 2072 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Hmgn5Q9JL35 Tbc1d8-204ENSMUST00000193823 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hmgn5Q9JL35 Gm16907-201ENSMUST00000180734 2317 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hmgn5Q9JL35 Tspan13-201ENSMUST00000020896 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hmgn5Q9JL35 Daam2-202ENSMUST00000224595 1926 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Hmgn5Q9JL35 Samd5-201ENSMUST00000100070 6818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hmgn5Q9JL35 Rhog-202ENSMUST00000106923 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hmgn5Q9JL35 Polrmt-201ENSMUST00000020580 3755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hmgn5Q9JL35 Fen1-203ENSMUST00000142241 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hmgn5Q9JL35 Adcy9-201ENSMUST00000005719 4457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hmgn5Q9JL35 Rxfp3-201ENSMUST00000058007 4275 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hmgn5Q9JL35 Hnrnpr-201ENSMUST00000084219 2647 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hmgn5Q9JL35 Creb3l2-201ENSMUST00000041093 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hmgn5Q9JL35 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hmgn5Q9JL35 Mafk-202ENSMUST00000110836 3097 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hmgn5Q9JL35 Ddah1-201ENSMUST00000029845 3764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hmgn5Q9JL35 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hmgn5Q9JL35 Grsf1-202ENSMUST00000113234 2286 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hmgn5Q9JL35 Ajuba-201ENSMUST00000054487 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hmgn5Q9JL35 Gm37105-201ENSMUST00000192251 2085 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Hmgn5Q9JL35 Pabpc2-201ENSMUST00000063219 2586 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hmgn5Q9JL35 AC166574.4-201ENSMUST00000227165 1937 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Hmgn5Q9JL35 Dstyk-201ENSMUST00000045110 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hmgn5Q9JL35 AC149222.1-201ENSMUST00000154987 5188 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hmgn5Q9JL35 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Hmgn5Q9JL35 Otop1-201ENSMUST00000063136 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hmgn5Q9JL35 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hmgn5Q9JL35 Rasgrp2-207ENSMUST00000113475 573 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hmgn5Q9JL35 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hmgn5Q9JL35 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Hmgn5Q9JL35 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hmgn5Q9JL35 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hmgn5Q9JL35 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hmgn5Q9JL35 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Hmgn5Q9JL35 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hmgn5Q9JL35 AC134335.2-201ENSMUST00000227660 440 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Hmgn5Q9JL35 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hmgn5Q9JL35 Podn-202ENSMUST00000106708 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hmgn5Q9JL35 Stx17-201ENSMUST00000064765 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hmgn5Q9JL35 Dgcr2-203ENSMUST00000117082 2987 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hmgn5Q9JL35 Hars2-201ENSMUST00000019287 2002 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hmgn5Q9JL35 Eogt-201ENSMUST00000054344 4424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hmgn5Q9JL35 F830212C03Rik-201ENSMUST00000191701 2285 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Hmgn5Q9JL35 Mid1-215ENSMUST00000171433 2546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hmgn5Q9JL35 Sec23b-201ENSMUST00000028916 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hmgn5Q9JL35 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hmgn5Q9JL35 Prx-204ENSMUST00000125990 4298 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hmgn5Q9JL35 Pepd-201ENSMUST00000075068 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hmgn5Q9JL35 Cacna1g-205ENSMUST00000107786 7984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hmgn5Q9JL35 Qrich2-201ENSMUST00000093909 2156 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Hmgn5Q9JL35 Tanc2-202ENSMUST00000100330 11855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Hmgn5Q9JL35 Kif3b-201ENSMUST00000028977 5635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Hmgn5Q9JL35 Trim9-209ENSMUST00000222316 3049 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Hmgn5Q9JL35 Bmp2-201ENSMUST00000028836 3555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Hmgn5Q9JL35 Rassf8-201ENSMUST00000032388 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Hmgn5Q9JL35 Gm7104-201ENSMUST00000179741 2532 ntBASIC14.58□□□□□ -0.07
Hmgn5Q9JL35 Tcea1-201ENSMUST00000081551 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
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