Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCT2

Ndufs3, NADH dehydrogenase [ubiquinone] iron-sulfur protein 3, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 263 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndufs3Q9DCT2 Asap1-201ENSMUST00000023008 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ndufs3Q9DCT2 Krba1-202ENSMUST00000077093 8380 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ndufs3Q9DCT2 Gas8-201ENSMUST00000093043 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ndufs3Q9DCT2 Cog1-201ENSMUST00000018805 3935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ndufs3Q9DCT2 Vps29-208ENSMUST00000155671 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ndufs3Q9DCT2 Myh6-205ENSMUST00000226297 6008 ntAPPRIS P1 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ndufs3Q9DCT2 Stx17-201ENSMUST00000064765 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ndufs3Q9DCT2 Erg-201ENSMUST00000077773 2232 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ndufs3Q9DCT2 Lmf2-201ENSMUST00000023283 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ndufs3Q9DCT2 Rbm11-203ENSMUST00000114253 2699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ndufs3Q9DCT2 Slc6a18-210ENSMUST00000223074 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ndufs3Q9DCT2 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ndufs3Q9DCT2 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ndufs3Q9DCT2 Apoc3-203ENSMUST00000121916 709 ntTSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ndufs3Q9DCT2 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ndufs3Q9DCT2 Gm37047-201ENSMUST00000191992 533 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ndufs3Q9DCT2 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ndufs3Q9DCT2 AC135669.1-202ENSMUST00000216742 540 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Ndufs3Q9DCT2 AC125117.1-201ENSMUST00000228121 468 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Ndufs3Q9DCT2 Gm16372-201ENSMUST00000073088 450 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Ndufs3Q9DCT2 Fars2-202ENSMUST00000099582 962 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ndufs3Q9DCT2 Samd5-201ENSMUST00000100070 6818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ndufs3Q9DCT2 Pnpla6-211ENSMUST00000207941 4263 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ndufs3Q9DCT2 Camsap3-202ENSMUST00000171962 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ndufs3Q9DCT2 Muc6-202ENSMUST00000189314 5087 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ndufs3Q9DCT2 Zfp618-202ENSMUST00000064814 2868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ndufs3Q9DCT2 Ebf1-202ENSMUST00000101326 3422 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ndufs3Q9DCT2 Ttc23l-201ENSMUST00000022857 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ndufs3Q9DCT2 Ctgf-203ENSMUST00000176228 2490 ntTSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ndufs3Q9DCT2 Cacna2d1-201ENSMUST00000039370 3933 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ndufs3Q9DCT2 Senp5-201ENSMUST00000023457 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ndufs3Q9DCT2 Cacna1c-201ENSMUST00000075591 7584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ndufs3Q9DCT2 Pcnx-201ENSMUST00000021567 12139 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ndufs3Q9DCT2 Pprc1-201ENSMUST00000062322 5205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ndufs3Q9DCT2 Gm20683-201ENSMUST00000176751 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ndufs3Q9DCT2 Sirt4-201ENSMUST00000112066 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ndufs3Q9DCT2 Gm26651-201ENSMUST00000181851 2325 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Ndufs3Q9DCT2 Dgcr8-202ENSMUST00000115633 4522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Ndufs3Q9DCT2 Ccr7-201ENSMUST00000103134 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Ndufs3Q9DCT2 Rgs12-201ENSMUST00000030984 5472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Ndufs3Q9DCT2 Spry2-201ENSMUST00000022709 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Ndufs3Q9DCT2 Reln-207ENSMUST00000161356 11699 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Ndufs3Q9DCT2 Fgfr3-211ENSMUST00000171509 4020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Ndufs3Q9DCT2 Unc13a-201ENSMUST00000030170 10255 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Ndufs3Q9DCT2 Gm14703-201ENSMUST00000145894 1820 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Ndufs3Q9DCT2 Afap1l1-201ENSMUST00000120472 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Ndufs3Q9DCT2 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Ndufs3Q9DCT2 Gm16202-201ENSMUST00000117532 544 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Ndufs3Q9DCT2 Gm5687-201ENSMUST00000118252 640 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Ndufs3Q9DCT2 