Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKE2

Trem1, Triggering receptor expressed on myeloid cells 1, mousemouse

Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trem1Q9JKE2 Plcb1-202ENSMUST00000110116 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Trem1Q9JKE2 Pcnt-202ENSMUST00000217838 9341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Trem1Q9JKE2 Grip2-201ENSMUST00000159684 3006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Trem1Q9JKE2 Idi1-201ENSMUST00000169314 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Trem1Q9JKE2 Cxcl12-203ENSMUST00000112871 3132 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Trem1Q9JKE2 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Trem1Q9JKE2 Pde1c-201ENSMUST00000044505 3907 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Trem1Q9JKE2 Tbc1d1-202ENSMUST00000101195 5432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Trem1Q9JKE2 4931428F04Rik-201ENSMUST00000014981 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Trem1Q9JKE2 Tmem104-202ENSMUST00000100235 4561 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Trem1Q9JKE2 Setdb1-203ENSMUST00000107171 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Trem1Q9JKE2 Tmem104-201ENSMUST00000061450 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Trem1Q9JKE2 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Trem1Q9JKE2 Hsd3b6-201ENSMUST00000029463 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Trem1Q9JKE2 Slc10a6-201ENSMUST00000031263 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Trem1Q9JKE2 Maob-201ENSMUST00000040820 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Trem1Q9JKE2 Gjb2-201ENSMUST00000055698 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Trem1Q9JKE2 Gatad2a-201ENSMUST00000065169 3812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Trem1Q9JKE2 Dysf-205ENSMUST00000113823 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Trem1Q9JKE2 6030458C11Rik-201ENSMUST00000057256 3966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Trem1Q9JKE2 Dcun1d3-202ENSMUST00000098080 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Trem1Q9JKE2 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Trem1Q9JKE2 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Trem1Q9JKE2 Syt16-203ENSMUST00000221220 8156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Trem1Q9JKE2 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Trem1Q9JKE2 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Trem1Q9JKE2 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Trem1Q9JKE2 Tmem47-201ENSMUST00000026760 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Trem1Q9JKE2 Dlgap1-210ENSMUST00000146730 3936 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Trem1Q9JKE2 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Trem1Q9JKE2 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Trem1Q9JKE2 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Trem1Q9JKE2 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Trem1Q9JKE2 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Trem1Q9JKE2 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Trem1Q9JKE2 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Trem1Q9JKE2 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Trem1Q9JKE2 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Trem1Q9JKE2 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Trem1Q9JKE2 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Trem1Q9JKE2 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Trem1Q9JKE2 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Trem1Q9JKE2 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Trem1Q9JKE2 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Trem1Q9JKE2 Gfra1-209ENSMUST00000169850 3224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Trem1Q9JKE2 Sall4-201ENSMUST00000029061 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Trem1Q9JKE2 Glp2r-202ENSMUST00000051765 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Trem1Q9JKE2 4930581F22Rik-201ENSMUST00000093873 2402 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Trem1Q9JKE2 Gm26519-201ENSMUST00000181193 2249 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Trem1Q9JKE2 Thoc5-201ENSMUST00000038237 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Trem1Q9JKE2 Olfr239-202ENSMUST00000213731 3690 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Trem1Q9JKE2 Gm37613-201ENSMUST00000195677 3580 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Trem1Q9JKE2 Dcaf4-201ENSMUST00000021645 2008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Trem1Q9JKE2 Miga2-201ENSMUST00000077977 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Trem1Q9JKE2 Knop1-206ENSMUST00000126792 3253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Trem1Q9JKE2 Usp5-202ENSMUST00000122110 3076 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Trem1Q9JKE2 Ahdc1-203ENSMUST00000105915 6341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Trem1Q9JKE2 Mfsd14b-203ENSMUST00000155487 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Trem1Q9JKE2 Zscan10-201ENSMUST00000095595 2698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Trem1Q9JKE2 Ap1g2-211ENSMUST00000170285 2596 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Trem1Q9JKE2 Atp9a-201ENSMUST00000029060 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Trem1Q9JKE2 Grm1-202ENSMUST00000105560 4265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Trem1Q9JKE2 AC156031.2-201ENSMUST00000213107 3310 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Trem1Q9JKE2 Ggnbp1-203ENSMUST00000133257 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Trem1Q9JKE2 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Trem1Q9JKE2 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Trem1Q9JKE2 Dnajc5-203ENSMUST00000108797 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Trem1Q9JKE2 Cenpl-202ENSMUST00000111618 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Trem1Q9JKE2 Vps29-208ENSMUST00000155671 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Trem1Q9JKE2 Epb41-208ENSMUST00000105981 5303 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Trem1Q9JKE2 Lrmp-201ENSMUST00000032396 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Trem1Q9JKE2 Prx-204ENSMUST00000125990 4298 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Trem1Q9JKE2 Dsp-201ENSMUST00000124830 9592 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Trem1Q9JKE2 Serhl-205ENSMUST00000166427 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Trem1Q9JKE2 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Trem1Q9JKE2 Psd-201ENSMUST00000041391 3900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Trem1Q9JKE2 Psd-202ENSMUST00000096029 3903 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Trem1Q9JKE2 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Trem1Q9JKE2 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Trem1Q9JKE2 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Trem1Q9JKE2 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Trem1Q9JKE2 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Trem1Q9JKE2 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Trem1Q9JKE2 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Trem1Q9JKE2 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Trem1Q9JKE2 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Trem1Q9JKE2 CT030704.2-201ENSMUST00000228887 494 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Trem1Q9JKE2 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Trem1Q9JKE2 Thg1l-201ENSMUST00000011398 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Trem1Q9JKE2 Eif4enif1-202ENSMUST00000110048 3712 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Trem1Q9JKE2 Ror2-202ENSMUST00000130235 3730 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Trem1Q9JKE2 Ttbk2-203ENSMUST00000085840 11152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Trem1Q9JKE2 Nbeal2-206ENSMUST00000133191 8782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Trem1Q9JKE2 Lamc3-201ENSMUST00000028187 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Trem1Q9JKE2 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Trem1Q9JKE2 Smpd3-201ENSMUST00000067512 5148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Trem1Q9JKE2 Spr-ps1-203ENSMUST00000187705 2892 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Trem1Q9JKE2 Ica1-204ENSMUST00000115520 1876 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Trem1Q9JKE2 Sufu-204ENSMUST00000120778 1850 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Trem1Q9JKE2 Prkar1a-201ENSMUST00000049527 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.9 ms