Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKP8

Chrac1, Chromatin accessibility complex protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chrac1Q9JKP8 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Chrac1Q9JKP8 Mpv17-209ENSMUST00000202241 903 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Chrac1Q9JKP8 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Chrac1Q9JKP8 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Chrac1Q9JKP8 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Chrac1Q9JKP8 Leap2-201ENSMUST00000036045 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Chrac1Q9JKP8 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Chrac1Q9JKP8 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Chrac1Q9JKP8 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Chrac1Q9JKP8 Arid3a-201ENSMUST00000019708 5361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Chrac1Q9JKP8 Wdcp-205ENSMUST00000220215 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Chrac1Q9JKP8 Megf6-201ENSMUST00000030897 6851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Chrac1Q9JKP8 A530016L24Rik-201ENSMUST00000057465 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Chrac1Q9JKP8 Kif2c-201ENSMUST00000065896 2842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Chrac1Q9JKP8 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Chrac1Q9JKP8 Nsmce2-202ENSMUST00000168722 2679 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Chrac1Q9JKP8 Sema4a-202ENSMUST00000107531 2897 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Chrac1Q9JKP8 St6galnac6-202ENSMUST00000081879 2345 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Chrac1Q9JKP8 Gpa33-202ENSMUST00000060833 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Chrac1Q9JKP8 Klhl18-201ENSMUST00000068025 4530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Chrac1Q9JKP8 9230110C19Rik-201ENSMUST00000065291 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Chrac1Q9JKP8 Gm9951-202ENSMUST00000149618 1772 ntTSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Chrac1Q9JKP8 Cerk-203ENSMUST00000156546 2162 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Chrac1Q9JKP8 Dgcr2-203ENSMUST00000117082 2987 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Chrac1Q9JKP8 Limd2-201ENSMUST00000045923 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Chrac1Q9JKP8 Zbtb49-201ENSMUST00000094833 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Chrac1Q9JKP8 Yeats2-201ENSMUST00000090052 5997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Chrac1Q9JKP8 Mmp28-202ENSMUST00000103209 3438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Chrac1Q9JKP8 Cpn1-201ENSMUST00000026210 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Chrac1Q9JKP8 Mgll-201ENSMUST00000089449 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Chrac1Q9JKP8 Nfe2l1-210ENSMUST00000167110 3547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Chrac1Q9JKP8 Gm10040-201ENSMUST00000080726 1662 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Chrac1Q9JKP8 March7-203ENSMUST00000102748 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Chrac1Q9JKP8 BC030867-201ENSMUST00000100392 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Chrac1Q9JKP8 Mdga1-201ENSMUST00000073556 7566 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Chrac1Q9JKP8 Slc35d1-203ENSMUST00000150285 4242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Chrac1Q9JKP8 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Chrac1Q9JKP8 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Chrac1Q9JKP8 Gm11524-201ENSMUST00000119349 807 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Chrac1Q9JKP8 Ecscr-204ENSMUST00000133064 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Chrac1Q9JKP8 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Chrac1Q9JKP8 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Chrac1Q9JKP8 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Chrac1Q9JKP8 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Chrac1Q9JKP8 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Chrac1Q9JKP8 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Chrac1Q9JKP8 Ecscr-201ENSMUST00000097618 1114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Chrac1Q9JKP8 Gm18263-201ENSMUST00000220846 1928 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Chrac1Q9JKP8 Ehbp1l1-201ENSMUST00000049295 6404 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Chrac1Q9JKP8 Zfp433-202ENSMUST00000200889 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Chrac1Q9JKP8 Gm32687-201ENSMUST00000220314 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Chrac1Q9JKP8 Cfap69-201ENSMUST00000054865 4956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Chrac1Q9JKP8 Zfp82-201ENSMUST00000080834 2181 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Chrac1Q9JKP8 Il7-205ENSMUST00000194279 4858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Chrac1Q9JKP8 Dctn2-201ENSMUST00000026479 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Chrac1Q9JKP8 Nde1-203ENSMUST00000117958 1551 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Chrac1Q9JKP8 Chrnd-201ENSMUST00000073252 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Chrac1Q9JKP8 Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Chrac1Q9JKP8 Gm7104-201ENSMUST00000179741 2532 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Chrac1Q9JKP8 Tceanc2-202ENSMUST00000057043 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Chrac1Q9JKP8 Nrxn1-202ENSMUST00000072671 8118 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Chrac1Q9JKP8 Camsap3-203ENSMUST00000207077 3832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Chrac1Q9JKP8 Tmem115-201ENSMUST00000010189 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Chrac1Q9JKP8 Tppp-201ENSMUST00000022057 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Chrac1Q9JKP8 Gcdh-201ENSMUST00000003907 2167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Chrac1Q9JKP8 Fam171a1-201ENSMUST00000062934 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Chrac1Q9JKP8 Tmem201-203ENSMUST00000105687 3697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Chrac1Q9JKP8 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Chrac1Q9JKP8 Tada3-202ENSMUST00000043333 1708 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Chrac1Q9JKP8 Grk4-202ENSMUST00000074651 3234 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Chrac1Q9JKP8 Vldlr-207ENSMUST00000167487 7971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Chrac1Q9JKP8 Arhgap12-211ENSMUST00000182383 2500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Chrac1Q9JKP8 Gm44094-201ENSMUST00000204703 2030 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Chrac1Q9JKP8 Sgce-207ENSMUST00000126151 1522 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Chrac1Q9JKP8 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Chrac1Q9JKP8 C430049B03Rik-201ENSMUST00000129764 868 ntTSL 3 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Chrac1Q9JKP8 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Chrac1Q9JKP8 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Chrac1Q9JKP8 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Chrac1Q9JKP8 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Chrac1Q9JKP8 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Chrac1Q9JKP8 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Chrac1Q9JKP8 AC159195.1-201ENSMUST00000225867 2086 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Chrac1Q9JKP8 Chrna9-201ENSMUST00000031108 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Chrac1Q9JKP8 Sqle-202ENSMUST00000100640 2636 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Chrac1Q9JKP8 Ttc17-202ENSMUST00000094801 3408 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Chrac1Q9JKP8 Unc45bos-201ENSMUST00000156395 1306 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Chrac1Q9JKP8 Rgs20-202ENSMUST00000118000 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Chrac1Q9JKP8 Zfp961-202ENSMUST00000131237 2689 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Chrac1Q9JKP8 Gm43051-201ENSMUST00000201096 2678 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Chrac1Q9JKP8 Gm11725-201ENSMUST00000125607 1850 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Chrac1Q9JKP8 Setdb2-205ENSMUST00000161459 2995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Chrac1Q9JKP8 Gm12280-201ENSMUST00000155836 1624 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Chrac1Q9JKP8 Gm36500-201ENSMUST00000221821 1626 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Chrac1Q9JKP8 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Chrac1Q9JKP8 Car10-201ENSMUST00000042943 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Chrac1Q9JKP8 Map3k11-201ENSMUST00000004156 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Chrac1Q9JKP8 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Chrac1Q9JKP8 Atg7-210ENSMUST00000182793 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Chrac1Q9JKP8 Gtf2ird1-202ENSMUST00000074114 3330 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.2 ms