Gm6152-201ENSMUST00000151704 340 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Ndufs3Q9DCT2 Gm6460-202ENSMUST00000163787 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Ndufs3Q9DCT2 Gm8879-201ENSMUST00000170260 1125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Ndufs3Q9DCT2 4933402N22Rik-202ENSMUST00000170301 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Ndufs3Q9DCT2 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Ndufs3Q9DCT2 Gm18018-201ENSMUST00000198273 408 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Ndufs3Q9DCT2 Trmt112-ps1-201ENSMUST00000202320 375 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Ndufs3Q9DCT2 Blvra-201ENSMUST00000002064 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Ndufs3Q9DCT2 AC155252.1-201ENSMUST00000226462 1208 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Ndufs3Q9DCT2 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Ndufs3Q9DCT2 Lyzl4-201ENSMUST00000077706 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Ndufs3Q9DCT2 9930014A18Rik-201ENSMUST00000180730 3074 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Ndufs3Q9DCT2 Tspyl3-201ENSMUST00000099194 3072 ntAPPRIS P1 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Ndufs3Q9DCT2 Prok2-203ENSMUST00000101120 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Ndufs3Q9DCT2 Cbl-206ENSMUST00000206147 3452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Ndufs3Q9DCT2 Gpd1l-202ENSMUST00000129305 2543 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Ndufs3Q9DCT2 AC121805.2-201ENSMUST00000218808 2538 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Ndufs3Q9DCT2 Gm8798-201ENSMUST00000211877 1661 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Ndufs3Q9DCT2 Sdad1-201ENSMUST00000031364 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Ndufs3Q9DCT2 Zbtb16-201ENSMUST00000093852 5114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Ndufs3Q9DCT2 Rnps1-201ENSMUST00000088512 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Ndufs3Q9DCT2 Saraf-201ENSMUST00000033933 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Ndufs3Q9DCT2 Pianp-207ENSMUST00000162170 2053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Ndufs3Q9DCT2 Cd34-202ENSMUST00000110815 2554 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Ndufs3Q9DCT2 Vmn1r65-201ENSMUST00000086338 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Ndufs3Q9DCT2 Sec23b-201ENSMUST00000028916 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Ndufs3Q9DCT2 Lgals8-202ENSMUST00000099821 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Ndufs3Q9DCT2 Mpp3-204ENSMUST00000107168 3094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Ndufs3Q9DCT2 Fhl2-202ENSMUST00000185893 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Ndufs3Q9DCT2 Map3k2-201ENSMUST00000096575 10791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Ndufs3Q9DCT2 Bud13-201ENSMUST00000074957 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Ndufs3Q9DCT2 Ntrk2-208ENSMUST00000225583 2719 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
Ndufs3Q9DCT2 Llgl2-212ENSMUST00000177736 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Ndufs3Q9DCT2 Atp8a1-202ENSMUST00000072971 7154 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Ndufs3Q9DCT2 Ebna1bp2-201ENSMUST00000030501 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Ndufs3Q9DCT2 Rai1-203ENSMUST00000102688 6921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Ndufs3Q9DCT2 Abo-201ENSMUST00000102900 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Ndufs3Q9DCT2 Ppip5k1-202ENSMUST00000110625 5226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Ndufs3Q9DCT2 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Ndufs3Q9DCT2 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Ndufs3Q9DCT2 Gm12928-201ENSMUST00000117115 573 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
Ndufs3Q9DCT2 Gm12091-201ENSMUST00000146791 830 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
Ndufs3Q9DCT2 Egfl7-208ENSMUST00000149789 683 ntTSL 3 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Ndufs3Q9DCT2 Glo1-202ENSMUST00000167624 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Ndufs3Q9DCT2 Gm17634-201ENSMUST00000181383 1285 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Ndufs3Q9DCT2 1700072B07Rik-201ENSMUST00000191141 445 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Ndufs3Q9DCT2 Il13-201ENSMUST00000020650 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Ndufs3Q9DCT2 Cyct-201ENSMUST00000028430 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Ndufs3Q9DCT2 Txn1-201ENSMUST00000030051 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Ndufs3Q9DCT2 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Ndufs3Q9DCT2 Hnrnpk-232ENSMUST00000225674 2704 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms