Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBZ9

Syde1, Rho GTPase-activating protein SYDE1, mousemouse

Predictions only

Length 737 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syde1Q9DBZ9 Fam71e1-201ENSMUST00000107927 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Syde1Q9DBZ9 Rbm3-204ENSMUST00000115617 1152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Syde1Q9DBZ9 Gm14726-201ENSMUST00000120623 896 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Syde1Q9DBZ9 Ftl1-ps2-201ENSMUST00000169477 549 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Syde1Q9DBZ9 Crb3-205ENSMUST00000169543 778 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Syde1Q9DBZ9 Gm2310-201ENSMUST00000179217 1131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Syde1Q9DBZ9 1700034G24Rik-202ENSMUST00000183186 1081 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Syde1Q9DBZ9 Gm5896-201ENSMUST00000189662 1024 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Syde1Q9DBZ9 Gm37042-201ENSMUST00000193816 581 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Syde1Q9DBZ9 Gm45339-201ENSMUST00000210823 877 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Syde1Q9DBZ9 Caly-204ENSMUST00000211283 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Syde1Q9DBZ9 Gm18041-201ENSMUST00000218210 618 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Syde1Q9DBZ9 CT030182.1-201ENSMUST00000225935 533 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Syde1Q9DBZ9 Rhox2a-201ENSMUST00000063340 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Syde1Q9DBZ9 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Syde1Q9DBZ9 Prickle3-201ENSMUST00000033485 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Syde1Q9DBZ9 Gm15897-201ENSMUST00000117770 1486 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Syde1Q9DBZ9 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Syde1Q9DBZ9 Prss42-201ENSMUST00000035715 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Syde1Q9DBZ9 Gm43134-201ENSMUST00000199434 1886 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Syde1Q9DBZ9 Scyl3-201ENSMUST00000027876 4368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Syde1Q9DBZ9 Gm44579-201ENSMUST00000142443 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Syde1Q9DBZ9 Islr-202ENSMUST00000168864 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Syde1Q9DBZ9 Frmpd4-204ENSMUST00000112149 8456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Syde1Q9DBZ9 Dnajb4-204ENSMUST00000144950 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Syde1Q9DBZ9 Enc1-201ENSMUST00000041623 4737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Syde1Q9DBZ9 Atxn2l-201ENSMUST00000040202 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
Syde1Q9DBZ9 Tshr-201ENSMUST00000021343 1339 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Syde1Q9DBZ9 Glod4-201ENSMUST00000017430 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Syde1Q9DBZ9 Cd81-201ENSMUST00000037941 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Syde1Q9DBZ9 Plekhb1-203ENSMUST00000107044 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Syde1Q9DBZ9 AC087890.1-201ENSMUST00000219321 1823 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Syde1Q9DBZ9 Erg-203ENSMUST00000113848 2139 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Syde1Q9DBZ9 Tmem2-202ENSMUST00000096194 6667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Syde1Q9DBZ9 4930581F22Rik-201ENSMUST00000093873 2402 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Syde1Q9DBZ9 Miat-205ENSMUST00000182953 9163 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Syde1Q9DBZ9 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Syde1Q9DBZ9 Sgsm3-208ENSMUST00000139517 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Syde1Q9DBZ9 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Syde1Q9DBZ9 5330426L24Rik-201ENSMUST00000200008 2175 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Syde1Q9DBZ9 Gm45003-201ENSMUST00000205875 2158 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Syde1Q9DBZ9 Leo1-201ENSMUST00000048937 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Syde1Q9DBZ9 Evl-203ENSMUST00000109854 1870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Syde1Q9DBZ9 Luc7l3-209ENSMUST00000166312 5244 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Syde1Q9DBZ9 Fam118b-202ENSMUST00000063782 1662 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Syde1Q9DBZ9 Chodl-203ENSMUST00000114216 1550 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Syde1Q9DBZ9 0610037L13Rik-207ENSMUST00000125107 1551 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Syde1Q9DBZ9 E130114P18Rik-202ENSMUST00000107068 1132 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Syde1Q9DBZ9 Etfrf1-202ENSMUST00000111719 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Syde1Q9DBZ9 Gm14019-201ENSMUST00000131514 403 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Syde1Q9DBZ9 Cabp2-201ENSMUST00000159148 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Syde1Q9DBZ9 Rims3-204ENSMUST00000171363 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Syde1Q9DBZ9 Gm16505-201ENSMUST00000179981 232 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Syde1Q9DBZ9 Anapc16-205ENSMUST00000182912 566 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Syde1Q9DBZ9 Rps4l-202ENSMUST00000204242 789 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Syde1Q9DBZ9 Mt3-203ENSMUST00000211930 477 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Syde1Q9DBZ9 Ctrb1-201ENSMUST00000034435 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Syde1Q9DBZ9 Olfr1368-201ENSMUST00000055298 1064 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Syde1Q9DBZ9 Twf1-201ENSMUST00000023087 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Syde1Q9DBZ9 D430041D05Rik-201ENSMUST00000089726 10124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Syde1Q9DBZ9 Smarcd2-203ENSMUST00000106843 2548 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Syde1Q9DBZ9 Blzf1-203ENSMUST00000120447 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Syde1Q9DBZ9 Rad54b-202ENSMUST00000095145 2403 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Syde1Q9DBZ9 Rgs16-201ENSMUST00000027748 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Syde1Q9DBZ9 Pomgnt1-201ENSMUST00000106494 2226 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Syde1Q9DBZ9 Sgo2a-201ENSMUST00000027202 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Syde1Q9DBZ9 Pax7-202ENSMUST00000174681 1725 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Syde1Q9DBZ9 Mettl17-201ENSMUST00000047899 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Syde1Q9DBZ9 B430305J03Rik-201ENSMUST00000066298 3702 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Syde1Q9DBZ9 Slc19a2-202ENSMUST00000159230 3432 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Syde1Q9DBZ9 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Syde1Q9DBZ9 Brms1-201ENSMUST00000116567 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Syde1Q9DBZ9 Sh2d7-202ENSMUST00000118413 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Syde1Q9DBZ9 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Syde1Q9DBZ9 Ppp2r5c-204ENSMUST00000221074 1971 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Syde1Q9DBZ9 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Syde1Q9DBZ9 Fbxl12-207ENSMUST00000151861 1668 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Syde1Q9DBZ9 Tufm-201ENSMUST00000098048 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Syde1Q9DBZ9 B230209E15Rik-201ENSMUST00000209115 1597 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Syde1Q9DBZ9 Rfx7-203ENSMUST00000183372 1457 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Syde1Q9DBZ9 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Syde1Q9DBZ9 Jph2-201ENSMUST00000017961 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Syde1Q9DBZ9 Gm37437-201ENSMUST00000194451 1937 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Syde1Q9DBZ9 Lmf2-201ENSMUST00000023283 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Syde1Q9DBZ9 Scg3-201ENSMUST00000034699 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Syde1Q9DBZ9 Galnt17-201ENSMUST00000086023 8040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Syde1Q9DBZ9 Hlcs-202ENSMUST00000163193 5371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Syde1Q9DBZ9 Gm2606-201ENSMUST00000100754 1002 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Syde1Q9DBZ9 Rpl15-203ENSMUST00000100799 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Syde1Q9DBZ9 Gm24830-201ENSMUST00000102024 166 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Syde1Q9DBZ9 Thoc6-203ENSMUST00000115489 1083 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Syde1Q9DBZ9 Gm13316-201ENSMUST00000140537 691 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Syde1Q9DBZ9 Usp46os2-201ENSMUST00000152787 831 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Syde1Q9DBZ9 Gm25890-201ENSMUST00000177643 165 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Syde1Q9DBZ9 Rnu1b2-201ENSMUST00000178073 165 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Syde1Q9DBZ9 Rnu1b1-201ENSMUST00000178250 165 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Syde1Q9DBZ9 Gm22614-201ENSMUST00000178300 165 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Syde1Q9DBZ9 Gm29585-203ENSMUST00000188089 835 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Syde1Q9DBZ9 Gm42797-201ENSMUST00000197573 494 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Syde1Q9DBZ9 Tmem176b-209ENSMUST00000204073 986 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms