Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKA5

Gpa33, Cell surface A33 antigen, mousemouse

Predictions only

Length 319 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpa33Q9JKA5 Slc25a25-201ENSMUST00000028160 3294 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gpa33Q9JKA5 B230369F24Rik-201ENSMUST00000141846 2560 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gpa33Q9JKA5 Pla2g15-204ENSMUST00000212963 2578 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gpa33Q9JKA5 Gm45332-201ENSMUST00000210508 1949 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gpa33Q9JKA5 Gm34006-202ENSMUST00000216467 1918 ntTSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gpa33Q9JKA5 Add2-202ENSMUST00000203196 1970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gpa33Q9JKA5 Atp6v1b1-201ENSMUST00000006431 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gpa33Q9JKA5 Terf2ip-201ENSMUST00000052138 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gpa33Q9JKA5 Rbbp5-207ENSMUST00000190997 2856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gpa33Q9JKA5 1110032A03Rik-201ENSMUST00000042468 2082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gpa33Q9JKA5 Kcnt1-211ENSMUST00000171268 3771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gpa33Q9JKA5 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gpa33Q9JKA5 Cd63-202ENSMUST00000105229 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gpa33Q9JKA5 Rab15-204ENSMUST00000122419 856 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gpa33Q9JKA5 1700061E18Rik-201ENSMUST00000154159 588 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gpa33Q9JKA5 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gpa33Q9JKA5 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gpa33Q9JKA5 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gpa33Q9JKA5 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Gpa33Q9JKA5 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gpa33Q9JKA5 1810059H22Rik-208ENSMUST00000204941 642 ntTSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gpa33Q9JKA5 Cd63-204ENSMUST00000219317 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gpa33Q9JKA5 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Gpa33Q9JKA5 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gpa33Q9JKA5 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gpa33Q9JKA5 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gpa33Q9JKA5 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gpa33Q9JKA5 Zfp248-205ENSMUST00000161519 2243 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gpa33Q9JKA5 Slc7a11-205ENSMUST00000194462 2419 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gpa33Q9JKA5 C1qtnf6-201ENSMUST00000023075 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gpa33Q9JKA5 Klk2-ps-202ENSMUST00000206865 2684 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gpa33Q9JKA5 Wdr25-206ENSMUST00000221510 1600 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gpa33Q9JKA5 Trp53i11-202ENSMUST00000111266 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gpa33Q9JKA5 Sfxn3-202ENSMUST00000084493 2843 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gpa33Q9JKA5 Pcid2-201ENSMUST00000164416 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gpa33Q9JKA5 Sh3pxd2a-202ENSMUST00000111800 10380 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gpa33Q9JKA5 Trim23-201ENSMUST00000022225 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gpa33Q9JKA5 Gm5989-201ENSMUST00000096092 2077 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Gpa33Q9JKA5 Phrf1-202ENSMUST00000122143 4864 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gpa33Q9JKA5 Naaa-201ENSMUST00000113102 2414 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gpa33Q9JKA5 Mid1-215ENSMUST00000171433 2546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gpa33Q9JKA5 Fgd2-201ENSMUST00000024810 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gpa33Q9JKA5 Arnt-203ENSMUST00000102749 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gpa33Q9JKA5 Cpt1c-206ENSMUST00000212836 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gpa33Q9JKA5 Pygm-201ENSMUST00000035269 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gpa33Q9JKA5 Ficd-201ENSMUST00000065698 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gpa33Q9JKA5 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gpa33Q9JKA5 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gpa33Q9JKA5 Gm13886-201ENSMUST00000117876 1183 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Gpa33Q9JKA5 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Gpa33Q9JKA5 Gm15966-201ENSMUST00000136853 480 ntTSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gpa33Q9JKA5 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gpa33Q9JKA5 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gpa33Q9JKA5 Gm28631-201ENSMUST00000190740 334 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Gpa33Q9JKA5 Gm42839-201ENSMUST00000198978 525 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gpa33Q9JKA5 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Gpa33Q9JKA5 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gpa33Q9JKA5 AC140375.2-201ENSMUST00000225283 584 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Gpa33Q9JKA5 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Gpa33Q9JKA5 Mcrip1-201ENSMUST00000034913 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gpa33Q9JKA5 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gpa33Q9JKA5 Washc5-201ENSMUST00000022976 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gpa33Q9JKA5 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Gpa33Q9JKA5 Zc3h6-202ENSMUST00000110320 4916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Gpa33Q9JKA5 Car3-201ENSMUST00000029076 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Gpa33Q9JKA5 Col8a1-201ENSMUST00000089332 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Gpa33Q9JKA5 Calr3-201ENSMUST00000019876 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Gpa33Q9JKA5 Tbc1d1-204ENSMUST00000121370 5419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Gpa33Q9JKA5 Csrnp3-202ENSMUST00000112394 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Gpa33Q9JKA5 Myo18a-210ENSMUST00000130305 5450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Gpa33Q9JKA5 Dlc1-201ENSMUST00000033923 6159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Gpa33Q9JKA5 Gm37105-201ENSMUST00000192251 2085 ntBASIC10.46□□□□□ -0.74
Gpa33Q9JKA5 Bcat2-203ENSMUST00000209204 2081 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Gpa33Q9JKA5 Nelfcd-202ENSMUST00000109075 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Gpa33Q9JKA5 Cacna1c-227ENSMUST00000220022 7765 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Gpa33Q9JKA5 Cul9-204ENSMUST00000182485 7848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Gpa33Q9JKA5 Ctbs-201ENSMUST00000029840 2629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Gpa33Q9JKA5 Arfip1-201ENSMUST00000098990 2799 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Gpa33Q9JKA5 Calcoco1-201ENSMUST00000023818 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Gpa33Q9JKA5 A630014C17Rik-201ENSMUST00000150973 2984 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Gpa33Q9JKA5 Slc25a25-205ENSMUST00000113310 3278 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Gpa33Q9JKA5 Gart-201ENSMUST00000023684 3518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Gpa33Q9JKA5 Pphln1-202ENSMUST00000068457 3816 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Gpa33Q9JKA5 Cacna2d1-203ENSMUST00000101581 3879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Gpa33Q9JKA5 Cacna2d1-206ENSMUST00000180204 3882 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Gpa33Q9JKA5 Cog1-201ENSMUST00000018805 3935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Gpa33Q9JKA5 Prr12-201ENSMUST00000057293 7023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gpa33Q9JKA5 Dip2a-202ENSMUST00000105417 6383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gpa33Q9JKA5 Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gpa33Q9JKA5 Rabepk-207ENSMUST00000145903 2968 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gpa33Q9JKA5 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gpa33Q9JKA5 Rpl9-204ENSMUST00000127874 2690 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gpa33Q9JKA5 Patj-201ENSMUST00000030290 2495 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gpa33Q9JKA5 Zfp125-201ENSMUST00000079237 2488 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Gpa33Q9JKA5 Dtnb-201ENSMUST00000077930 2376 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gpa33Q9JKA5 Kcnb1-204ENSMUST00000207917 11153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gpa33Q9JKA5 Otx2-201ENSMUST00000118578 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gpa33Q9JKA5 Dstyk-201ENSMUST00000045110 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gpa33Q9JKA5 Pglyrp2-202ENSMUST00000170392 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gpa33Q9JKA5 Gnb4-205ENSMUST00000155737 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms